Effekten af ​​fækal mikrobiotatransplantation på afkoloniseringen af ​​multiresistente organismer

Denne undersøgelse er et prospektivt observationelt kohortestudie, der undersøger afkoloniseringseffekten af ​​fækal mikrobiotatransplantation (FMT) hos patienter koloniseret med Carbapenem-resistente Enterobacteriaceae (CRE) og Vancomycin-resistente Enterococci (VRE).

Patienter, der har givet skriftligt samtykke til deltagelse i undersøgelsen, vil være forpligtet til at opretholde faste fra aftenen før indgrebet, efter seponering af bredspektret antibiotika i minimum 3-7 dage. Efterfølgende vil en tarmforberedelse blive udført to gange - aftenen før og morgenen for proceduren. Når tarmforberedelsen er afsluttet, 1 time før proceduren, vil patienterne modtage loperamid for at reducere afføringen og derefter fortsætte til endoskopiafdelingen.

Fækal mikrobiotatransplantation (FMT) vil blive udført med den erhvervede frosne donorafføring, som vil blive optøet i 2 timer ved stuetemperatur efter køb og levering fra en afføringsbank, under patientens eller værgens samtykke og tilsyn. Frossen afføring fra omhyggeligt screenede donorer, som har bestået den strenge screening af både trin 1 klinisk vurdering og trin 2 laboratorietest (inklusive evaluering for antibiotikaresistensorganismer) vil blive leveret fra en afføringsbank af Microbiotix inc. (Hyun Soo Seo, et al. Ann Lab Med 2021;41:424-428).

FMT-proceduren vil blive gennemført i samarbejde med forskerholdet i Afdelingen for Gastroenterologi. Under proceduren vil der ikke blive udført vævsbiopsi eller overdreven endoskopindsættelse. FMT involverer simpel infusion af optøet donorafføring i den terminale ileum under koloskopi, hvilket tager cirka 5-10 minutter. Proceduren medfører minimal risiko for blødning, perforering eller aspiration. I de fleste tilfælde vil det blive udført under sedation med koloskopi. Hvis glat indsættelse af koloskopet eller korrekt visualisering af tyktarmen hindres, eller hvis forberedelse af tyktarmen ikke lykkes, udføres esophagogastroduodenoskopi (EGD) med sedation, og optøet donorafføring vil blive infunderet i den tredje del af duodenum. Denne procedure udgør også minimal risiko for regurgitation eller aspiration på grund af dens anatomiske og fysiologiske karakteristika. Efter proceduren vil underekstremiteterne blive hævet med omkring 30 grader for at forhindre den transplanterede afføring i at komme ud. En endags fasteperiode vil blive opretholdt efter proceduren for at lette vellykket indpodning af den transplanterede afføring, efterfulgt af en gradvis genoptagelse af en almindelig diæt. Efter FMT vil gentagne rektale podningskulturer blive udført for at bekræfte tre på hinanden følgende negative resultater for CP-CRE eller VRE med 3-7 dages intervaller.

I tilfælde, hvor indkapslet fækalt materiale bruges til FMT, vil det blive indtaget sammen med højsyre tranebær- eller appelsinjuice. Kapslerne er specielt designet til at opløses i miljøer med lavt syreindhold, hvilket giver dem mulighed for at nå den terminale ileum for sikker administration uden behov for tarmforberedelse. På den første dag indtages 15 kapsler, efterfulgt af yderligere 15 kapsler på den anden dag, i alt 30 kapsler. Efterfølgende vil der blive udført gentagne rektale podningsprøver for at bekræfte tre på hinanden følgende negative resultater for CP-CRE eller VRE med 3-dages intervaller.

Ifølge tilfældig tildeling af patienten vil fækale prøver og kliniske metadata blive indsamlet periodisk (før FMT, 1 måned, 3 måneder, 6 måneder og 12 måneder efter FMT) fra både modtagere og donorer. Disse indsamlede prøver vil gennemgå fuldlængde 16S rRNA-sekventering og shotgun metagenomisk sekventering for at analysere tarmmikrobiomet. Gennem denne analyse er målet at belyse de tarmmikroorganismer, der er forbundet med afkoloniseringsresultater og -mekanismer.