Микробиота легких до и после лечения, метаболомы и иммунные сигнатуры в очаге заболевания у пациентов с активным туберкулезом легких (TB-LUNG)
Обзор исследования
Статус
Условия
Подробное описание
Человеческое тело является хозяином сложных микробных сообществ в различных анатомических участках, таких как кишечник, полость рта, влагалище, кожа и нижние дыхательные пути — места, ранее считавшиеся стерильными. Растущее количество данных указывает на роль микробиома человека в различных заболеваниях, например, обогащенные Prevotella легочные сообщества у ВИЧ-положительных пациентов с пневмонией независимо предсказывают 70-дневную смертность, а обогащенный Lactobacillus кишечный микробиом мыши облегчает астматические симптомы. Однако, несмотря на масштабы и тяжесть ТБ, исследований микробиома при ТБ, локализации заболевания и эффективности лечения, особенно в контексте ВИЧ, немного. Эти ключевые пробелы в знаниях препятствуют разработке и оценке вмешательств, которые могли бы воздействовать на микробиом и предотвращать неблагоприятные результаты лечения ТБ.
На сегодняшний день несколько исследований микробиома при ТБ были сосредоточены на верхних дыхательных путях (с использованием таких образцов, как мокрота) и кишечнике, а не на очаге заболевания, которым при ТБ обычно являются легкие. Эти исследования показали связь между микробиомом и состоянием болезни. Например, мыши, колонизированные Helicobacter hepaticus в кишечнике, демонстрируют плохой контроль роста микобактерий, повышенное воспаление и тяжелую патологию тканей в легких. Легкие, являющиеся местом поражения при туберкулезе легких, до недавнего времени широко считались стерильными, а микробиом легких остается малоизученным при туберкулезе, независимо от потенциального влияния, которое он может оказывать на патогенез туберкулеза. Одной из основных причин, по которой легкие недостаточно изучены, является сложность взятия образцов легких. Исследователи будут внедрять модифицированную процедуру бронхоскопии, чтобы избежать перекрестного микробного загрязнения из соседних анатомических участков (в том числе из больных в здоровые части легких) и для точного отбора образцов низкой биомассы в бронхоальвеолярном пространстве. Исследователи выдвигают гипотезу о том, что у больных туберкулезом микробиота легких в месте заболевания отличается от микробиоты не пораженной ткани контралатеральной ткани, характеризующейся обогащением пероральными анаэробными ферментами, SCFAs, а также нарушением биомаркеров воспаления и восстановления тканей. Они также ожидают, что микробные биомаркеры и биомаркеры хозяина будут изменены при лечении туберкулеза. Исследование одного из исследователей уже продемонстрировало, что микробиомы легких, обогащенные анаэробными оральными таксонами, связаны с воспалением легких фенотипа Th17. Также было показано, что продукты микробного анаэробного метаболизма модулируют иммунный ответ на заболевания. Исследователи будут сопоставлять сложные микробные сообщества в очаге заболевания туберкулезом с биомаркерами микробов и хозяина в очаге заболевания.
В исследовании будут участвовать пациенты с первым эпизодом ТБ и ультраподтвержденным ТБ с помощью Xpert MTB/RIF из клиник первичной медико-санитарной помощи Скоттсден и Уолласеден в Кейптауне, сообщающие о себе. Всего будет набрано 50 случаев ТБ, в равной степени стратифицированных по ВИЧ-статусу, и 50 здоровых лиц, контактировавших с домохозяйствами (СКД), также стратифицированных по ВИЧ. В дополнение к ВИЧ-отрицательным в исследование включено равное количество ВИЧ-позитивных больных туберкулезом, получающих АРТ, поскольку существует эпидемиологически важная субпопуляция с ослабленным легочным иммунитетом. Дополнительные 50 контрольных больных с другими легочными заболеваниями (астма, хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ), рак, бронхоэктазы (включая пост-ТБ) и пневмония) будут набраны в качестве контрольных групп.
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Grant Theron, PhD
- Номер телефона: (+27) 021 938 9693
- Электронная почта: gtheron@sun.ac.za
Учебное резервное копирование контактов
- Имя: Charissa Naidoo, PhD
- Номер телефона: (+27) 0219389955
- Электронная почта: ccnaidoo@sun.ac.za
Места учебы
-
-
Western Cape
-
Cape Town, Western Cape, Южная Африка, 7570
- Рекрутинг
- Kraaifontein Community Health Centre
-
Контакт:
- Grant Theron, PhD
- Номер телефона: 9693 (+27) 21 938 9693
- Электронная почта: gtheron@sun.ac.za
-
Контакт:
- Tinaye Chiyaka, PhD
- Номер телефона: 9954 (+27) 21 938 9954
- Электронная почта: tinayechiyaka@sun.ac.za
-
Cape Town, Western Cape, Южная Африка, 7570
- Рекрутинг
- Scottsdene Clinic
-
Контакт:
- Grant Theron, PhD
- Номер телефона: 9693 (+27) 21 938 9693
- Электронная почта: gtheron@sun.ac.za
-
Контакт:
- Tinaye Chiyaka, PhD
- Номер телефона: 9954 (+27) 21 938 9954
- Электронная почта: tinayechiyaka@sun.ac.za
-
Cape Town, Western Cape, Южная Африка, 7570
- Рекрутинг
- Wallacedene Clinic
-
Контакт:
- Grant Theron, PhD
- Номер телефона: 9693 (+27) 21 938 9693
- Электронная почта: gtheron@sun.ac.za
-
Контакт:
- Tinaye WP Chiyaka, PhD
- Номер телефона: 9954 (+27) 21 938 9954
- Электронная почта: tinayechiyaka@sun.ac.za
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- 18-60 лет.
- Согласитесь пройти рентгенографию и/или компьютерную томографию.
- Имеет одностороннее заболевание туберкулезом, определяемое как одно легкое с обширными признаками заболевания туберкулезом (неприменимо к здоровой контрольной группе; больным контрольной группе потребуется альтернативный диагноз).
- Нет данных о предшествующем лечении ТБ и/или рентгенограмме/КТ нет очевидных доказательств предшествующего ТБ.
- Готов пройти исследовательскую бронхоскопию на исходном уровне, через 6 месяцев и 18 месяцев и, вероятно, останется в этом районе на период исследования.
- Если ВИЧ-положительный, он должен быть стабилен на антиретровирусной терапии (АРТ) в течение ≥1 года.
- Способен и желает вернуться для последующих посещений, но не планирует переезжать в ближайшем будущем.
- Готовность соблюдать требования исследования, т. е. предоставление контактных данных и письменное информированное согласие до зачисления.
Критерий исключения:
- Моложе 18 лет или старше 60 лет.
- Уже начал лечение от туберкулеза.
- Устойчивость к рифампицину.
- Имеет в анамнезе туберкулез.
- Двустороннее заболевание туберкулезом определяется как обширное поражение обоих легких.
- Получал пробиотики, антибиотики или ингаляционные стероиды в течение трех месяцев до включения в исследование (не относится к контрольной группе больных)
- Имеет сахарный диабет, который влияет на заболевание ТБ, ответ на лечение и микробиом
- Имеет противопоказания к бронхоскопии (например, ОФВ1 <70%), как определено бронхоскопистами в соответствии с рекомендациями передовой практики.
- Имеет ежедневное потребление алкоголя более 6 сортов пива или 4 коктейлей
- Беременность (коммерческий анализ на определение хорионического гонадотропина человека будет проводиться в соответствии с рекомендациями производителя по моче) или беременность, запланированная на последующий период
- Недавняя госпитализация по любой причине
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Когорта
- Временные перспективы: Перспективный
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
|---|
|
Случаи туберкулеза
|
|
Здоровые бытовые контакты
|
|
Больные элементы управления
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Характеристика изменений микробиоты в больных и здоровых сегментах легких, стратифицированных по ВИЧ-статусу.
Временное ограничение: До 18 месяцев
|
Микробиом легких в пораженных и здоровых сегментах определяется секвенированием гена 16S рРНК.
|
До 18 месяцев
|
|
Ассоциация специфических микробных таксонов в пораженных сегментах с повышенным содержанием SCFAs и нарушением биомаркеров воспаления и восстановления тканей хозяина.
Временное ограничение: До 18 месяцев
|
Корреляционный анализ специфических цитокинов, профилированных с использованием коммерческих мультиплексных панелей Luminex, и SCFAs, измеренных с помощью анализов газовой хроматографии-масс-спектрометрии (ГХ-МС).
|
До 18 месяцев
|
|
Оценить влияние лечения на микробиом легких.
Временное ограничение: До 18 месяцев
|
Охарактеризовать устойчивость бактериального сообщества наряду с изменениями микробных биомаркеров и биомаркеров хозяина.
|
До 18 месяцев
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Соавторы
Следователи
- Главный следователь: Grant Theron, PhD, University of Stellenbosch
Публикации и полезные ссылки
Общие публикации
- Yatsunenko T, Rey FE, Manary MJ, Trehan I, Dominguez-Bello MG, Contreras M, Magris M, Hidalgo G, Baldassano RN, Anokhin AP, Heath AC, Warner B, Reeder J, Kuczynski J, Caporaso JG, Lozupone CA, Lauber C, Clemente JC, Knights D, Knight R, Gordon JI. Human gut microbiome viewed across age and geography. Nature. 2012 May 9;486(7402):222-7. doi: 10.1038/nature11053.
- Shenoy MK, Iwai S, Lin DL, Worodria W, Ayakaka I, Byanyima P, Kaswabuli S, Fong S, Stone S, Chang E, Davis JL, Faruqi AA, Segal MR, Huang L, Lynch SV. Immune Response and Mortality Risk Relate to Distinct Lung Microbiomes in Patients with HIV and Pneumonia. Am J Respir Crit Care Med. 2017 Jan 1;195(1):104-114. doi: 10.1164/rccm.201603-0523OC.
- Wipperman MF, Fitzgerald DW, Juste MAJ, Taur Y, Namasivayam S, Sher A, Bean JM, Bucci V, Glickman MS. Antibiotic treatment for Tuberculosis induces a profound dysbiosis of the microbiome that persists long after therapy is completed. Sci Rep. 2017 Sep 7;7(1):10767. doi: 10.1038/s41598-017-10346-6.
- Botero LE, Delgado-Serrano L, Cepeda ML, Bustos JR, Anzola JM, Del Portillo P, Robledo J, Zambrano MM. Respiratory tract clinical sample selection for microbiota analysis in patients with pulmonary tuberculosis. Microbiome. 2014 Aug 25;2:29. doi: 10.1186/2049-2618-2-29. eCollection 2014.
- Cheung MK, Lam WY, Fung WY, Law PT, Au CH, Nong W, Kam KM, Kwan HS, Tsui SK. Sputum microbiota in tuberculosis as revealed by 16S rRNA pyrosequencing. PLoS One. 2013;8(1):e54574. doi: 10.1371/journal.pone.0054574. Epub 2013 Jan 24.
- Cui Z, Zhou Y, Li H, Zhang Y, Zhang S, Tang S, Guo X. Complex sputum microbial composition in patients with pulmonary tuberculosis. BMC Microbiol. 2012 Nov 23;12:276. doi: 10.1186/1471-2180-12-276.
- Segal LN, Clemente JC, Tsay JC, Koralov SB, Keller BC, Wu BG, Li Y, Shen N, Ghedin E, Morris A, Diaz P, Huang L, Wikoff WR, Ubeda C, Artacho A, Rom WN, Sterman DH, Collman RG, Blaser MJ, Weiden MD. Enrichment of the lung microbiome with oral taxa is associated with lung inflammation of a Th17 phenotype. Nat Microbiol. 2016 Apr 4;1:16031. doi: 10.1038/nmicrobiol.2016.31.
- Naidoo CC, Nyawo GR, Wu BG, Walzl G, Warren RM, Segal LN, Theron G. The microbiome and tuberculosis: state of the art, potential applications, and defining the clinical research agenda. Lancet Respir Med. 2019 Oct;7(10):892-906. doi: 10.1016/S2213-2600(18)30501-0. Epub 2019 Mar 22.
- Wade WG. The oral microbiome in health and disease. Pharmacol Res. 2013 Mar;69(1):137-43. doi: 10.1016/j.phrs.2012.11.006. Epub 2012 Nov 28.
- Grice EA, Kong HH, Renaud G, Young AC; NISC Comparative Sequencing Program; Bouffard GG, Blakesley RW, Wolfsberg TG, Turner ML, Segre JA. A diversity profile of the human skin microbiota. Genome Res. 2008 Jul;18(7):1043-50. doi: 10.1101/gr.075549.107. Epub 2008 May 23.
- Weiner J 3rd, Parida SK, Maertzdorf J, Black GF, Repsilber D, Telaar A, Mohney RP, Arndt-Sullivan C, Ganoza CA, Fae KC, Walzl G, Kaufmann SH. Biomarkers of inflammation, immunosuppression and stress with active disease are revealed by metabolomic profiling of tuberculosis patients. PLoS One. 2012;7(7):e40221. doi: 10.1371/journal.pone.0040221. Epub 2012 Jul 23.
- Segal LN, Alekseyenko AV, Clemente JC, Kulkarni R, Wu B, Gao Z, Chen H, Berger KI, Goldring RM, Rom WN, Blaser MJ, Weiden MD. Enrichment of lung microbiome with supraglottic taxa is associated with increased pulmonary inflammation. Microbiome. 2013 Jul 1;1(1):19. doi: 10.1186/2049-2618-1-19.
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Оцененный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
- Инфекции, передающиеся через кровь
- Скрытая инфекция
- Урогенитальные заболевания
- Генитальные заболевания
- Заболевания иммунной системы
- Инфекции
- РНК-вирусные инфекции
- Вирусные заболевания
- Передающиеся заболевания
- Заболевания, передающиеся половым путем, вирусные
- Заболевания, передающиеся половым путем
- Лентивирусные инфекции
- Ретровирусные инфекции
- Синдромы иммунологического дефицита
- Медленные вирусные заболевания
- Грамположительные бактериальные инфекции
- Бактериальные инфекции
- Бактериальные инфекции и микозы
- Актиномицетовые инфекции
- Микобактериальные инфекции
- ВИЧ-инфекции
- Туберкулез
- Синдром приобретенного иммунодефицита
- Скрытый туберкулез
Другие идентификационные номера исследования
- N19/09/126
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Описание плана IPD
Сроки обмена IPD
Критерии совместного доступа к IPD
Совместное использование IPD Поддерживающий тип информации
- STUDY_PROTOCOL
- САП
- МКФ
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
продукт, произведенный в США и экспортированный из США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .