Molekyylien uudelleenluokittelu kliinisesti hyödyllisten biomarkkerien löytämiseksi systeemisille autoimmuunisairauksille: Aloituskohortti (PRECISESADSI)
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
PRECISESADS IMI -projektin yleisenä tavoitteena on luokitella SAD:ista kärsivät yksilöt uudelleen molekyyliryhmiksi kliinisten kokonaisuuksien sijaan määrittämällä molekyyliprofiilit useilla "-omics"-tekniikoilla.
Klusterien tunnistaminen perustuu poikkileikkauskohorttiin/protokollaan, johon rekrytoidaan 2666 henkilöä (2000 potilasta ja 666 kontrollia), mukaan lukien 288 syvästi karakterisoidun yksilön alatutkimus (240 potilasta ja 48 kontrollia).
Samanaikaisesti käynnistetään pitkittäinen aloituskohortti/protokolla, jotta voidaan tutkia tarkemmin tunnistettujen klustereiden kliinistä merkitystä ja niiden kehitystä ajan myötä.
CS-tutkimuksen ja osatutkimuksen tavoitteet ovat:
- Tunnistaa systeeminen taksonomia SAD-potilaille tuottamalla seuraavat tiedot henkilöistä, joilla on SAD:t ja kontrollit: geneettinen, epigenominen, transkriptominen, virtaussytometrinen (perifeerisen veren mononukleaarisista soluista (PBMC)), metabolomiikka ja proteominen plasmassa ja virtsassa, eksosomianalyysi , klassinen serologia (vasta-aineet ja autovasta-aineet) ja kliiniset tiedot.
- Yksittäisten SAD:ien kuvaamiseksi paremmin omiikkatasolla.
- Suorittaa klusterointianalyysejä yksilöiden ryhmien määrittämiseksi, joilla on muista ryhmistä poiketen yhteisiä molekyylipiirteitä (tarkkuuslääketiede).
- Syvällisempi analyysi tehdään 288 henkilön osatutkimuksessa.
Klusterointiprosessi tulee olemaan datavetoinen, ja tavoitteena on löytää mahdollisimman homogeeniset ja erilaistuneet sairausklusterit, jotka erottavat yksilöt selvästi kontrolleista ja muista potilasklustereista.
Aloituskohortin tavoitteet:
Tämän aloituskohortin tavoitteena on erityisesti:
- kohdistaa henkilöt, joilla on äskettäin diagnosoitu systeeminen autoimmuunisairaus (SAD), johonkin CS-tutkimuksessa löydetyistä uudelleenluokitusklustereista,
- tutkia OMICS-tunnisteiden/klusterien kehitystä ja muutoksia, joita esiintyy kussakin yksittäisessä potilaassa sairauden aikana, mukaan lukien hoidon vaikutus heidän yksilölliseen malliin, ja
- suorittaa perusteellisia OMIC-tutkimuksia vertaillakseen omia OMICS-malleja ryhmänä CS-kohortissa saatuihin malleihin.
Aloituskohortissa on potilasseuranta ja näytteenotto lähtötilanteessa, kuukaudessa 6 (± 1 kuukausi) ja kuukaudessa 18 (± 1 kuukausi).
Koska äskettäin diagnosoidut potilaat, jotka aiomme värvätä, saavat vähintään hoitoa tai ei lainkaan hoitoa, tunnistamme erot ja samankaltaisuudet poikkileikkaustutkimuksen potilaisiin, jotka ovat saaneet pitkäaikaista hoitoa.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Brussels, Belgia
- Université catholique de Louvain - Cliniques Universitaires Saint-Luc (UCL)
-
Leuven, Belgia
- UZ Leuven - KU Leuven, Department of Rheumatology (KU LEUVEN)
-
-
-
-
-
Barcelona, Espanja
- Hospital Clinic I Provicia- Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS)
-
Cordoba, Espanja
- Hospital Universitario Reina Sofía Andaluz de Salud
-
Granada, Espanja
- Hospital Universitario San Cecilio Servicio Andaluz de Salud
-
Granada, Espanja
- Hospital Virgen de las Nieves Granada
-
-
-
-
-
Milan, Italia
- Fondazione IRCCS Ca Granda Ospedale Maggiore Policlinico (IRCCS)
-
-
-
-
-
Brest, Ranska, 29609
- CHRU de Brest
-
-
-
-
-
Berlin, Saksa
- Deutsches Rheuma-Forschungszentrum Berlin (DRFZ)
-
-
-
-
-
Geneve, Sveitsi
- Hospitaux Universitaires de Géneve (UNIGE)
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
· Suostumushetkellä 18-vuotias tai vanhempi
Diagnosoitu vallitsevien kriteerien mukaan johonkin seuraavista systeemisistä autoimmuunisairauksista (katso liite 2)
- Nivelreuma (RA)
- Skleroderma tai systeeminen skleroosi (SSc)
- Primaarinen Sjögrenin oireyhtymä (SjS)
- Systeeminen lupus erythematosus (SLE)
- Primaarinen antifosfolipidioireyhtymä (PAPS)
- Sekoitettu sidekudostauti (MCTD)
- Potilaat, joilla on erilaistumaton sidekudossairaus (UCTD) yli vuoden ja jotka eivät täytä minkään edellä mainitun sairauden diagnoosia.
- Allekirjoittanut tietoisen suostumuslomakkeen
Poissulkemiskriteerit:
· Potilaita, jotka eivät ymmärrä protokollaan liittyviä toimenpiteitä, ei tulisi ottaa mukaan. Tutkimus on vapaaehtoinen ja potilaiden on voitava antaa tietoinen suostumuksensa.
- Raskaana olevat naiset
- Vastasyntyneen lupus
- Lääkkeiden aiheuttama lupus
- Potilaat, joiden tila on niin vakava, että he eivät voi osallistua tutkimukseen
- Vaikea nefroottinen oireyhtymä, jossa proteinuria >=3,5 g/vrk
- Potilaat, joilla on vakaa steroidiannos > 15 mg/vrk viimeisen 3 kuukauden ajan tai laskimonsisäisiä kortikosteroideja viimeisen 3 kuukauden aikana
Potilaat, jotka ovat saaneet immunosuppressantteja viimeisten 3 kuukauden aikana ennen värväystä:
- Metotreksaatti ≥ 25 mg/viikko
- Atsatiopriini ≥ 2,5 mg/kg/vrk
- Syklosporiini A > 3 mg/kg/vrk
- Mykofenolaattimofetiili > 2g/vrk
- Hoito syklofosfamidilla (mikä tahansa annos tai antotapa) tai belimumabilla viimeisen 6 kuukauden aikana
- Potilaat, jotka saavat kahden tai useamman immunosuppressantin yhdistelmähoitoa
- Potilaat, jotka ovat saaneet depletatiivista hoitoa, kuten rituksimabia viimeisen vuoden aikana
- Potilaat saavat kokeellisen
- Päällekkäisyysoireyhtymät
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Kohortti
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Geenien ilmentyminen kokonaisveressä
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Geeniekspressio suoritetaan käyttämällä kaupallisia geeniekspressiomikrosiruja kaikista näytteistä RNA Paxgene -putkea käyttämällä.
|
2 vuotta
|
|
Virtaussytometrinen analyysi solujen osuuden määrittämiseksi kaikkien yksilöiden veriseoksessa.
Aikaikkuna: 24 tuntia
|
Yhdeksää optimoitua vasta-ainepaneelia käytetään solualapopulaatioiden määrittämiseen ääreisveressä (mukaan lukien hyvin pienet solupopulaatiot).
|
24 tuntia
|
|
Genotyypitys
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Genotyypitys tehdään käyttämällä koko genomiryhmää.
|
2 vuotta
|
|
Metaboliitin määritys
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Metaboliitin määritys plasmasta ja virtsasta ydinmagneettisella resonanssilla
|
2 vuotta
|
|
Eksosomieristys plasmasta ja virtsasta
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Metodologian laatiminen eksosomien eristämiseksi näistä ruumiinnesteistä geeniekspressioanalyysiä varten
|
2 vuotta
|
|
Sytokiiniprofiilin määritys
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Luminexilla arvioidaan 88 erilaista sytokiinia
|
2 vuotta
|
|
rutiininomaiset autovasta-aineet seerumissa
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
sarja seerumin autovasta-aineita määritetään eurooppalaisessa validoidussa laboratoriossa.
He myös suorittavat vasta-aineiden havaitsemisen pieniä lipidiosia, eli antifosforyylikoliinia, lupusantikoagulanttia ja komplementtiproteiineja vastaan plasmassa.
|
2 vuotta
|
|
Geenimetylaatio kokonaisveren määrässä
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Metylaatioanalyysi tehdään käyttämällä metylomi 450k -järjestelmää käyttämällä kokonaisverestä saatua DNA:ta.
MicroRNA-geenin ilmentämisjärjestelmät, joissa käytetään kokonaisverta.
|
2 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Yhteistyökumppanit
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- PRECISESADS INCP (RB 15.007)
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .