Effekten av fekal mikrobiotatransplantasjon på avkoloniseringen av multiresistente organismer

Denne studien er en prospektiv observasjonskohortstudie som undersøker dekoloniseringseffekten av fekal mikrobiotatransplantasjon (FMT) hos pasienter kolonisert med Carbapenem-resistente Enterobacteriaceae (CRE) og Vancomycin-resistente Enterococci (VRE).

Pasienter som har gitt skriftlig samtykke til deltakelse i studien vil bli pålagt å opprettholde faste fra kvelden før prosedyren, etter seponering av bredspektret antibiotika i minimum 3-7 dager. Deretter vil en tarmforberedelse utføres to ganger - kvelden før og morgenen for prosedyren. Når tarmforberedelsen er fullført, 1 time før prosedyren, vil pasientene få loperamid for å redusere tarmbevegelser og deretter fortsette til endoskopiavdelingen.

Fekal mikrobiotatransplantasjon (FMT) vil bli utført med den ervervede frosne donoravføringen, som vil bli tint i 2 timer ved romtemperatur etter kjøp og levering fra en avføringsbank, under samtykke og tilsyn av pasienten eller foresatte. Frossen avføring fra nøye screenede givere som har bestått den strenge screeningen av både trinn 1 klinisk vurdering og trinn 2 laboratorietester (inkludert evaluering for antibiotikaresistensorganismer) vil bli levert fra en avføringsbank av Microbiotix inc. (Hyun Soo Seo, et al. Ann Lab Med 2021;41:424-428).

FMT-prosedyren vil bli gjennomført i samarbeid med forskerteamet ved avdeling for gastroenterologi. Under prosedyren vil ingen vevsbiopsi eller overdreven endoskopinnsetting bli utført. FMT involverer enkel infusjon av tint donoravføring inn i terminal ileum under koloskopi, noe som tar omtrent 5-10 minutter. Prosedyren medfører minimal risiko for blødning, perforering eller aspirasjon. I de fleste tilfeller vil det bli utført under sedasjon med koloskopi. Hvis jevn innsetting av koloskopet eller riktig visualisering av tykktarmen hindres, eller hvis klargjøring av tykktarmen ikke er vellykket, vil esophagogastroduodenoskopi (EGD) utføres med sedasjon, og tint donoravføring vil bli infundert i den tredje delen av tolvfingertarmen. Denne prosedyren utgjør også minimal risiko for oppstøt eller aspirasjon på grunn av dens anatomiske og fysiologiske egenskaper. Etter prosedyren vil underekstremitetene heves med ca. 30 grader for å forhindre at den transplanterte avføringen kommer ut. En fasteperiode på én dag vil opprettholdes etter prosedyren for å lette vellykket engraftment av den transplanterte avføringen, etterfulgt av gradvis gjenopptakelse av en vanlig diett. Etter FMT vil gjentatte rektale vattpinnekulturer bli utført for å bekrefte tre påfølgende negative resultater for CP-CRE eller VRE med 3-7 dagers intervaller.

I tilfeller der innkapslet fekalt materiale brukes til FMT, vil det bli inntatt sammen med høysyre tranebær- eller appelsinjuice. Kapslene er spesielt designet for å løse seg opp i miljøer med lavt syrehold, slik at de kan nå den terminale ileum for sikker administrering uten behov for tarmforberedelse. På den første dagen vil det bli konsumert 15 kapsler, etterfulgt av ytterligere 15 kapsler på den andre dagen, for totalt 30 kapsler. Deretter vil gjentatte rektale vattpinneprøver bli utført for å bekrefte tre påfølgende negative resultater for CP-CRE eller VRE med 3-dagers intervaller.

I henhold til tilfeldig tildeling av pasienter vil fekale prøver og kliniske metadata bli samlet inn periodisk (før FMT, 1 måned, 3 måneder, 6 måneder og 12 måneder etter FMT) fra både mottakere og givere. Disse innsamlede prøvene vil gjennomgå full-lengde 16S rRNA-sekvensering og hagle metagenomisk sekvensering for å analysere tarmmikrobiomet. Gjennom denne analysen er målet å belyse tarmmikroorganismene assosiert med dekoloniseringsutfall og -mekanismer.