Eksosomaalinen mikroRNA-merkki kolonkipään syövän esioperaatioisessa vaiheistamisessa (EXPOSE)

Paksusuolen syöpä on edelleen yksi maailmanlaajuisesti johtavista syöpään liittyvistä kuolinsyistä, ja huolimata seulonnan ja kirurgisten tekniikoiden edistymisestä, merkittävä osa potilaista kokee edelleen sairauden uusiutumisen parantavan leikkauksen jälkeen. Potilaille, joilla on patologinen vaihe IIB tai korkeampi sairaus, adjuvanttikemoterapiaa suositellaan säännönmukaisesti heidän kohonneen uusiutumisriskinsä vuoksi. Kuitenkin näiden biologisten aggressiivisten tapausten tarkka tunnistaminen ennen leikkausta on edelleen merkittävä kliininen haaste, sillä nykyinen kuvantamiseen perustuva vaiheilu usein aliarvioi kasvaintaakan ja ei onnistu kaappaamaan taustalla olevaa pahanlaatuista potentiaalia. Tämä diagnostiikan aukko on estänyt neoadjuvanttikemoterapian (NAC) optimaalisen toteuttamisen paksusuolen syövän hoidossa.

Tämän ongelman ratkaisemiseksi tutkijat perustivat EXPOSE-tutkimuksen (Exosomal microRNA Signature for Pre-Operative Stage and Eligibility Evaluation), monikeskuksellisen translatiivisen tutkimushankkeen, jonka tavoitteena on kehittää ja validoida ei-invasiivinen, biologisesti informoitu diagnostiikkatestaus, joka pystyy tunnistamaan potilaita, joilla on korkean riskin paksusuolen syöpä – vastaava patologiseen vaiheeseen IIB tai korkeampi – ja jotka saattavat hyötyä NAC:sta.

EXPOSE-tutkimus etenee kolmen rakenteellisen vaiheen kautta.

1. Löytövaiheessa eksosomaaliset mikroRNA:t profiloidaan käyttäen kattavaa pientä RNA-sekvensointia tunnistaakseen avainbiomarkkerit, jotka heijastavat kasvaimen aggressiivisuutta.
2. Koulutusvaiheessa tutkijat mittaavat ehdokkaiden mikroRNA:iden määrää RT-qPCR:llä ja integroivat niiden ilmentymismalleja koneoppimisalgoritmien avulla rakentaakseen ennustavan mallin korkean riskin sairaudelle.
3. Lopulta validointivaiheessa mallin toistettavuutta, diagnostiikan tarkkuutta ja yleistettävyyttä testataan itsenäisessä kliinisessä kohortissa.

Lopullisen EXPOSE-testauksen odotetaan toimivan nestebiopsiaan perustuvana työkaluna preoperatiiviseen vaiheiluun, mahdollistaen tarkemman biologisten edistyneiden paksusuolen syöpätapausten tunnistamisen. Valmistuttuaan tämä tutkimus tuottaa tiukasti validoinnin läpikäyneen diagnostiikan mallin, joka yhdistää molekyyli- ja kliinisiä tietoja ohjatakseen neoadjuvanttihoidon päätöksiä ja parantaakseen personoitua hoitoa paksusuolen syövän hoidossa.