Vliv transplantace fekální mikrobioty na dekolonizaci multirezistentních organismů

Tato studie je prospektivní observační kohortová studie zkoumající dekolonizační účinek transplantace fekální mikrobioty (FMT) u pacientů kolonizovaných Enterobacteriaceae rezistentními na karbapenem (CRE) a enterokoky rezistentními na vankomycin (VRE).

Pacienti, kteří poskytli písemný souhlas s účastí ve studii, budou muset po vysazení širokospektrých antibiotik po dobu minimálně 3-7 dnů držet hladovění počínaje večerem před výkonem. Následně bude dvakrát provedena příprava střev – večer před a ráno před zákrokem. Jakmile je příprava střev dokončena, 1 hodinu před výkonem, pacienti dostanou loperamid ke snížení pohybů střev a poté přejdou na endoskopickou soupravu.

Transplantace fekální mikrobioty (FMT) bude provedena se získanou zmraženou stolicí dárce, která bude po zakoupení a dodání z banky stolice po dobu 2 hodin rozmražena při pokojové teplotě se souhlasem a dohledem pacienta nebo opatrovníka. Zmrazená stolice od pečlivě vyšetřených dárců, kteří prošli přísným screeningem klinického hodnocení 1. stupně a laboratorních testů 2. stupně (včetně hodnocení organismů rezistentních na antibiotika), bude dodávána z banky stolice společnosti Microbiotix Inc. (Hyun Soo Seo a kol. Ann Lab Med 2021;41:424-428).

Postup FMT bude prováděn ve spolupráci s výzkumným týmem v oddělení gastroenterologie. Během výkonu nebude provedena žádná biopsie tkáně ani nadměrné zavádění endoskopu. FMT zahrnuje jednoduchou infuzi rozmražené stolice dárce do terminálního ilea pod kolonoskopií, která trvá přibližně 5-10 minut. Zákrok s sebou nese minimální riziko krvácení, perforace nebo aspirace. Ve většině případů se provádí pod sedací s kolonoskopií. Pokud brání hladkému zavedení kolonoskopu nebo správné vizualizaci tlustého střeva nebo pokud příprava tlustého střeva není úspěšná, provede se esofagogastroduodenoscopy (EGD) se sedací a rozmražená stolice dárce bude podána infuzí do třetí části duodena. Tento postup také představuje minimální riziko regurgitace nebo aspirace vzhledem ke svým anatomickým a fyziologickým vlastnostem. Po zákroku budou dolní končetiny zvednuty asi o 30 stupňů, aby se zabránilo odchodu transplantované stolice. Po zákroku bude zachováno jednodenní období hladovění, aby se usnadnilo úspěšné přihojení transplantované stolice, s následným postupným obnovením pravidelné stravy. Po FMT budou provedeny opakované kultivace rektálních výtěrů, aby se potvrdily tři po sobě jdoucí negativní výsledky na CP-CRE nebo VRE v 3-7denních intervalech.

V případech, kdy se pro FMT používá zapouzdřený fekální materiál, bude požit spolu s vysoce kyselým brusinkovým nebo pomerančovým džusem. Kapsle jsou speciálně navrženy tak, aby se rozpouštěly v nízko kyselém prostředí, což jim umožňuje dosáhnout až do terminálního ilea pro bezpečné podání bez nutnosti přípravy střev. První den se spotřebuje 15 kapslí a druhý den dalších 15 kapslí, celkem tedy 30 kapslí. Následně budou provedeny opakované testy výtěru z konečníku, aby se potvrdily tři po sobě jdoucí negativní výsledky na CP-CRE nebo VRE ve 3denních intervalech.

Podle náhodného rozdělení pacientů budou pravidelně sbírány vzorky stolice a klinická metadata (před FMT, 1 měsíc, 3 měsíce, 6 měsíců a 12 měsíců po FMT) od příjemců i dárců. Tyto odebrané vzorky projdou kompletním sekvenováním 16S rRNA a metagenomickým sekvenováním pomocí brokovnice, aby se komplexně analyzoval střevní mikrobiom. Prostřednictvím této analýzy je cílem objasnit střevní mikroorganismy spojené s výsledky a mechanismy dekolonizace.