Optymalizacja zbioru szyjki macicy w czasie ciąży (OCCP)

Badanie będzie miało charakter nieinterwencyjny i będzie przeznaczone do prospektywnego pobierania próbek i jednoczesnej analizy. Pierwszorzędowym punktem końcowym będzie określenie liczby komórek trofoblastu zewnątrzkosmkowego (EVT) (komórek łożyska migrujących do dróg rodnych) uzyskanych za pomocą każdego urządzenia i procedury. Liczba komórek EVT skorygowana pod względem czystości (ekspresja markera płodowego, np. cytokeratyny 7) bezpośrednio określa ilość płodowego DNA, która będzie dostępna do prenatalnych badań genetycznych. Drugorzędowe punkty końcowe będą obejmować całkowitą liczbę komórek w początkowych próbkach szyjki macicy oraz ilość płodowego DNA, RNA i/lub białka wyizolowanego z komórek EVT. W przypadku uzyskania DNA płodu zsekwencjonujemy DNA płodu i matki w celu porównania wariantów pojedynczego nukleotydu (SNV) i loci krótkich powtórzeń tandemowych (STR), aby ocenić czystość DNA płodu (frakcja płodowa) lub przeprowadzić sekwencjonowanie całego genomu. Bezkomórkowe biomolekuły obecne w płynie szyjkowym zostaną również ocenione pod kątem białek lub RNA związanych z niekorzystnymi wynikami ciąży lub bezkomórkowego DNA płodu. Parametry te zostaną porównane pomiędzy różnymi metodami pobierania, aby opisać optymalny protokół pobierania do celów analizy komórek płodowych i ich składników.

Kohorta: Będziemy śledzić grupę ciężarnych na przestrzeni czasu, zbierając wydzielinę z szyjki macicy na różnych etapach ciąży, a następnie porównując te dane z wynikami ciąży.

Kontrola: Pobierzemy płyn szyjkowy od nieciężarnych i nie miesiączkujących kobiet w wieku rozrodczym w celu porównania z próbkami uczestników kohorty. Oczekuje się, że komórki lub biomolekuły wytwarzane przez łożysko będą nieobecne, a wszelkie wykryte sygnały będą określać poziomy tła.

Opisowy: Badanie ma na celu obserwację i opisanie właściwości wydzieliny szyjkowej podczas ciąży oraz ich związku z przebiegiem ciąży lub genotypem płodu.

Utworzenie rejestru/bazy danych: Naukowcy muszą stworzyć bazę danych w celu uporządkowania i przeanalizowania informacji zebranych od uczestniczek, takich jak właściwości ich wydzieliny szyjkowej i przebieg ciąży.

Do badania zostaną włączone kobiety w ciąży (N=2000), ponieważ jest to badanie metody badań prenatalnych, a punktem końcowym jest wykrycie komórek EVT lub ich produktów pochodzących z płodu, szczególnie z łożyska. Wybrano przedział wiekowy od 18 do 45 lat, ponieważ jest to główny przedział aktywności reprodukcyjnej kobiet. Kobiety niebędące w ciąży (N=600) zostaną również włączone do kontroli komórek EVT w próbkach ciężarnych i określenia odpowiedniej liczby komórek uzyskanych w protokole badania, gdy nie będą obecne żadne komórki EVT.

Nie będzie żadnych ograniczeń w przyjmowaniu ze względu na pochodzenie rasowe lub etniczne. Celem jest zapewnienie wystarczającej różnorodności w rekrutacji, aby zapewnić sprawiedliwy podział korzyści i ciężarów związanych z uczestnictwem w badaniach. Pożądane jest również, aby wyniki były powtarzalne dla wszystkich grup rasowych i etnicznych.

Jeśli próbka zostanie pobrana w czasie wykonywania wymazu, pracownik służby zdrowia będzie postępował zgodnie z zalecanymi procedurami. Początkowy nadmiar śluzu z kanału i szyjki macicy zostanie zdeponowany w pojemnikach dostarczonych przez PI, a nie wyrzucony. Jeżeli pobranie próbki odbywa się w innym terminie niż cytologia szyjki macicy w ciąży, można dodatkowo wykonać szczoteczkę szyjkową. Do klinik zostaną dostarczone zestawy do pobrania próbek z wykorzystaniem urządzeń stosowanych do wymazów cytologicznych (w tym podczas ciąży) oraz innych metod do badania. Zestawy te będą zawierać wszystkie urządzenia do pobierania próbek i wysyłania ich z powrotem do PI. Zestawy będą również zawierać arkusz danych uczestnika i instrukcje dotyczące pobierania próbek. Wszystkie materiały zestawu zostaną zakodowane w celu identyfikacji każdego uczestnika. Klucz do kodów będzie przechowywany przez każdego współpracownika ośrodka klinicznego w zamkniętej szafce w swoim biurze, tak aby personel pracujący z PI miał wyłącznie kod umożliwiający identyfikację każdego uczestnika. Aby powiązać dane laboratoryjne z danymi klinicznymi, współpracownik ośrodka klinicznego przeprowadzi analizę przy użyciu klucza do kodów. Żadne informacje z analizy płynu szyjkowego nie zostaną zwrócone uczestniczce ani jej lekarzowi, ponieważ badanie ma na celu ocenę procedur pobierania próbki, a nie wyników testu.