Ennen ja jälkeen hoitoa keuhkojen mikrobiota, aineenvaihdunta ja immuunijärjestelmän allekirjoitukset sairauspaikalla potilailla, joilla on aktiivinen keuhkotuberkuloosi (TB-LUNG)
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Ihmiskehossa on monimutkaisia mikrobiyhteisöjä eri anatomisissa paikoissa, kuten suolistossa, suuontelossa, emättimessä, iholla ja alemmissa hengitysteissä - paikassa, jonka aiemmin uskottiin olevan steriili. Kasvava näyttö on osoittanut ihmisen mikrobiomin roolin erilaisissa sairauksissa, esimerkiksi Prevotellalla rikastetut keuhkoyhteisöt HIV-positiivisilla keuhkokuumepotilailla ennustavat itsenäisesti 70 päivän kuolleisuuden, ja Lactobacillus-rikastettu hiiren suoliston mikrobiomi lievittää astman kaltaisia oireita. Tuberkuloosin laajuudesta ja vakavuudesta huolimatta tuberkuloositapausten mikrobiomista, sairauden paikasta ja hoidon vaikutuksista on kuitenkin rajallisesti tutkimuksia, erityisesti HIV:n yhteydessä. Nämä keskeiset tiedon puutteet estävät sellaisten interventioiden suunnittelun ja arvioinnin, jotka voisivat kohdistaa mikrobiomiin ja estää tuberkuloosin huonot hoitotulokset.
Tähän mennessä muutamat tuberkuloosin mikrobiomitutkimukset ovat keskittyneet ylempään hengitysteihin (käyttämällä näytteitä, kuten ysköstä) ja suolistoon pikemminkin kuin sairauskohtaan, joka tuberkuloosissa on tyypillisesti keuhkot. Nämä tutkimukset ovat osoittaneet yhteyksiä mikrobiomin ja sairauden tilan välillä. Esimerkiksi suolistossa Helicobacter hepaticus -bakteerin kolonisoidut hiiret osoittavat huonoa mykobakteerikasvun hallintaa, lisääntynyttä tulehdusta ja vakavaa kudospatologiaa keuhkoissa. Keuhkotuberkuloosin sairaskohtana olevaa keuhkoa on pidetty laajalti steriilinä viime aikoihin asti, ja keuhkojen mikrobiomi on edelleen laajalti alitutkittua tuberkuloosissa riippumatta siitä, millainen vaikutus sillä voi olla tuberkuloosin patogeneesissä. Yksi tärkeimmistä syistä, miksi keuhkoja ei tutkita, on näytteenoton vaikea keuhkoista. Tutkijat ottavat käyttöön muunnetun bronkoskopiamenettelyn välttääkseen mikrobien ristikontaminaation viereisistä anatomisista kohdista (mukaan lukien sairaista keuhkojen osista terveisiin) ja ottaakseen tarkasti näytteitä bronkoalveolaarisen tilan alhaisesta biomassasta. Tutkijat olettavat, että tuberkuloositapauksilla on selkeä sairauskohtaisen keuhkojen mikrobiota verrattuna ei-sairaaseen kontralateraaliseen kudokseen, jolle on ominaista oraalisten anaerobisten fermentoijien, SCFA:iden rikastuminen ja heikentyneet tulehduksen ja kudoksen korjaamisen biomarkkerit. He odottavat myös, että tuberkuloosihoito muuttaa mikrobien ja isännän biomarkkereita. Yhden tutkijan tekemä tutkimus on jo osoittanut, että anaerobisilla suun taksoneilla rikastetut keuhkojen mikrobiomit liittyvät Th17-fenotyypin keuhkotulehdukseen. Mikrobien anaerobisen aineenvaihdunnan tuotteiden on myös osoitettu moduloivan immuunivastetta sairauksille. Tutkijat korreloivat monimutkaisia mikrobiyhteisöjä tuberkuloosin taudin esiintymispaikalla mikrobien ja isännän biomarkkerien kanssa sairauspaikalla.
Tutkimukseen värvätään itse ilmoittavia potilaita, joilla on ensimmäinen tuberkuloosijakso ja Xpert MTB/RIF Ultra-confirmer TB Scottsdenen ja Wallacedenen perusterveydenhuollon klinikoista Kapkaupungista. Rekrytoidaan yhteensä 50 TB-tapausta tasaisesti HIV-statuksen perusteella ja 50 terveen kotitalouden kontaktia (HHC), jotka ovat myös HIV:n mukaan kerrostuneet. HIV-negatiivisten lisäksi tutkimukseen rekrytoidaan yhtä paljon ART-hoidettuja HIV-positiivisia tuberkuloositapauksia, koska siellä on epidemiologisesti tärkeä alapopulaatio, jolla on heikentynyt keuhkoimmuniteetti. Vertailuryhmiksi rekrytoidaan lisäksi 50 sairasta verrokkia, joilla on muita keuhkosairauksia (astma, krooninen obstruktiivinen keuhkosairaus (COPD), syöpä, bronkiektaasi (mukaan lukien tuberkuloosin jälkeinen sairaus) ja keuhkokuume.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Grant Theron, PhD
- Puhelinnumero: (+27) 021 938 9693
- Sähköposti: gtheron@sun.ac.za
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Charissa Naidoo, PhD
- Puhelinnumero: (+27) 0219389955
- Sähköposti: ccnaidoo@sun.ac.za
Opiskelupaikat
-
-
Western Cape
-
Cape Town, Western Cape, Etelä-Afrikka, 7570
- Rekrytointi
- Kraaifontein Community Health Centre
-
Ottaa yhteyttä:
- Grant Theron, PhD
- Puhelinnumero: 9693 (+27) 21 938 9693
- Sähköposti: gtheron@sun.ac.za
-
Ottaa yhteyttä:
- Tinaye Chiyaka, PhD
- Puhelinnumero: 9954 (+27) 21 938 9954
- Sähköposti: tinayechiyaka@sun.ac.za
-
Cape Town, Western Cape, Etelä-Afrikka, 7570
- Rekrytointi
- Scottsdene Clinic
-
Ottaa yhteyttä:
- Grant Theron, PhD
- Puhelinnumero: 9693 (+27) 21 938 9693
- Sähköposti: gtheron@sun.ac.za
-
Ottaa yhteyttä:
- Tinaye Chiyaka, PhD
- Puhelinnumero: 9954 (+27) 21 938 9954
- Sähköposti: tinayechiyaka@sun.ac.za
-
Cape Town, Western Cape, Etelä-Afrikka, 7570
- Rekrytointi
- Wallacedene Clinic
-
Ottaa yhteyttä:
- Grant Theron, PhD
- Puhelinnumero: 9693 (+27) 21 938 9693
- Sähköposti: gtheron@sun.ac.za
-
Ottaa yhteyttä:
- Tinaye WP Chiyaka, PhD
- Puhelinnumero: 9954 (+27) 21 938 9954
- Sähköposti: tinayechiyaka@sun.ac.za
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- 18-60 vuotta vanha.
- Hyväksy CXR- ja/tai CT-skannauksen.
- Hänellä on yksipuolinen tuberkuloosisairaus, joka määritellään yhdeksi keuhkoksi, jossa on laajat todisteet tuberkuloosista (ei koske terveitä verrokkeja; sairaat kontrollit edellyttävät vaihtoehtoista diagnoosia).
- Ei näyttöä aikaisemmasta tuberkuloosihoidosta ja/tai CXR/TT:ssä ei ole ilmeisiä todisteita aiemmasta tuberkuloosista.
- Hän on valmis suorittamaan tutkimusbronkoskoopian lähtötilanteessa, 6 kuukauden ja 18 kuukauden iässä ja todennäköisesti pysyy alueella koko tutkimusajan.
- Jos HIV-positiivinen, sen on oltava stabiili antiretroviraalisella hoidolla (ART) ≥ 1 vuoden ajan.
- Pystyy ja haluaa palata seurantakäynneille ilman suunnitelmia muuttaa lähitulevaisuudessa.
- Halukkuus noudattaa opiskeluvaatimuksia eli yhteystietojen ja kirjallisen, tietoisen suostumuksen antamista ennen ilmoittautumista.
Poissulkemiskriteerit:
- Alle 18-vuotias tai yli 60-vuotias.
- Hän on jo aloittanut tuberkuloosihoidon.
- Rifampisiiniresistentti.
- Hänellä on aiempi TB-historia.
- Kahdenvälinen tuberkuloosisairaus määritellään molemmissa keuhkoissa, joissa on laaja tuberkuloosisairaus
- on saanut probiootteja, antibiootteja tai inhaloitavia steroideja kolmen kuukauden aikana ennen ilmoittautumista (ei koske sairaita kontrolleja)
- Hänellä on diabetes mellitus, joka vaikuttaa tuberkuloosiin, hoitovasteeseen ja mikrobiomiin
- Bronkoskopialla on vasta-aihe (esim. FEV1 <70 %), jonka bronkoskopistit ovat määrittäneet parhaiden käytäntöjen ohjeiden mukaisesti
- Alkoholin päivittäinen saanti on yli 6 olutta tai 4 sekoitettua juomaa
- Onko raskaana (kaupallinen ihmisen koriongonadotropiinin määritys tehdään valmistajan virtsaa koskevien ohjeiden mukaisesti) tai raskautta suunnitellaan seurantajaksoksi
- Viimeaikainen sairaalahoito mistä tahansa syystä
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Kohortti
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
TB-tapaukset
|
|
Terveiden kotitalouksien yhteystiedot
|
|
Sairaat kontrollit
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Mikrobiootan muutosten karakterisointi sairaiden ja ei-sairaiden keuhkojen segmenteissä HIV-statuksen mukaan ositettuna.
Aikaikkuna: Jopa 18 kuukautta
|
Keuhkojen mikrobiomi sairaissa ja ei-sairaissa segmenteissä määritettynä 16S rRNA-geenisekvensoinnilla.
|
Jopa 18 kuukautta
|
|
Spesifisten mikrobitaksonien assosiaatio sairaissa segmenteissä kohonneiden SCFA-arvojen ja heikentyneen isännän tulehduksen ja kudoksen korjaamisen biomarkkerien kanssa.
Aikaikkuna: Jopa 18 kuukautta
|
Spesifisten sytokiinien korrelaatioanalyysi, joka on profiloitu käyttämällä kaupallisia multipleksoituja Luminex-paneeleja ja SCFA:ita, jotka on mitattu käyttämällä kaasukromatografia-massaspektrometria (GC-MS) -määrityksiä.
|
Jopa 18 kuukautta
|
|
Arvioi hoidon vaikutus keuhkojen mikrobiomiin.
Aikaikkuna: Jopa 18 kuukautta
|
Kuvaile bakteeriyhteisön resilienssiä mikrobien ja isännän biomarkkereiden muutosten ohella.
|
Jopa 18 kuukautta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Grant Theron, PhD, University of Stellenbosch
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Yatsunenko T, Rey FE, Manary MJ, Trehan I, Dominguez-Bello MG, Contreras M, Magris M, Hidalgo G, Baldassano RN, Anokhin AP, Heath AC, Warner B, Reeder J, Kuczynski J, Caporaso JG, Lozupone CA, Lauber C, Clemente JC, Knights D, Knight R, Gordon JI. Human gut microbiome viewed across age and geography. Nature. 2012 May 9;486(7402):222-7. doi: 10.1038/nature11053.
- Shenoy MK, Iwai S, Lin DL, Worodria W, Ayakaka I, Byanyima P, Kaswabuli S, Fong S, Stone S, Chang E, Davis JL, Faruqi AA, Segal MR, Huang L, Lynch SV. Immune Response and Mortality Risk Relate to Distinct Lung Microbiomes in Patients with HIV and Pneumonia. Am J Respir Crit Care Med. 2017 Jan 1;195(1):104-114. doi: 10.1164/rccm.201603-0523OC.
- Wipperman MF, Fitzgerald DW, Juste MAJ, Taur Y, Namasivayam S, Sher A, Bean JM, Bucci V, Glickman MS. Antibiotic treatment for Tuberculosis induces a profound dysbiosis of the microbiome that persists long after therapy is completed. Sci Rep. 2017 Sep 7;7(1):10767. doi: 10.1038/s41598-017-10346-6.
- Botero LE, Delgado-Serrano L, Cepeda ML, Bustos JR, Anzola JM, Del Portillo P, Robledo J, Zambrano MM. Respiratory tract clinical sample selection for microbiota analysis in patients with pulmonary tuberculosis. Microbiome. 2014 Aug 25;2:29. doi: 10.1186/2049-2618-2-29. eCollection 2014.
- Cheung MK, Lam WY, Fung WY, Law PT, Au CH, Nong W, Kam KM, Kwan HS, Tsui SK. Sputum microbiota in tuberculosis as revealed by 16S rRNA pyrosequencing. PLoS One. 2013;8(1):e54574. doi: 10.1371/journal.pone.0054574. Epub 2013 Jan 24.
- Cui Z, Zhou Y, Li H, Zhang Y, Zhang S, Tang S, Guo X. Complex sputum microbial composition in patients with pulmonary tuberculosis. BMC Microbiol. 2012 Nov 23;12:276. doi: 10.1186/1471-2180-12-276.
- Segal LN, Clemente JC, Tsay JC, Koralov SB, Keller BC, Wu BG, Li Y, Shen N, Ghedin E, Morris A, Diaz P, Huang L, Wikoff WR, Ubeda C, Artacho A, Rom WN, Sterman DH, Collman RG, Blaser MJ, Weiden MD. Enrichment of the lung microbiome with oral taxa is associated with lung inflammation of a Th17 phenotype. Nat Microbiol. 2016 Apr 4;1:16031. doi: 10.1038/nmicrobiol.2016.31.
- Naidoo CC, Nyawo GR, Wu BG, Walzl G, Warren RM, Segal LN, Theron G. The microbiome and tuberculosis: state of the art, potential applications, and defining the clinical research agenda. Lancet Respir Med. 2019 Oct;7(10):892-906. doi: 10.1016/S2213-2600(18)30501-0. Epub 2019 Mar 22.
- Wade WG. The oral microbiome in health and disease. Pharmacol Res. 2013 Mar;69(1):137-43. doi: 10.1016/j.phrs.2012.11.006. Epub 2012 Nov 28.
- Grice EA, Kong HH, Renaud G, Young AC; NISC Comparative Sequencing Program; Bouffard GG, Blakesley RW, Wolfsberg TG, Turner ML, Segre JA. A diversity profile of the human skin microbiota. Genome Res. 2008 Jul;18(7):1043-50. doi: 10.1101/gr.075549.107. Epub 2008 May 23.
- Weiner J 3rd, Parida SK, Maertzdorf J, Black GF, Repsilber D, Telaar A, Mohney RP, Arndt-Sullivan C, Ganoza CA, Fae KC, Walzl G, Kaufmann SH. Biomarkers of inflammation, immunosuppression and stress with active disease are revealed by metabolomic profiling of tuberculosis patients. PLoS One. 2012;7(7):e40221. doi: 10.1371/journal.pone.0040221. Epub 2012 Jul 23.
- Segal LN, Alekseyenko AV, Clemente JC, Kulkarni R, Wu B, Gao Z, Chen H, Berger KI, Goldring RM, Rom WN, Blaser MJ, Weiden MD. Enrichment of lung microbiome with supraglottic taxa is associated with increased pulmonary inflammation. Microbiome. 2013 Jul 1;1(1):19. doi: 10.1186/2049-2618-1-19.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Veren välityksellä leviävät infektiot
- Piilevä infektio
- Urogenitaaliset sairaudet
- Sukuelinten sairaudet
- Immuunijärjestelmän sairaudet
- Infektiot
- RNA-virusinfektiot
- Virussairaudet
- Tartuntataudit
- Sukupuolitaudit, virus
- Sukupuolitaudit
- Lentivirus-infektiot
- Retroviridae-infektiot
- Immunologiset puutosoireyhtymät
- Hitaat virustaudit
- Gram-positiiviset bakteeri-infektiot
- Bakteeri-infektiot
- Bakteeri-infektiot ja mykoosit
- Actinomycetales -infektiot
- Mycobacterium-infektiot
- HIV-infektiot
- Tuberkuloosi
- Immuunikato
- Piilevä tuberkuloosi
Muut tutkimustunnusnumerot
- N19/09/126
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
IPD-jaon aikakehys
IPD-jaon käyttöoikeuskriteerit
IPD-jakamista tukeva tietotyyppi
- STUDY_PROTOCOL
- MAHLA
- ICF
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Yhdysvalloissa valmistettu ja sieltä viety tuote
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .