- ICH GCP
- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT04700579
Microbiote pulmonaire avant et après traitement, métabolome et signatures immunitaires au site de la maladie chez les patients atteints de tuberculose pulmonaire active (TB-LUNG)
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Description détaillée
Le corps humain est l'hôte de communautés microbiennes complexes sur différents sites anatomiques tels que l'intestin, la cavité buccale, le vagin, la peau et les voies respiratoires inférieures - un site que l'on croyait auparavant stérile. De plus en plus de preuves ont impliqué le rôle du microbiome humain dans diverses maladies, par exemple, les communautés pulmonaires enrichies en Prevotella chez les patients séropositifs atteints de pneumonie prédisent indépendamment la mortalité à 70 jours, et le microbiome intestinal murin enrichi en Lactobacillus atténue les symptômes de type asthmatique. Cependant, malgré l'ampleur et la gravité de la tuberculose, il existe peu d'études sur le microbiome dans les cas de tuberculose, le site de la maladie et l'effet du traitement, en particulier dans le contexte du VIH. Ces principales lacunes dans les connaissances empêchent la conception et l'évaluation d'interventions qui pourraient cibler le microbiome et éviter les mauvais résultats du traitement de la tuberculose.
À ce jour, les quelques études sur le microbiome dans la tuberculose se sont concentrées sur les voies respiratoires supérieures (à l'aide d'échantillons tels que les expectorations) et l'intestin plutôt que sur le site de la maladie qui, dans la tuberculose, est généralement le poumon. Ces études ont montré des associations entre le microbiome et l'état de la maladie. Par exemple, des souris colonisées par Helicobacter hepaticus dans l'intestin présentent un mauvais contrôle de la croissance mycobactérienne, une inflammation accrue et une pathologie tissulaire sévère dans les poumons. Le poumon qui est le site de la maladie dans la tuberculose pulmonaire a été largement considéré comme stérile jusqu'à récemment et le microbiome pulmonaire reste largement sous-étudié dans la tuberculose, quel que soit l'impact potentiel qu'il pourrait avoir sur la pathogenèse de la tuberculose. L'une des principales raisons pour lesquelles le poumon est sous-étudié est la difficulté d'échantillonnage du poumon. Les chercheurs mettront en œuvre une procédure de bronchoscopie modifiée pour éviter la contamination croisée microbienne des sites anatomiques voisins (y compris des parties malades aux parties saines des poumons) et pour échantillonner avec précision la faible biomasse dans l'espace bronchoalvéolaire. Les enquêteurs émettent l'hypothèse que les cas de tuberculose ont un microbiote pulmonaire distinct du site de la maladie par rapport au tissu controlatéral non malade, caractérisé par un enrichissement en fermenteurs anaérobies oraux, AGCC, et des biomarqueurs d'inflammation et de réparation tissulaire altérés. Ils s'attendent également à ce que les biomarqueurs microbiens et hôtes soient modifiés par le traitement de la tuberculose. Une étude menée par l'un des chercheurs a déjà démontré que des microbiomes pulmonaires enrichis en taxons oraux anaérobies sont associés à une inflammation pulmonaire de phénotype Th17. Il a également été démontré que les produits du métabolisme anaérobie microbien modulent la réponse immunitaire aux maladies. Les chercheurs mettront en corrélation les communautés microbiennes complexes au site de la maladie dans la tuberculose avec les biomarqueurs microbiens et hôtes au site de la maladie.
L'étude recrutera des patients déclarant eux-mêmes leur premier épisode de tuberculose et une tuberculose confirmée par Xpert MTB/RIF Ultra dans les cliniques de soins primaires de Scottsdene et Wallacedene au Cap. Un total de 50 cas de tuberculose également stratifiés selon le statut VIH et 50 contacts familiaux sains (HHC) également stratifiés selon le VIH seront recrutés. En plus des séronégatifs pour le VIH, l'étude recrute un nombre égal de cas de tuberculose séropositifs traités par ART, car il existe une sous-population épidémiologiquement importante avec une immunité pulmonaire altérée. 50 témoins malades supplémentaires atteints d'autres maladies pulmonaires (asthme, maladie pulmonaire obstructive chronique (MPOC), cancer, bronchectasie (y compris post-TB) et pneumonie) seront recrutés comme groupes de comparaison.
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Grant Theron, PhD
- Numéro de téléphone: (+27) 021 938 9693
- E-mail: gtheron@sun.ac.za
Sauvegarde des contacts de l'étude
- Nom: Charissa Naidoo, PhD
- Numéro de téléphone: (+27) 0219389955
- E-mail: ccnaidoo@sun.ac.za
Lieux d'étude
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-
Western Cape
-
Cape Town, Western Cape, Afrique du Sud, 7570
- Recrutement
- Kraaifontein Community Health Centre
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Contact:
- Grant Theron, PhD
- Numéro de téléphone: 9693 (+27) 21 938 9693
- E-mail: gtheron@sun.ac.za
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Contact:
- Tinaye Chiyaka, PhD
- Numéro de téléphone: 9954 (+27) 21 938 9954
- E-mail: tinayechiyaka@sun.ac.za
-
Cape Town, Western Cape, Afrique du Sud, 7570
- Recrutement
- Scottsdene Clinic
-
Contact:
- Grant Theron, PhD
- Numéro de téléphone: 9693 (+27) 21 938 9693
- E-mail: gtheron@sun.ac.za
-
Contact:
- Tinaye Chiyaka, PhD
- Numéro de téléphone: 9954 (+27) 21 938 9954
- E-mail: tinayechiyaka@sun.ac.za
-
Cape Town, Western Cape, Afrique du Sud, 7570
- Recrutement
- Wallacedene Clinic
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Contact:
- Grant Theron, PhD
- Numéro de téléphone: 9693 (+27) 21 938 9693
- E-mail: gtheron@sun.ac.za
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Contact:
- Tinaye WP Chiyaka, PhD
- Numéro de téléphone: 9954 (+27) 21 938 9954
- E-mail: tinayechiyaka@sun.ac.za
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- 18-60 ans.
- Accepter de subir une radiographie et/ou un scanner.
- A une maladie tuberculeuse unilatérale définie comme un poumon avec de nombreuses preuves de maladie tuberculeuse (non applicable aux témoins sains ; les témoins malades nécessiteront un autre diagnostic).
- Aucune preuve de traitement antituberculeux antérieur et/ou CXR/CT n'a pas de preuve évidente de TB antérieure.
- Disposé à subir une bronchoscopie de recherche au départ, 6 mois et 18 mois et susceptible de rester dans la région pendant la période d'étude.
- Si séropositif, doit être stable sous traitement antirétroviral (ART) pendant ≥ 1 an.
- Capable et désireux de revenir pour des visites de suivi, sans intention de déménager dans un proche avenir.
- Disposé à se conformer aux exigences de l'étude, c'est-à-dire la fourniture de coordonnées et un consentement écrit et éclairé avant l'inscription.
Critère d'exclusion:
- Moins de 18 ans ou plus de 60 ans.
- A déjà commencé un traitement antituberculeux.
- Résistant à la rifampicine.
- A des antécédents de tuberculose.
- Tuberculose bilatérale définie comme les deux poumons atteints de tuberculose étendue
- A reçu des probiotiques, des antibiotiques ou des stéroïdes inhalés dans les trois mois précédant l'inscription (non applicable aux témoins malades)
- A un diabète sucré, qui affecte la tuberculose, la réponse au traitement et le microbiome
- A une contre-indication pour la bronchoscopie (par exemple, VEMS <70 %), tel que déterminé par les bronchoscopistes conformément aux lignes directrices sur les meilleures pratiques
- A une consommation quotidienne d'alcool de plus de 6 bières ou 4 cocktails
- Est enceinte (un dosage commercial de détermination de la gonadotrophine chorionique humaine sera effectué conformément aux directives du fabricant sur l'urine) ou une grossesse est prévue pour la période de suivi
- Hospitalisation récente pour quelque raison que ce soit
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cohorte
- Perspectives temporelles: Éventuel
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
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Cas de tuberculose
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Contacts familiaux sains
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Contrôles malades
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Caractérisation des changements du microbiote dans les segments pulmonaires malades et non malades, stratifiés selon le statut VIH.
Délai: Jusqu'à 18 mois
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Microbiome pulmonaire dans les segments malades et non malades déterminé par séquençage du gène ARNr 16S.
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Jusqu'à 18 mois
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Association de taxons microbiens spécifiques dans les segments malades avec des AGCC élevés et des biomarqueurs d'inflammation de l'hôte et de réparation tissulaire altérés.
Délai: Jusqu'à 18 mois
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Analyse de corrélation de cytokines spécifiques profilées à l'aide de panels Luminex multiplexés commerciaux et d'AGCC mesurés à l'aide d'essais de chromatographie en phase gazeuse-spectrométrie de masse (GC-MS).
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Jusqu'à 18 mois
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Évaluer l'impact du traitement sur le microbiome pulmonaire.
Délai: Jusqu'à 18 mois
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Caractérisez la résilience de la communauté bactérienne parallèlement aux changements dans les biomarqueurs microbiens et hôtes.
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Jusqu'à 18 mois
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Grant Theron, PhD, University of Stellenbosch
Publications et liens utiles
Publications générales
- Yatsunenko T, Rey FE, Manary MJ, Trehan I, Dominguez-Bello MG, Contreras M, Magris M, Hidalgo G, Baldassano RN, Anokhin AP, Heath AC, Warner B, Reeder J, Kuczynski J, Caporaso JG, Lozupone CA, Lauber C, Clemente JC, Knights D, Knight R, Gordon JI. Human gut microbiome viewed across age and geography. Nature. 2012 May 9;486(7402):222-7. doi: 10.1038/nature11053.
- Shenoy MK, Iwai S, Lin DL, Worodria W, Ayakaka I, Byanyima P, Kaswabuli S, Fong S, Stone S, Chang E, Davis JL, Faruqi AA, Segal MR, Huang L, Lynch SV. Immune Response and Mortality Risk Relate to Distinct Lung Microbiomes in Patients with HIV and Pneumonia. Am J Respir Crit Care Med. 2017 Jan 1;195(1):104-114. doi: 10.1164/rccm.201603-0523OC.
- Wipperman MF, Fitzgerald DW, Juste MAJ, Taur Y, Namasivayam S, Sher A, Bean JM, Bucci V, Glickman MS. Antibiotic treatment for Tuberculosis induces a profound dysbiosis of the microbiome that persists long after therapy is completed. Sci Rep. 2017 Sep 7;7(1):10767. doi: 10.1038/s41598-017-10346-6.
- Botero LE, Delgado-Serrano L, Cepeda ML, Bustos JR, Anzola JM, Del Portillo P, Robledo J, Zambrano MM. Respiratory tract clinical sample selection for microbiota analysis in patients with pulmonary tuberculosis. Microbiome. 2014 Aug 25;2:29. doi: 10.1186/2049-2618-2-29. eCollection 2014.
- Cheung MK, Lam WY, Fung WY, Law PT, Au CH, Nong W, Kam KM, Kwan HS, Tsui SK. Sputum microbiota in tuberculosis as revealed by 16S rRNA pyrosequencing. PLoS One. 2013;8(1):e54574. doi: 10.1371/journal.pone.0054574. Epub 2013 Jan 24.
- Cui Z, Zhou Y, Li H, Zhang Y, Zhang S, Tang S, Guo X. Complex sputum microbial composition in patients with pulmonary tuberculosis. BMC Microbiol. 2012 Nov 23;12:276. doi: 10.1186/1471-2180-12-276.
- Segal LN, Clemente JC, Tsay JC, Koralov SB, Keller BC, Wu BG, Li Y, Shen N, Ghedin E, Morris A, Diaz P, Huang L, Wikoff WR, Ubeda C, Artacho A, Rom WN, Sterman DH, Collman RG, Blaser MJ, Weiden MD. Enrichment of the lung microbiome with oral taxa is associated with lung inflammation of a Th17 phenotype. Nat Microbiol. 2016 Apr 4;1:16031. doi: 10.1038/nmicrobiol.2016.31.
- Naidoo CC, Nyawo GR, Wu BG, Walzl G, Warren RM, Segal LN, Theron G. The microbiome and tuberculosis: state of the art, potential applications, and defining the clinical research agenda. Lancet Respir Med. 2019 Oct;7(10):892-906. doi: 10.1016/S2213-2600(18)30501-0. Epub 2019 Mar 22.
- Wade WG. The oral microbiome in health and disease. Pharmacol Res. 2013 Mar;69(1):137-43. doi: 10.1016/j.phrs.2012.11.006. Epub 2012 Nov 28.
- Grice EA, Kong HH, Renaud G, Young AC; NISC Comparative Sequencing Program; Bouffard GG, Blakesley RW, Wolfsberg TG, Turner ML, Segre JA. A diversity profile of the human skin microbiota. Genome Res. 2008 Jul;18(7):1043-50. doi: 10.1101/gr.075549.107. Epub 2008 May 23.
- Weiner J 3rd, Parida SK, Maertzdorf J, Black GF, Repsilber D, Telaar A, Mohney RP, Arndt-Sullivan C, Ganoza CA, Fae KC, Walzl G, Kaufmann SH. Biomarkers of inflammation, immunosuppression and stress with active disease are revealed by metabolomic profiling of tuberculosis patients. PLoS One. 2012;7(7):e40221. doi: 10.1371/journal.pone.0040221. Epub 2012 Jul 23.
- Segal LN, Alekseyenko AV, Clemente JC, Kulkarni R, Wu B, Gao Z, Chen H, Berger KI, Goldring RM, Rom WN, Blaser MJ, Weiden MD. Enrichment of lung microbiome with supraglottic taxa is associated with increased pulmonary inflammation. Microbiome. 2013 Jul 1;1(1):19. doi: 10.1186/2049-2618-1-19.
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Estimé)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
- Infections transmissibles par le sang
- Infection latente
- Maladies urogénitales
- Maladies génitales
- Maladies du système immunitaire
- Infections
- Infections par virus à ARN
- Maladies virales
- Maladies transmissibles
- Maladies sexuellement transmissibles, virales
- Maladies sexuellement transmissibles
- Infections à lentivirus
- Infections à rétroviridae
- Syndromes d'immunodéficience
- Maladies à virus lents
- Infections bactériennes à Gram positif
- Infections bactériennes
- Infections bactériennes et mycoses
- Infections à Actinomycétales
- Infections à mycobactéries
- Infections à VIH
- Tuberculose
- Syndrome immunodéficitaire acquis
- Tuberculose latente
Autres numéros d'identification d'étude
- N19/09/126
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
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Description du régime IPD
Délai de partage IPD
Critères d'accès au partage IPD
Type d'informations de prise en charge du partage d'IPD
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- CIF
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Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
produit fabriqué et exporté des États-Unis.
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