Molekylær omklassifisering for å finne klinisk nyttige biomarkører for systemiske autoimmune sykdommer: begynnelseskohort (PRECISESADSI)

Det overordnede målet med PRECISESADS IMI-prosjektet er å omklassifisere individene som er berørt av SADs til klynger av molekylære, i stedet for kliniske enheter, gjennom bestemmelse av molekylære profiler ved å bruke flere "-omics"-teknikker.

Identifikasjonen av klyngene er avhengig av en tverrsnitts (CS) kohort/protokoll der 2666 individer (2000 pasienter og 666 kontroller) inkludert en delstudie av 288 dypt karakteriserte individer (240 pasienter og 48 kontroller) skal rekrutteres.

Parallelt vil det startes en langsgående oppstartskohort/protokoll for å videre utforske den kliniske relevansen til de identifiserte klyngene og deres utvikling over tid.

Målene for CS-studien og delstudien er:

1. Å identifisere en systemisk taksonomi for pasienter med SADs ved å produsere følgende data hos individer med SADs og kontroller: genetisk, epigenomisk, transkriptomisk, flowcytometrisk (fra perifere mononukleære blodceller (PBMC)), metabolomikk og proteomikk i plasma og urin, eksosomanalyse , klassisk serologi (antistoffer og autoantistoffer), og kliniske data.
2. For å bedre karakterisere individuelle SAD-er på omics-nivå.
3. Å utføre klyngeanalyser for å bestemme gruppene av individer som, forskjellig fra andre grupper, deler spesifikke molekylære egenskaper (presisjonsmedisin).
4. En dypere analyse vil bli gjort i en delstudie av 288 individer.

Klyngeprosessen vil være datadrevet med sikte på å finne de mest homogene og differensierte klyngene av sykdommer som tydelig skiller individer fra kontroller og andre pasientklynger.

Mål for Inception-kohorten:

Spesifikt sikter denne oppstartskohorten mot:

1. tilordne individer som nylig er diagnostisert med en systemisk autoimmun sykdom (SAD) til noen av reklassifiseringsklyngene som ble oppdaget i CS-studien,
2. å studere utviklingen og modifikasjonene av OMICS-signaturer/-klynger som forekommer hos hver enkelt pasient i sykdomsforløpet, inkludert virkningen av behandlingen på deres individuelle mønster, og
3. å utføre dype (grundige) OMICs-studier for å sammenligne deres mønstre av OMICS som en gruppe, med mønstrene oppnådd i CS-kohorten.

Oppstartskohorten vil ha pasientoppfølging og prøvetaking ved baseline, måned 6 (±1 måned) og måned 18 (±1 måned).

Ettersom de nydiagnostiserte pasientene vi planlegger å rekruttere vil ha minimum eller ingen behandling, vil vi identifisere forskjeller og likheter med pasienter fra tverrsnittsstudien som har gjennomgått langtidsbehandling.