MikroRNA:t sappipohjaisina biomarkkereina haimasyövissä (MIRABILE)
haima- tai sappitiesyöpä voi olla vakava diagnoosi, koska monet potilaat saapuvat liian myöhään leikkaukseen. Syöpäsolujen on havaittu vapauttavan pieniä lähettimolekyylejä, jotka säätelevät mikroRNA:iksi (miRNA:iksi) kutsuttuja syöpägeenejä.
Tämän havainnointitutkimuksen tavoitteena on oppia sappi- ja verinäytteistä peräisin olevien miRNA:iden roolista potilailla, joilla on haimasyöpä ja sappitiesyöpä. Pääkysymykset, joihin sillä pyritään vastaamaan, ovat:
- Voiko tämä havaita potilaita, joilla on keltaisuus (keltainen iho), joille tehdään endoskopia?
- Voiko tämä erottaa syöpätyypit? Osallistujilta otetaan veri- ja sappinäytteet ennen diagnoosia ja heidän kliinistä reittiään seurataan 6 kuukauden ajan.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Sappireumat voivat olla hyvänlaatuisia tai pahanlaatuisia. Pahanlaatuisen sapen ahtauman pääasiallinen syy on primaarinen kasvain tai paikallinen laajeneminen, kuten kolangiokarsinooma (CCA) tai haiman duktaalinen adenokarsinooma (PDAC). Edelleen käydään edelleen keskustelua riittävästä diagnostiikasta etiologiaa tuntemattomien sappitiehyiden ahtaumissa. Endoskooppisen retrogradisen kolangiopankreatografian (ERCP) käyttöä pidetään välttämättömänä apuvälineenä sappitiehyissä. ERCP:n etuna on kyky saada aikaan sapen dekompressio ja ottaa samanaikaisesti transpapillaarinäytteitä histologista tai sytologista analyysiä varten. Valitettavasti sappiharjan sytologia ja/tai biopsiat ovat usein epäherkkiä havaitsemaan pahanlaatuisia kasvaimia, erityisesti PDAC:ta. MikroRNA:t (miRNA:t) ovat äskettäin tunnistettuja, pieniä geneettisen koodin paloja, jotka ovat tärkeitä syöpägeenien säätelylle. Aiemmin on osoitettu, että miRNA:n "allekirjoituksia" kudoksessa ja bionesteissä voidaan käyttää PDAC:n havaitsemiseen ja ennustamiseen. Sappi on potentiaalisesti rikas uusien biomarkkereiden lähde PDAC:lle ja BTC:lle, koska se on lähellä pahanlaatuista vauriota.
Tämä prospektiivinen, ei-satunnaistettu, havainnollinen, yksisokkoutettu tutkimus tutkii ensisijaisena päätetapahtumana, voivatko sapen miRNA-ehdokkaat erottaa hyvänlaatuisen ja pahanlaatuisen haima-sappisairauden/-raumat potilailla, joille tehdään ERCP. Hypoteesien luomiseksi tässä tutkimuksessa on myös useita translaatiotutkimuksen tutkivia päätepisteitä. Tämä keskittyy potilaisiin, joilla on PDAC, korreloimalla miRNA-tasoja kliinisten patologisten tekijöiden ja eloonjäämistulosten kanssa, jotta sapen miRNA:t voidaan vahvistaa ennustaviksi ja prognostisiksi biomarkkereiksi. Lisäksi tutkimuksella pyritään selvittämään PDAC:n epäsäänneltyjen sapen miRNA:iden molekyylimekanismeja ja lähdettä.
Yhteenvetona voidaan todeta, että tällä hetkellä ei ole olemassa tehokasta menetelmää pahanlaatuisten ja hyvänlaatuisten sapen ahtaumien erottamiseksi tai kykyä osittaa nämä kasvaimet ennen leikkausta niiden biologisen alatyypin ja aggressiivisuuden perusteella. Ehdotetun tutkimuksen tavoitteena on parantaa näiden kasvainten diagnosoinnin nopeutta ja tarkkuutta käyttämällä sappipohjaisia miRNA-signaatuureja. Tärkeää on, että on osoitettu, että sapen miRNA:t voidaan helposti erottaa ja analysoida, ja nämä molekyylit ovat stabiileja kliinisissä olosuhteissa. Kliinisesti käyttökelpoisten sapen miRNA-biomarkkerien kehittäminen johtaa huomattaviin potilashyötyihin.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
London, Yhdistynyt kuningaskunta, W12 0HS
- Imperial College Healthcare NHS Trust
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Ikä ≥ 18 vuotta.
- Kliinisistä syistä on määrä suorittaa ERCP (endoskooppinen retrogradinen kolangiopankreatografia).
- WHO:n suorituskykytila 0, 1 tai 2.
- Halukas ja henkisesti kykenevä antamaan kirjallinen tietoinen suostumus.
- Epäillään hyvänlaatuista haima-sappisairautta (esim. krooninen haimatulehdus, primaarinen sklerosoiva kolangiitti, yleiset sappitiehyiden sappikivet (koledokolitiaasi), Oddin sulkijalihaksen toimintahäiriö); tai epäillään olevan PDAC tai BTC.
- Esiintyy obstruktiivisen keltaisuuden ja/tai määrittelemättömän sapen ahtauman kanssa.
Poissulkemiskriteerit:
- Ikä <18 vuotta.
- Potilaat, joille tehdään bariatrisen leikkauksen jälkeinen ERCP, hepatico-jejunostomia tai Bilroth II.
- Raskaus.
- WHO:n suorituskykytila 3 tai 4.
- Ei halua tai pysty allekirjoittamaan tietoon perustuvaa suostumusta.
- Ei suunniteltu endoskooppisiin toimenpiteisiin kliinisistä syistä.
- Ei kliinisiä tai kuvatietoja, jotka viittaavat haima-sappisairauteen ja endoskooppisen toimenpiteen tai tutkimuksen tarpeeseen.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Haimasyöpä (PDAC)
PDAC:n kliininen diagnoosi määritettiin monitieteisen tiimikokouksen tuloksista, johon kuului ainakin hepatopancreaticobiliary kirurgi, hepatopancreaticobiliary lääkäri, konsultti histopatologi ja konsulttiradiologi.
ERCP-löydökset, endoskooppiset ultraäänilöydökset, sapen harjaussytologia ja hienon neulan aspiraatiosytologia anonymisoitiin ja kirjattiin.
Haiman massa yhdistelmä röntgenkuvauksessa ilman akuuttia kolangiopatiaa ja kliininen tai röntgenkuvaus ≥ 12 kuukauden seurannan jälkeen tai kuolema, joka kliinisesti ja radiografisesti on todettu johtuvan haimasyövästä.
Kirurgisia resektiota ja biopsianäytteitä varten diagnoosit ja vaiheet tehtiin standardien histomorfologisten kriteerien perusteella.
Analyysitarkoituksiin käytettiin patologista stagingiä mahdollisuuksien mukaan kliinisen vaiheen sijasta.
|
Näytteet valmistettiin pienten RNA-sekvensointia varten käyttämällä Qiagenin QIAseq small RNA Library Prep -pakkausta, laatua valvottiin Agilent Bioanalyzer 2100 -laitteella ja sekvensoitiin NextSeq 500 -järjestelmällä (Illumina, San Diego, USA) käyttämällä oletusarvoista yksipäästä 75 emäsparin protokollaa. integroidut ainutlaatuiset molekyyliindeksit (UMI:t).
Validointi suoritettiin käyttämällä kvantitatiivista käänteistranskriptiopolymeraasiketjureaktiota (qRT-PCR) joko käyttämällä kohdespesifisiä kantasilmukka-alukemäärityksiä (TaqMan) tai universaalia käänteistranskriptiota (RT) ja lukitun nukleiinihapon (LNA) tehostamia spesifisiä alukkeita SYBR green I -määrityksellä havaitseminen
|
|
Kolangiokarsinooma (CCA)
CCA:n kliininen diagnoosi määriteltiin radiologisilla kriteereillä monitieteisen tiimikokouksen tulosten perusteella, johon kuului vähintään hepatopancreaticobiliary kirurgi, hepatopancreaticobiliary-konsultti, konsultti histopatologi ja konsulttiradiologi.
ERCP-löydökset, endoskooppiset ultraäänilöydökset, sapen harjaussytologia ja hienon neulan aspiraatiosytologia anonymisoitiin ja kirjattiin.
Tämä määritettiin myös kliinisen tai radiografisen etenemisen perusteella ≥12 kuukauden seurannan jälkeen tai kliinisesti ja radiografisesti määritellyn kuoleman perusteella, joka johtuu syövästä.
Kirurgisia resektiota ja biopsianäytteitä varten diagnoosit ja vaiheet tehtiin standardien histomorfologisten kriteerien perusteella.
Analyysitarkoituksiin käytettiin patologista stagingiä mahdollisuuksien mukaan kliinisen vaiheen sijasta.
|
Näytteet valmistettiin pienten RNA-sekvensointia varten käyttämällä Qiagenin QIAseq small RNA Library Prep -pakkausta, laatua valvottiin Agilent Bioanalyzer 2100 -laitteella ja sekvensoitiin NextSeq 500 -järjestelmällä (Illumina, San Diego, USA) käyttämällä oletusarvoista yksipäästä 75 emäsparin protokollaa. integroidut ainutlaatuiset molekyyliindeksit (UMI:t).
Validointi suoritettiin käyttämällä kvantitatiivista käänteistranskriptiopolymeraasiketjureaktiota (qRT-PCR) joko käyttämällä kohdespesifisiä kantasilmukka-alukemäärityksiä (TaqMan) tai universaalia käänteistranskriptiota (RT) ja lukitun nukleiinihapon (LNA) tehostamia spesifisiä alukkeita SYBR green I -määrityksellä havaitseminen
|
|
Hyvänlaatuinen
Hyvänlaatuisen sairauden kliininen diagnoosi määritettiin ERCP:n arvioinnin sekä monitieteisen tiimikokouksen tuloksista, johon kuului vähintään hepatopancreaticobiliary kirurgi, konsultti hepatopancreaticobiliary lääkäri, konsultti histopatologi ja konsulttiradiologi.
Kaikki potilaat, joilla oli hyvänlaatuinen etiologia, määritettiin kliinisesti sen perusteella, että potilaat eivät ole edenneet ≥ 12 kuukauden seurannan jälkeen, joko dokumentoidusti aiempien tiehyen poikkeavuuksien häviämisen tai pysyvyyden perusteella tai ilman lisätoimenpiteitä, kuten sähköisissä sairaalarekistereissä on dokumentoitu 12 kuukauden kohdalla.
|
Näytteet valmistettiin pienten RNA-sekvensointia varten käyttämällä Qiagenin QIAseq small RNA Library Prep -pakkausta, laatua valvottiin Agilent Bioanalyzer 2100 -laitteella ja sekvensoitiin NextSeq 500 -järjestelmällä (Illumina, San Diego, USA) käyttämällä oletusarvoista yksipäästä 75 emäsparin protokollaa. integroidut ainutlaatuiset molekyyliindeksit (UMI:t).
Validointi suoritettiin käyttämällä kvantitatiivista käänteistranskriptiopolymeraasiketjureaktiota (qRT-PCR) joko käyttämällä kohdespesifisiä kantasilmukka-alukemäärityksiä (TaqMan) tai universaalia käänteistranskriptiota (RT) ja lukitun nukleiinihapon (LNA) tehostamia spesifisiä alukkeita SYBR green I -määrityksellä havaitseminen
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Diagnostinen arvo mitattuna käyrän alla (AUC) miRNA-ehdokkaille
Aikaikkuna: ERCP-päivänä
|
Ekspressioarvot kullekin miRNA:lle lasketaan ja niitä käytetään suorittamaan. Useita logistisia regressioita suoritettiin ehdokkaille yksittäin ja yhdistelmänä käyttäen GraphPad Prismia.
Tiedot valmistettiin binäärituloksina ja kaikki tärkeimmät vaikutukset on sisällytetty malliin.
Optimaaliset raja-arvot määritettiin käyttämällä ROC-käyrästä saatuja kynnysarvoja Youden-indeksin maksimiarvolla.
Youdenin J-tilasto (kutsutaan myös Youdenin indeksiksi) on yksittäinen tilasto, joka vaihtelee välillä 0-1 ja joka määritetään kaavalla (spesifisyys + herkkyys -1).
Kun testattiin useita hypoteeseja, sovellettiin asianmukaista Benjamini-Hochberg-korjausta (väärä havaitsemisnopeus) mukautetun p-arvon saamiseksi.
P-arvon (mukautettu) <0,05 katsottiin olevan tilastollisesti merkitsevä.
|
ERCP-päivänä
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Adam E Frampton, MB BS FRCS PhD, Imperial College London
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- MIRABILE
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .