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Microbiote pulmonaire avant et après traitement, métabolome et signatures immunitaires au site de la maladie chez les patients atteints de tuberculose pulmonaire active (TB-LUNG)

29 avril 2026 mis à jour par: Grant Theron, University of Stellenbosch
Les diverses communautés microbiennes dans différentes parties du corps humain (microbiome) sont importantes pour la santé mais sous-étudiées dans la tuberculose pulmonaire (TB), qui est la principale cause infectieuse de décès dans le monde. Les chercheurs étudieront le microbiome du site de la maladie (dans l'espace bronchoalvéolaire pulmonaire) chez les cas de tuberculose afin d'étudier comment, avant le traitement de la tuberculose, les composés métaboliques fabriqués par les microbes affectent les biomarqueurs de l'hôte importants pour le contrôle de la tuberculose. Les enquêteurs reposeront cette question à la fin du traitement et un an plus tard. Plus précisément, les enquêteurs échantillonneront le poumon au point chaud de la tuberculose active identifié par imagerie et le compareront à un segment pulmonaire non impliqué, généralement dans le poumon opposé. Les chercheurs compareront le microbiome pulmonaire à d'autres sites du corps (c.-à-d. cavité buccale, nasopharynx, supraglotte et intestin). Une petite quantité de sang (~ 15 ml) sera prélevée pour évaluer les corrélats immunologiques périphériques du microbiome hôte. Des brossages d'échantillons protégés du poumon seront utilisés pour explorer les signatures transcriptomiques et leur relation avec le microbiome pulmonaire. Les enquêteurs appliqueront également ces questions au même nombre de témoins (patients sains et patients avec un autre diagnostic). Cela jettera les bases d'essais cliniques pour évaluer si des bactéries spécifiques ont un potentiel diagnostique (par exemple, PCR) ou thérapeutique (par exemple, antibiotiques, prébiotiques, probiotiques, vaccins) où le ciblage du microbiome pourrait améliorer les résultats cliniques.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Description détaillée

Le corps humain est l'hôte de communautés microbiennes complexes sur différents sites anatomiques tels que l'intestin, la cavité buccale, le vagin, la peau et les voies respiratoires inférieures - un site que l'on croyait auparavant stérile. De plus en plus de preuves ont impliqué le rôle du microbiome humain dans diverses maladies, par exemple, les communautés pulmonaires enrichies en Prevotella chez les patients séropositifs atteints de pneumonie prédisent indépendamment la mortalité à 70 jours, et le microbiome intestinal murin enrichi en Lactobacillus atténue les symptômes de type asthmatique. Cependant, malgré l'ampleur et la gravité de la tuberculose, il existe peu d'études sur le microbiome dans les cas de tuberculose, le site de la maladie et l'effet du traitement, en particulier dans le contexte du VIH. Ces principales lacunes dans les connaissances empêchent la conception et l'évaluation d'interventions qui pourraient cibler le microbiome et éviter les mauvais résultats du traitement de la tuberculose.

À ce jour, les quelques études sur le microbiome dans la tuberculose se sont concentrées sur les voies respiratoires supérieures (à l'aide d'échantillons tels que les expectorations) et l'intestin plutôt que sur le site de la maladie qui, dans la tuberculose, est généralement le poumon. Ces études ont montré des associations entre le microbiome et l'état de la maladie. Par exemple, des souris colonisées par Helicobacter hepaticus dans l'intestin présentent un mauvais contrôle de la croissance mycobactérienne, une inflammation accrue et une pathologie tissulaire sévère dans les poumons. Le poumon qui est le site de la maladie dans la tuberculose pulmonaire a été largement considéré comme stérile jusqu'à récemment et le microbiome pulmonaire reste largement sous-étudié dans la tuberculose, quel que soit l'impact potentiel qu'il pourrait avoir sur la pathogenèse de la tuberculose. L'une des principales raisons pour lesquelles le poumon est sous-étudié est la difficulté d'échantillonnage du poumon. Les chercheurs mettront en œuvre une procédure de bronchoscopie modifiée pour éviter la contamination croisée microbienne des sites anatomiques voisins (y compris des parties malades aux parties saines des poumons) et pour échantillonner avec précision la faible biomasse dans l'espace bronchoalvéolaire. Les enquêteurs émettent l'hypothèse que les cas de tuberculose ont un microbiote pulmonaire distinct du site de la maladie par rapport au tissu controlatéral non malade, caractérisé par un enrichissement en fermenteurs anaérobies oraux, AGCC, et des biomarqueurs d'inflammation et de réparation tissulaire altérés. Ils s'attendent également à ce que les biomarqueurs microbiens et hôtes soient modifiés par le traitement de la tuberculose. Une étude menée par l'un des chercheurs a déjà démontré que des microbiomes pulmonaires enrichis en taxons oraux anaérobies sont associés à une inflammation pulmonaire de phénotype Th17. Il a également été démontré que les produits du métabolisme anaérobie microbien modulent la réponse immunitaire aux maladies. Les chercheurs mettront en corrélation les communautés microbiennes complexes au site de la maladie dans la tuberculose avec les biomarqueurs microbiens et hôtes au site de la maladie.

L'étude recrutera des patients déclarant eux-mêmes leur premier épisode de tuberculose et une tuberculose confirmée par Xpert MTB/RIF Ultra dans les cliniques de soins primaires de Scottsdene et Wallacedene au Cap. Un total de 50 cas de tuberculose également stratifiés selon le statut VIH et 50 contacts familiaux sains (HHC) également stratifiés selon le VIH seront recrutés. En plus des séronégatifs pour le VIH, l'étude recrute un nombre égal de cas de tuberculose séropositifs traités par ART, car il existe une sous-population épidémiologiquement importante avec une immunité pulmonaire altérée. 50 témoins malades supplémentaires atteints d'autres maladies pulmonaires (asthme, maladie pulmonaire obstructive chronique (MPOC), cancer, bronchectasie (y compris post-TB) et pneumonie) seront recrutés comme groupes de comparaison.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

150

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

  • Nom: Grant Theron, PhD
  • Numéro de téléphone: (+27) 021 938 9693
  • E-mail: gtheron@sun.ac.za

Sauvegarde des contacts de l'étude

  • Nom: Charissa Naidoo, PhD
  • Numéro de téléphone: (+27) 0219389955
  • E-mail: ccnaidoo@sun.ac.za

Lieux d'étude

  • Afrique du Sud
    • Western Cape
      • Cape Town, Western Cape, Afrique du Sud, 7570
        • Recrutement
        • Kraaifontein Community Health Centre
        • Contact:
          • Grant Theron, PhD
          • Numéro de téléphone: 9693 (+27) 21 938 9693
          • E-mail: gtheron@sun.ac.za
        • Contact:
      • Cape Town, Western Cape, Afrique du Sud, 7570
        • Recrutement
        • Scottsdene Clinic
        • Contact:
          • Grant Theron, PhD
          • Numéro de téléphone: 9693 (+27) 21 938 9693
          • E-mail: gtheron@sun.ac.za
        • Contact:
      • Cape Town, Western Cape, Afrique du Sud, 7570
        • Recrutement
        • Wallacedene Clinic
        • Contact:
          • Grant Theron, PhD
          • Numéro de téléphone: 9693 (+27) 21 938 9693
          • E-mail: gtheron@sun.ac.za
        • Contact:

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans à 60 ans (Adulte)

Accepte les volontaires sains

Oui

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Les patients se présentant eux-mêmes avec une tuberculose Xpert MTB/RIF Ultra-confirmée (n = 50, également stratifiés selon le VIH) et les HHC négatifs à la culture (n = 50, également stratifiés selon le VIH) seront recrutés dans des cliniques de soins primaires (Scottsdene et Wallacedene) à Le Cap, Afrique du Sud. 50 autres témoins malades atteints d'autres maladies pulmonaires seront référés par l'hôpital universitaire de Tygerberg.

La description

Critère d'intégration:

  • 18-60 ans.
  • Accepter de subir une radiographie et/ou un scanner.
  • A une maladie tuberculeuse unilatérale définie comme un poumon avec de nombreuses preuves de maladie tuberculeuse (non applicable aux témoins sains ; les témoins malades nécessiteront un autre diagnostic).
  • Aucune preuve de traitement antituberculeux antérieur et/ou CXR/CT n'a pas de preuve évidente de TB antérieure.
  • Disposé à subir une bronchoscopie de recherche au départ, 6 mois et 18 mois et susceptible de rester dans la région pendant la période d'étude.
  • Si séropositif, doit être stable sous traitement antirétroviral (ART) pendant ≥ 1 an.
  • Capable et désireux de revenir pour des visites de suivi, sans intention de déménager dans un proche avenir.
  • Disposé à se conformer aux exigences de l'étude, c'est-à-dire la fourniture de coordonnées et un consentement écrit et éclairé avant l'inscription.

Critère d'exclusion:

  • Moins de 18 ans ou plus de 60 ans.
  • A déjà commencé un traitement antituberculeux.
  • Résistant à la rifampicine.
  • A des antécédents de tuberculose.
  • Tuberculose bilatérale définie comme les deux poumons atteints de tuberculose étendue
  • A reçu des probiotiques, des antibiotiques ou des stéroïdes inhalés dans les trois mois précédant l'inscription (non applicable aux témoins malades)
  • A un diabète sucré, qui affecte la tuberculose, la réponse au traitement et le microbiome
  • A une contre-indication pour la bronchoscopie (par exemple, VEMS <70 %), tel que déterminé par les bronchoscopistes conformément aux lignes directrices sur les meilleures pratiques
  • A une consommation quotidienne d'alcool de plus de 6 bières ou 4 cocktails
  • Est enceinte (un dosage commercial de détermination de la gonadotrophine chorionique humaine sera effectué conformément aux directives du fabricant sur l'urine) ou une grossesse est prévue pour la période de suivi
  • Hospitalisation récente pour quelque raison que ce soit

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Modèles d'observation: Cohorte
  • Perspectives temporelles: Éventuel

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Cas de tuberculose
  • n= 50 (25 séropositifs et 25 séronégatifs)
  • Xpert MTB/RIF TB ultra-confirmée
Contacts familiaux sains
  • n= (25 séropositifs et 25 séronégatifs)
  • Résultat TB négatif à la culture
Contrôles malades
  • n=50
  • Maladies : asthme, maladie pulmonaire obstructive chronique (MPOC), cancer, bronchectasie (y compris post-TB) et pneumonie

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Caractérisation des changements du microbiote dans les segments pulmonaires malades et non malades, stratifiés selon le statut VIH.
Délai: Jusqu'à 18 mois
Microbiome pulmonaire dans les segments malades et non malades déterminé par séquençage du gène ARNr 16S.
Jusqu'à 18 mois
Association de taxons microbiens spécifiques dans les segments malades avec des AGCC élevés et des biomarqueurs d'inflammation de l'hôte et de réparation tissulaire altérés.
Délai: Jusqu'à 18 mois
Analyse de corrélation de cytokines spécifiques profilées à l'aide de panels Luminex multiplexés commerciaux et d'AGCC mesurés à l'aide d'essais de chromatographie en phase gazeuse-spectrométrie de masse (GC-MS).
Jusqu'à 18 mois
Évaluer l'impact du traitement sur le microbiome pulmonaire.
Délai: Jusqu'à 18 mois
Caractérisez la résilience de la communauté bactérienne parallèlement aux changements dans les biomarqueurs microbiens et hôtes.
Jusqu'à 18 mois

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

University of Stellenbosch

Collaborateurs

New York University

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Grant Theron, PhD, University of Stellenbosch

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

4 mars 2021

Achèvement primaire (Estimé)

31 décembre 2026

Achèvement de l'étude (Estimé)

31 décembre 2027

Dates d'inscription aux études

Première soumission

28 décembre 2020

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

6 janvier 2021

Première publication (Réel)

8 janvier 2021

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

6 mai 2026

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

29 avril 2026

Dernière vérification

1 avril 2026

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • N19/09/126

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

OUI

Description du régime IPD

Les collaborateurs auront accès à des données IPD anonymisées. Les autres chercheurs souhaitant accéder aux données devront signer une entente de partage de données conformément aux politiques institutionnelles.

Délai de partage IPD

Les données seront disponibles une fois les résultats publiés.

Critères d'accès au partage IPD

L'accès aux données sera accordé aux collaborateurs et aux parties intéressées par le partage de fichiers de données ou d'informations de connexion à la base de données électronique sécurisée RedCap de l'étude au cours du recrutement des patients.

Type d'informations de prise en charge du partage d'IPD

  • PROTOCOLE D'ÉTUDE
  • SÈVE
  • CIF

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

produit fabriqué et exporté des États-Unis.

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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