Reclassification moléculaire pour trouver des biomarqueurs cliniquement utiles pour les maladies auto-immunes systémiques : cohorte initiale (PRECISESADSI)
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Description détaillée
L'objectif global du projet PRECISESADS IMI est de reclasser les individus touchés par les SADs en clusters d'entités moléculaires, au lieu d'entités cliniques grâce à la détermination de profils moléculaires à l'aide de plusieurs techniques "-omiques".
L'identification des clusters repose sur une cohorte/protocole transversal (CS) où 2666 individus (2000 patients et 666 contrôles) incluant une sous-étude de 288 individus profondément caractérisés (240 patients et 48 contrôles) doivent être recrutés.
En parallèle, une cohorte/un protocole de démarrage longitudinal sera lancé afin d'explorer plus avant la pertinence clinique des clusters identifiés et leur évolution dans le temps.
Les objectifs de l'étude et de la sous-étude CS sont :
- Identifier une taxonomie systémique pour les patients atteints de SAD en produisant les données suivantes chez les individus atteints de SAD et les témoins : génétique, épigénomique, transcriptomique, cytométrie en flux (à partir de cellules mononucléaires du sang périphérique (PBMC)), métabolomique et protéomique dans le plasma et l'urine, analyse des exosomes , sérologie classique (anticorps et auto-anticorps) et données cliniques.
- Mieux caractériser les SAD individuels au niveau des omiques.
- Effectuer des analyses de regroupement pour déterminer les groupes d'individus qui, différemment des autres groupes, partagent des caractéristiques moléculaires spécifiques (médecine de précision).
- Une analyse plus approfondie sera effectuée dans une sous-étude de 288 individus.
Le processus de regroupement sera axé sur les données dans le but de trouver les groupes de maladies les plus homogènes et les plus différenciés qui séparent clairement les individus différenciés des témoins et des autres groupes de patients.
Objectifs de la cohorte Inception :
Plus précisément, cette cohorte de démarrage vise à :
- affecter les personnes nouvellement diagnostiquées avec une maladie auto-immune systémique (SAD) à l'un des groupes de reclassification découverts dans l'étude CS,
- étudier le développement et les modifications des signatures/clusters OMICS survenant chez chaque patient au cours de la maladie, y compris l'impact du traitement sur leur profil individuel, et
- effectuer des études approfondies (approfondies) des OMIC pour comparer leurs modèles d'OMICS en tant que groupe, avec les modèles obtenus dans la cohorte CS.
La cohorte initiale aura un suivi des patients et une collecte d'échantillons au départ, mois 6 (± 1 mois) et mois 18 (± 1 mois).
Comme les patients nouvellement diagnostiqués que nous prévoyons de recruter auront un traitement minimal ou nul, nous identifierons les différences et les similitudes avec les patients de l'étude transversale qui ont subi un traitement à long terme.
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Berlin, Allemagne
- Deutsches Rheuma-Forschungszentrum Berlin (DRFZ)
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Brussels, Belgique
- Université catholique de Louvain - Cliniques Universitaires Saint-Luc (UCL)
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Leuven, Belgique
- UZ Leuven - KU Leuven, Department of Rheumatology (KU LEUVEN)
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Barcelona, Espagne
- Hospital Clinic I Provicia- Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS)
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Cordoba, Espagne
- Hospital Universitario Reina Sofía Andaluz de Salud
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Granada, Espagne
- Hospital Universitario San Cecilio Servicio Andaluz de Salud
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Granada, Espagne
- Hospital Virgen de las Nieves Granada
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Brest, France, 29609
- CHRU de Brest
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Milan, Italie
- Fondazione IRCCS Ca Granda Ospedale Maggiore Policlinico (IRCCS)
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Geneve, Suisse
- Hospitaux Universitaires de Géneve (UNIGE)
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
· Âgé de 18 ans ou plus au moment du consentement
Diagnostiqué selon les critères en vigueur pour l'une des maladies auto-immunes systémiques suivantes (voir annexe 2)
- Polyarthrite rhumatoïde (PR)
- Sclérodermie ou sclérodermie systémique (SSc)
- Syndrome de Sjögren primaire (SjS)
- Lupus érythémateux disséminé (LES)
- Syndrome primaire des antiphospholipides (PAPS)
- Maladie mixte du tissu conjonctif (MCTD)
- Patients atteints d'une maladie du tissu conjonctif indifférencié (UCTD) depuis plus d'un an et qui ne répondent au diagnostic d'aucune des maladies ci-dessus.
- Signé le formulaire de consentement éclairé
Critère d'exclusion:
· Les patients incapables de comprendre les procédures liées au protocole ne doivent pas être inclus. L'étude est volontaire et les patients doivent pouvoir donner leur consentement éclairé.
- Femmes enceintes
- Lupus néonatal
- Lupus d'origine médicamenteuse
- Patients dont l'état est si grave qu'ils ne peuvent pas participer à l'étude
- Syndrome néphrotique sévère avec protéinurie >=3,5 g/jour
- Patients avec des doses stables de stéroïdes> 15 mg / jour au cours des 3 derniers mois ou avec des corticostéroïdes IV au cours des 3 derniers mois
Patients sous immunosuppresseurs depuis les 3 derniers mois précédant le recrutement avec :
- Méthotrexate ≥25mg/semaine
- Azathioprine ≥ 2,5 mg/kg/jour
- Ciclosporine A > 3mg/kg/jour
- Mycophénolate Mofetil > 2gr/jour
- Traitement par cyclophosphamide (toute dose ou voie d'administration) ou Belimumab au cours des 6 derniers mois
- Patients sous traitement combiné de deux immunosuppresseurs ou plus
- Patients sous traitement déplétif tel que Rituximab au cours de la dernière année
- Les patients recevant un traitement expérimental
- Syndromes de chevauchement
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cohorte
- Perspectives temporelles: Éventuel
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Expression génique dans le sang total
Délai: 2 années
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L'expression génique sera effectuée à l'aide de puces à ADN d'expression génique commerciales dans le sang total de tous les échantillons à l'aide du tube RNA Paxgene.
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2 années
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Analyse par cytométrie en flux pour déterminer les proportions de cellules dans le mélange sanguin total chez tous les individus.
Délai: 24 heures
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9 panels optimisés d'anticorps seront utilisés pour déterminer les sous-populations cellulaires dans le sang périphérique (y compris les populations cellulaires très mineures).
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24 heures
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Génotypage
Délai: 2 années
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Le génotypage sera effectué à l'aide d'un ensemble de génomes.
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2 années
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Détermination des métabolites
Délai: 2 années
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Détermination des métabolites dans le plasma et l'urine par résonance magnétique nucléaire
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2 années
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Isolement des exosomes du plasma et de l'urine
Délai: 2 années
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mise en place de la méthodologie d'isolement des exosomes dans ces fluides corporels pour l'analyse de l'expression génique
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2 années
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Détermination du profil des cytokines
Délai: 2 années
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88 cytokines différentes seront évaluées avec Luminex
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2 années
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auto-anticorps de routine dans le sérum
Délai: 2 années
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ensemble d'auto-anticorps sériques seront déterminés dans un laboratoire européen validé.
En outre, ils effectueront la détection d'anticorps contre de petites fractions lipidiques, c'est-à-dire l'antiphosphorylcholine), l'anticoagulant lupique et les protéines du complément dans le plasma.
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2 années
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Méthylation des gènes dans le sang total
Délai: 2 années
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L'analyse de méthylation sera effectuée à l'aide de la matrice methylome 450k en utilisant l'ADN obtenu à partir du sang total.
Puces d'expression génique de microARN utilisant du sang total.
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2 années
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Collaborateurs et enquêteurs
Collaborateurs
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Réel)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Estimation)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- PRECISESADS INCP (RB 15.007)
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
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