Effekten av transplantation av fekal mikrobiota på avkoloniseringen av multiresistenta organismer

Denna studie är en prospektiv observationskohortstudie som undersöker avkoloniseringseffekten av Fecal Microbiota Transplantation (FMT) hos patienter koloniserade med Carbapenem-resistenta Enterobacteriaceae (CRE) och Vancomycin-resistenta Enterococci (VRE).

Patienter som har lämnat skriftligt samtycke för deltagande i studien kommer att behöva hålla fastan från och med kvällen före ingreppet, efter att ha avbrutit bredspektrumantibiotika i minst 3-7 dagar. Därefter kommer en tarmförberedelse att utföras två gånger - kvällen före och morgonen för proceduren. När tarmförberedelsen är klar, 1 timme före proceduren, kommer patienterna att få loperamid för att minska tarmrörelserna och sedan fortsätta till endoskopiavdelningen.

Fekal mikrobiotatransplantation (FMT) kommer att utföras med den förvärvade frusna donatoravföringen, som kommer att tinas i 2 timmar i rumstemperatur efter köp och leverans från en avföringsbank, under patientens eller vårdnadshavarens samtycke och överinseende. Fryst avföring från noggrant screenade donatorer som har klarat den rigorösa screeningen av både steg 1 klinisk bedömning och steg 2 laboratorietester (inklusive utvärdering av antibiotikaresistensorganismer) kommer att levereras från en avföringsbank av Microbiotix inc. (Hyun Soo Seo, et al. Ann Lab Med 2021;41:424-428).

FMT-proceduren kommer att genomföras i samarbete med forskargruppen vid avdelningen för gastroenterologi. Under proceduren kommer ingen vävnadsbiopsi eller överdriven insättning av endoskop att utföras. FMT innebär en enkel infusion av tinad donatoravföring i den terminala ileum under koloskopi, vilket tar cirka 5-10 minuter. Proceduren medför minimal risk för blödning, perforering eller aspiration. I de flesta fall kommer det att utföras under sedering med koloskopi. Om smidig insättning av koloskopet eller korrekt visualisering av tjocktarmen hindras, eller om kolonförberedelsen inte lyckas, kommer Esophagogastroduodenoskopi (EGD) att utföras med sedering och tinad donatoravföring kommer att infunderas i den tredje delen av tolvfingertarmen. Denna procedur innebär också minimal risk för uppstötningar eller aspiration på grund av dess anatomiska och fysiologiska egenskaper. Efter ingreppet kommer de nedre extremiteterna att höjas med cirka 30 grader för att förhindra att den transplanterade avföringen kommer ut. En endags fasteperiod kommer att upprätthållas efter proceduren för att underlätta framgångsrik ympning av den transplanterade avföringen, följt av ett gradvist återupptagande av en vanlig diet. Efter FMT kommer upprepade rektala pinnprover att utföras för att bekräfta tre på varandra följande negativa resultat för CP-CRE eller VRE med 3-7 dagars intervall.

I de fall där inkapslat fekalt material används för FMT, kommer det att intas tillsammans med högsyra tranbärs- eller apelsinjuice. Kapslarna är speciellt utformade för att lösas upp i miljöer med låg syrahalt, vilket gör att de kan nå den terminala ileum för säker administrering utan behov av tarmförberedelse. Den första dagen kommer 15 kapslar att konsumeras, följt av ytterligare 15 kapslar den andra dagen, för totalt 30 kapslar. Därefter kommer upprepade rektala pinnprover att utföras för att bekräfta tre på varandra följande negativa resultat för CP-CRE eller VRE med 3-dagarsintervall.

Enligt patientens slumpmässiga tilldelning kommer fekala prover och klinisk metadata att samlas in periodiskt (före FMT, 1 månad, 3 månader, 6 månader och 12 månader efter FMT) från både mottagare och donatorer. Dessa insamlade prover kommer att genomgå fullängds 16S rRNA-sekvensering och shotgun-metagenomisk sekvensering för att heltäckande analysera tarmmikrobiomet. Genom denna analys är syftet att belysa de tarmmikroorganismer som är förknippade med avkoloniseringsresultat och mekanismer.