Ulosteen mikrobiotasiirron vaikutus useille lääkkeille vastustuskykyisten organismien dekolonisaatioon

Tämä tutkimus on prospektiivinen havainnollinen kohorttitutkimus, jossa tutkitaan ulosteen mikrobiotasiirron (FMT) dekolonisaatiovaikutusta potilailla, joilla on karbapeneemille resistentti Enterobacteriaceae (CRE) ja vankomysiiniresistentti enterokokki (VRE).

Potilaiden, jotka ovat antaneet kirjallisen suostumuksen tutkimukseen osallistumiselle, on pidettävä paastoaminen toimenpidettä edeltävästä illasta alkaen laajakirjoisten antibioottien käytön lopettamisen jälkeen vähintään 3-7 päivän ajan. Sen jälkeen suolen valmistelu suoritetaan kahdesti - toimenpidettä edeltävänä iltana ja aamulla. Kun suolen valmistelu on valmis, 1 tunti ennen toimenpidettä potilaat saavat loperamidia suoliston liikkeiden vähentämiseksi ja jatkavat sitten endoskopiaosastolle.

Ulosteen mikrobiotan siirto (FMT) suoritetaan hankitulla jäädytetyllä luovuttajan ulosteella, jota sulatetaan 2 tuntia huoneenlämmössä oston ja ulostepankista toimituksen jälkeen potilaan tai huoltajan suostumuksella ja valvonnassa. Jäädytetyt ulosteet huolellisesti seulotuilta luovuttajilta, jotka ovat läpäisseet sekä vaiheen 1 kliinisen arvioinnin että vaiheen 2 laboratoriotestien (mukaan lukien antibioottiresistenssiorganismien arvioinnin), toimitetaan Microbiotix inc.:n ulostepankista. (Hyun Soo Seo et ai. Ann Lab Med 2021;41:424-428).

FMT-menettely suoritetaan yhteistyössä Gastroenterologian osaston tutkimusryhmän kanssa. Toimenpiteen aikana ei suoriteta kudosbiopsiaa tai liiallista endoskoopin lisäystä. FMT sisältää yksinkertaisen sulatetun luovuttajan ulosteen infuusion terminaaliseen sykkyräsuoleen kolonoskopiassa, mikä kestää noin 5-10 minuuttia. Toimenpiteeseen liittyy minimaalinen verenvuodon, perforaation tai aspiraation riski. Useimmissa tapauksissa se suoritetaan sedaatiossa kolonoskopialla. Jos kolonoskoopin tasainen asettaminen tai paksusuolen asianmukainen visualisointi estyy tai jos paksusuolen valmistelu ei onnistu, Esophagogastroduodenoscopy (EGD) suoritetaan sedaatiolla ja sulatettu luovuttajan uloste infusoidaan pohjukaissuolen kolmanteen osaan. Tämä toimenpide aiheuttaa myös minimaalisen regurgitaatio- tai aspiraatioriskin sen anatomisten ja fysiologisten ominaisuuksien vuoksi. Toimenpiteen jälkeen alaraajoja nostetaan noin 30 astetta, jotta siirretty uloste ei pääse ulos. Toimenpiteen jälkeen ylläpidetään yhden päivän paastojaksoa siirretyn ulosteen onnistuneen juurtumisen helpottamiseksi, mitä seuraa asteittainen säännöllisen ruokavalion jatkaminen. FMT:n jälkeen suoritetaan toistuvia peräsuolen vanupuikkoviljelmiä kolmen peräkkäisen negatiivisen tuloksen vahvistamiseksi CP-CRE:lle tai VRE:lle 3–7 päivän välein.

Tapauksissa, joissa FMT:hen käytetään kapseloitua ulostemateriaalia, se nautitaan runsashappoisen karpalo- tai appelsiinimehun kanssa. Kapselit on erityisesti suunniteltu liukenemaan vähän happamissa ympäristöissä, jolloin ne pääsevät terminaaliseen sykkyräsuoleen turvalliseen annosteluun ilman suolen valmistelua. Ensimmäisenä päivänä nautitaan 15 kapselia ja toisena päivänä 15 kapselia, yhteensä 30 kapselia. Sen jälkeen suoritetaan toistetut peräsuolen vanupuikkotestit kolmen peräkkäisen negatiivisen tuloksen vahvistamiseksi CP-CRE:lle tai VRE:lle 3 päivän välein.

Potilaiden satunnaisallokoinnin mukaan ulostenäytteet ja kliiniset metatiedot kerätään säännöllisesti (ennen FMT:tä, 1 kuukausi, 3 kuukautta, 6 kuukautta ja 12 kuukautta FMT:n jälkeen) sekä vastaanottajilta että luovuttajilta. Näille kerätyille näytteille tehdään täyspitkä 16S-rRNA-sekvensointi ja haulikon metagenominen sekvensointi suoliston mikrobiomin kattavaa analysointia varten. Tämän analyysin avulla pyritään selvittämään dekolonisaatiotuloksiin ja -mekanismeihin liittyviä suoliston mikro-organismeja.