Оптимизация цервикального сбора во время беременности (OCCP)

Исследование будет неинтервенционным и предназначено для проспективного сбора образцов и одновременного анализа. Первичной конечной точкой будет определение количества клеток вневорсинчатого трофобласта (EVT) (плацентарных клеток, мигрирующих в репродуктивный тракт), полученных с помощью каждого устройства и процедуры. Количество клеток EVT, скорректированное по чистоте (экспрессия фетального маркера, например, цитокератина 7), напрямую определяет количество фетальной ДНК, которая будет доступна для пренатального генетического тестирования. Вторичные конечные точки будут включать общее количество клеток в исходных образцах шейки матки и количество эмбриональной ДНК, РНК и/или белка, выделенных из клеток EVT. При получении ДНК плода мы секвенируем ДНК плода и матери для сравнения локусов однонуклеотидного варианта (SNV) и коротких тандемных повторов (STR) для оценки чистоты ДНК плода (фракции плода) или выполнения полногеномного секвенирования. Бесклеточные биомолекулы, присутствующие в цервикальной жидкости, также будут оцениваться на наличие белков или РНК, связанных с неблагоприятными исходами беременности, или бесклеточной ДНК плода. Эти параметры будут сравниваться между различными методами сбора, чтобы описать оптимальный протокол сбора с целью анализа клеток плода и их компонентов.

Когорта: Мы будем наблюдать за группой беременных с течением времени, собирая цервикальные выделения на различных стадиях беременности, а затем сравнивая эти данные с исходами беременности.

Контроль: Мы будем собирать цервикальную жидкость у небеременных и неменструирующих женщин репродуктивного возраста для сравнения с образцами участников когорты. Ожидается, что клетки или биомолекулы, продуцируемые плацентой, будут отсутствовать и что любые обнаруженные сигналы будут определять фоновые уровни.

Описательное: Целью исследования является наблюдение и описание свойств секретов шейки матки на протяжении всей беременности и их связи с исходами беременности или генотипом плода.

Создание реестра/базы данных: исследователям необходимо создать базу данных для организации и анализа информации, полученной от участников, такой как свойства их цервикальных выделений и исходы их беременностей.

Беременные женщины (N = 2000) будут включены в это исследование, поскольку оно представляет собой исследование метода пренатального тестирования, а конечной точкой является обнаружение клеток EVT или их продуктов внутриутробного происхождения, особенно из плаценты. Возрастной диапазон от 18 до 45 лет был выбран потому, что это основной диапазон репродуктивной активности женщин. Небеременные женщины (N = 600) также будут включены в исследование для контроля клеток EVT в образцах беременных и определения соответствующего количества клеток, полученных в протоколе исследования, когда клетки EVT отсутствуют.

Ограничений на набор по признаку расового или этнического происхождения не будет. Цель состоит в том, чтобы обеспечить достаточное разнообразие набора студентов, чтобы гарантировать справедливое распределение преимуществ и бремени участия в исследованиях. Также желательно, чтобы результаты были воспроизводимы для всех расовых и этнических групп.

Если образец берется во время Пап-мазка, медицинский работник будет следовать рекомендованным процедурам. Первоначальный избыток слизи из канала и эктоцервикса будет храниться в контейнерах для сбора, предоставленных ИП, а не выбрасываться. Если сбор проб проводится в другое время, чем при цитологическом исследовании шейки матки при беременности, дополнительно можно получить цервикальную ершик. Клиникам будут предоставлены наборы для взятия проб с использованием устройств, используемых для взятия мазков Папаниколау (в том числе во время беременности) и других методов исследования. Эти комплекты будут содержать все устройства для сбора проб и их отправки обратно в ПИ. Наборы также будут содержать паспорт участника и инструкции по сбору образцов. Все материалы комплекта будут закодированы для идентификации каждого участника. Ключ к кодам будет храниться каждым сотрудником клинического центра в запертом шкафу в своем офисе, так что у персонала, работающего с ИП, будет только обезличенный код для каждого участника. Чтобы связать лабораторные данные с клиническими данными, сотрудник клинического центра проведет анализ, используя ключ к кодам. Никакая информация из анализа цервикальной жидкости не будет возвращена участнику или его врачу, поскольку исследование предназначено для оценки процедур отбора образцов, а не результатов теста.