Wpływ przeszczepu mikroflory kałowej na dekolonizację organizmów opornych na wiele leków

To badanie jest prospektywnym obserwacyjnym badaniem kohortowym badającym efekt dekolonizacji przeszczepu mikroflory kałowej (FMT) u pacjentów skolonizowanych przez Enterobacteriaceae oporne na karbapenemy (CRE) i Enterococci oporne na wankomycynę (VRE).

Pacjenci, którzy wyrazili pisemną zgodę na udział w badaniu będą zobowiązani do przestrzegania postu od wieczora poprzedzającego zabieg, po odstawieniu antybiotyków o szerokim spektrum działania przez minimum 3-7 dni. Następnie dwukrotnie zostanie przeprowadzone przygotowanie jelita – wieczorem przed zabiegiem i rano w dniu zabiegu. Po zakończeniu przygotowania jelita, na 1 godzinę przed zabiegiem, pacjenci otrzymają loperamid w celu zmniejszenia wypróżnień, a następnie przejdą do gabinetu endoskopii.

Transplantacja mikrobioty kałowej (FMT) zostanie przeprowadzona z pozyskanego zamrożonego stolca dawcy, który po zakupie i dostarczeniu z banku kału będzie rozmrażany przez 2 godziny w temperaturze pokojowej, za zgodą i pod nadzorem pacjenta lub opiekuna. Zamrożony stolec od starannie przebadanych dawców, którzy przeszli rygorystyczne badania przesiewowe zarówno oceny klinicznej etapu 1, jak i testów laboratoryjnych etapu 2 (w tym oceny organizmów opornych na antybiotyki), zostanie dostarczony z banku kału firmy Microbiotix inc. (Hyun Soo Seo i in. Ann Lab Med 2021;41:424-428).

Procedura FMT zostanie przeprowadzona we współpracy z zespołem badawczym Oddziału Gastroenterologii. Podczas zabiegu nie będzie wykonywana biopsja tkanki ani nadmierne wprowadzanie endoskopu. FMT polega na prostym wlewie rozmrożonego stolca dawcy do końcowego odcinka jelita krętego pod kolonoskopią, co trwa około 5-10 minut. Procedura niesie ze sobą minimalne ryzyko krwawienia, perforacji lub aspiracji. W większości przypadków będzie to wykonywane w sedacji z kolonoskopią. W przypadku trudności z płynnym wprowadzeniem kolonoskopu lub prawidłowym uwidocznieniem okrężnicy lub jeśli przygotowanie okrężnicy nie powiodło się, należy wykonać esofagogastroduodenoskopię (EGD) w sedacji, a rozmrożony stolec dawcy podać do trzeciej części dwunastnicy. Ta procedura stwarza również minimalne ryzyko regurgitacji lub aspiracji ze względu na jej anatomiczne i fizjologiczne cechy. Po zabiegu kończyny dolne zostaną uniesione o około 30 stopni, aby uniemożliwić wypłynięcie przeszczepionego stolca. Po zabiegu zostanie zachowana jednodniowa głodówka, aby ułatwić pomyślne wszczepienie przeszczepionego stolca, a następnie stopniowe wznowienie normalnej diety. Po FMT zostaną przeprowadzone powtórne posiewy wymazów z odbytu w celu potwierdzenia trzech kolejnych wyników ujemnych dla CP-CRE lub VRE w odstępach 3-7 dni.

W przypadkach, gdy do FMT używany jest kapsułkowany materiał kałowy, zostanie on połknięty wraz z wysoko kwaśnym sokiem żurawinowym lub pomarańczowym. Kapsułki są specjalnie zaprojektowane do rozpuszczania się w środowiskach o niskiej kwasowości, umożliwiając im dotarcie do końcowego odcinka jelita krętego w celu bezpiecznego podania bez konieczności przygotowania jelita. Pierwszego dnia zostanie spożytych 15 kapsułek, a następnie kolejne 15 kapsułek drugiego dnia, w sumie 30 kapsułek. Następnie zostaną przeprowadzone powtórne testy wymazów z odbytu w celu potwierdzenia trzech kolejnych negatywnych wyników dla CP-CRE lub VRE w odstępach 3-dniowych.

Zgodnie z losowym przydziałem pacjentów, próbki kału i metadane kliniczne będą okresowo zbierane (przed FMT, 1 miesiąc, 3 miesiące, 6 miesięcy i 12 miesięcy po FMT) zarówno od biorców, jak i dawców. Te zebrane próbki zostaną poddane pełnej długości sekwencjonowaniu 16S rRNA i sekwencjonowaniu metagenomicznemu w celu kompleksowej analizy mikrobiomu jelitowego. Dzięki tej analizie celem jest wyjaśnienie mikroorganizmów jelitowych związanych z wynikami i mechanizmami dekolonizacji.