Kohdunkaulan keräämien optimointi raskauden aikana (OCCP)

Tutkimus on ei-interventio, ja se on suunniteltu tulevaa näytteenottoa ja samanaikaista analysointia varten. Ensisijainen päätetapahtuma on kullakin laitteella ja menetelmällä saatujen ekstravilloisten trofoblastisolujen (EVT) (istukkasolujen, jotka kulkeutuvat lisääntymiskanavaan) lukumäärän määrittäminen. EVT-solujen lukumäärä, joka on säädetty puhtauteen (sikiön markkerin, esim. sytokeratiini 7, ilmentyminen), määrittää suoraan sikiön DNA:n määrän, joka on käytettävissä synnytystä edeltävään geneettiseen testaukseen. Toissijaisia ​​päätepisteitä ovat solujen kokonaismäärä alkuperäisissä kohdunkaulannäytteissä ja sikiön DNA:n, RNA:n ja/tai EVT-soluista eristettyjen proteiinien määrä. Kun sikiön DNA:ta saadaan, sekvensoimme sikiön ja äidin DNA:n yhden nukleotidivariantin (SNV) ja lyhyen tandemtoiston (STR) lokusten vertailua varten sikiön DNA:n (sikiöfraktion) puhtauden arvioimiseksi tai koko genomin sekvensoinnin suorittamiseksi. Kohdunkaulan nesteessä olevista soluttomista biomolekyylistä arvioidaan myös proteiinit tai RNA:t, jotka liittyvät haitallisiin raskaustuloksiin, tai soluton sikiön DNA. Näitä parametreja verrataan eri keräysmenetelmien välillä optimaalisen keräysprotokollan kuvaamiseksi sikiösolujen ja niiden komponenttien analysointia varten.

Kohortti: Seuraamme raskaana olevien yksilöiden ryhmää ajan mittaan, keräämme kohdunkaulan eritteitä eri vaiheissa koko raskauden ajan ja vertaamme sitten näitä tietoja raskauden tuloksiin.

Kontrolli: Keräämme kohdunkaulan nestettä ei-raskaana olevilta, ei-kuukautisilla lisääntymisiässä olevilta naisilta vertailua varten kohortin osallistujanäytteisiin. On odotettavissa, että istukan tuottamat solut tai biomolekyylit puuttuvat ja että havaitut signaalit määrittävät taustatasot.

Kuvaava: Tutkimuksen tavoitteena on tarkkailla ja kuvata kohdunkaulan eritteiden ominaisuuksia koko raskauden ajan ja niiden yhteyttä raskauden lopputulokseen tai sikiön genotyyppiin.

Rekisterin/tietokannan perustaminen: Tutkijoiden on luotava tietokanta järjestääkseen ja analysoidakseen osallistujilta kerättyjä tietoja, kuten heidän kohdunkaulan eritteiden ominaisuuksia ja heidän raskauksiensa tuloksia.

Raskaana olevat naiset (N=2000) otetaan mukaan tähän tutkimukseen, koska se on synnytystä edeltävän testausmenetelmän tutkimus ja päätepisteenä on sikiöperäisten EVT-solujen tai niiden tuotteiden havaitseminen, erityisesti istukasta. Ikähaitariksi valittiin 18–45 vuotta, koska tämä on naisten lisääntymistoiminnan pääasiallinen alue. Ei-raskaana olevat naiset (N = 600) otetaan myös mukaan kontrolloimaan EVT-soluja raskaana olevista näytteistä ja määrittämään tutkimusprotokollassa saatujen solujen vastaava määrä, kun EVT-soluja ei ole läsnä.

Ilmoittautumisrajoituksia ei ole rodun tai etnisen alkuperän perusteella. Tavoitteena on sisällyttää ilmoittautumiseen riittävä monimuotoisuus, jotta tutkimukseen osallistumisen hyödyt ja taakka jakautuvat tasapuolisesti. On myös toivottavaa, että havainnot ovat toistettavissa kaikissa roduissa ja etnisissä ryhmissä.

Jos näyte otetaan Pap-kokeen yhteydessä, terveydenhuollon ammattilainen noudattaa suositeltuja menettelyjä. Alkuperäinen ylimääräinen lima kanavasta ja kohdunkaulan ulkopuolelta kerääntyy PI:n toimittamiin keräysastioihin sen sijaan, että se heitetään pois. Jos näytteenotto suoritetaan eri aikaan kuin raskauden kohdunkaulan sytologia, voidaan hankkia lisäksi kohdunkaulan harja. Klinikoihin toimitetaan näytteenottopakkaukset, joissa käytetään papa-kokeiden (mukaan lukien raskauden aikana) ja muiden tutkittavien menetelmien laitteita. Nämä sarjat sisältävät kaikki laitteet näytteenottoa ja takaisin PI:lle lähettämistä varten. Sarjat sisältävät myös osallistujatietolomakkeen ja ohjeet näytteenottoa varten. Kaikki sarjan materiaalit koodataan jokaisen osallistujan tunnistamiseksi. Koodien avaimet säilyvät kukin kliinisen paikan yhteistyökumppanina toimistonsa lukitussa kaapissa, joten PI:n kanssa työskentelevillä henkilöillä on vain kunkin osallistujan tunnistamaton koodi. Laboratoriotietojen yhdistämiseksi kliinisiin tietoihin kliinisen paikan yhteistyökumppani suorittaa analyysin käyttämällä koodien avainta. Kohdunkaulan nesteen analyysistä saatuja tietoja ei palauteta osallistujalle tai hänen lääkärilleen, koska tutkimuksen tarkoituksena on arvioida näytteenottomenettelyjä, ei testituloksia.