Moleculaire herclassificatie om klinisch bruikbare biomarkers te vinden voor systemische auto-immuunziekten: aanvangscohort (PRECISESADSI)

Het algemene doel van het PRECISESADS IMI-project is om de individuen die door SAD's worden getroffen, te herclassificeren in clusters van moleculaire entiteiten in plaats van klinische entiteiten door moleculaire profielen te bepalen met behulp van verschillende "-omics"-technieken.

De identificatie van de clusters is gebaseerd op een cross-sectioneel (CS) cohort/protocol waarbij 2666 individuen (2000 patiënten en 666 controles) inclusief een substudie van 288 diep gekarakteriseerde individuen (240 patiënten en 48 controles) moeten worden aangeworven.

Tegelijkertijd zal een longitudinaal cohort/protocol van aanvang worden gestart om de klinische relevantie van de geïdentificeerde clusters en hun evolutie in de tijd verder te onderzoeken.

De doelstellingen van het CS-onderzoek en deelonderzoek zijn:

1. Een systemische taxonomie identificeren voor patiënten met SAD's door de volgende gegevens te produceren bij personen met SAD's en controles: genetische, epigenomische, transcriptomische, flowcytometrische (van perifere mononucleaire bloedcellen (PBMC's)), metabolomics en proteomics in plasma en urine, exosoomanalyse , klassieke serologie (antilichamen en auto-antilichamen) en klinische gegevens.
2. Om individuele SAD's beter te karakteriseren op omics-niveau.
3. Om clusteranalyses uit te voeren om de groepen individuen te bepalen die, anders dan andere groepen, specifieke moleculaire kenmerken delen (precisiegeneeskunde).
4. Een diepere analyse zal worden gedaan in een deelstudie van 288 personen.

Het clusteringsproces zal datagestuurd zijn met als doel de meest homogene en gedifferentieerde clusters van ziekten te vinden die individuen duidelijk onderscheiden van controles en andere patiëntenclusters.

Doelstellingen van het Inception-cohort:

Concreet is dit aanvangscohort gericht op:

1. wijs personen die onlangs zijn gediagnosticeerd met een systemische auto-immuunziekte (SAD) toe aan een van de herclassificatieclusters die in de CS-studie zijn ontdekt,
2. om de ontwikkeling en wijzigingen van OMICS-signaturen/-clusters te bestuderen die bij elke individuele patiënt in de loop van de ziekte voorkomen, inclusief de impact van de behandeling op hun individuele patroon, en
3. om diepe (grondige) OMIC-onderzoeken uit te voeren om hun patronen van OMICS als groep te vergelijken met de patronen verkregen in het CS-cohort.

Het aanvangscohort zal patiënten opvolgen en monsters verzamelen bij baseline, maand 6 (±1 maand) en maand 18 (±1 maand).

Aangezien de nieuw gediagnosticeerde patiënten die we willen rekruteren minimaal of geen behandeling zullen krijgen, zullen we verschillen en gelijkenissen identificeren met patiënten uit de cross-sectionele studie die een langdurige behandeling hebben ondergaan.