Ylemmän aerodigestiivisen traktin syöpien metabolomiikka (METABORL)

Metabolomiikka, massaspektrometrian edistysaskeleiden ansiosta, mahdollistaa solujen metaboliittien analysoinnin biologisten prosessien parempaa ymmärtämistä varten. Onkologiassa se tarjoaa kokonaiskuvan aineenvaihdunnan muutoksista kasvaimissa ja mahdollistaa syöpien luokittelun erilaisten lääketieteellisten parametrien perusteella käyttäen kehittyneitä tilastollisia menetelmiä (koneoppimista). Sen alhaiset kustannukset ja nopeus tekevät siitä lupaavan lähestymistavan henkilökohtaisessa lääketieteessä.

Ylempien hengitys- ja ruoansulatuskanavan (UADT) syövät, jotka ovat viidenneksi yleisimmät syövät Ranskassa, diagnosoidaan usein myöhään, mikä vähentää selviytymismahdollisuuksia (35-50% viiden vuoden kohdalla). Näiden syöpien spesifisen metabolomisen signatuurin tunnistaminen voisi helpottaa varhaista havaitsemista, arvioida hoidon vastetta ja havaita nopeasti uusiutumia. Lisäksi HPV:n aiheuttamilla kasvaimilla voi olla erilainen aineenvaihduntaprofiili verrattuna tupakka- ja alkoholista johtuviin kasvaimiin. Tällä hetkellä ei ole julkaistuja tutkimuksia, jotka olisivat tutkineet tätä aihetta UADT-syöville, mikä korostaa tällaisten tutkimusten tarvetta.

Tämän tutkimuksen tavoitteena on tunnistaa metabolominen signatuuri, joka liittyy UADT-syövän esiintymiseen alkuperäisessä diagnoosivaiheessa ja hoidon jälkeisessä seurannassa (kolme kuukautta hoidon päätyttyä). Hypoteesi on, että spesifinen metabolominen signatuuri havaitaan UADT-syöpään diagnosoidun potilaan biologisissa näytteissä, että havaittavan signatuurin tyyppi voi korreloida kasvaimen sijainnin, vaiheen, HPV-statuksen ja ennusteen kanssa, ja että tämän metabolomisen signatuurin säilyminen tai häviäminen kolme kuukautta hoidon jälkeen voi liittyä uusiutumisriskiin. Tämän mahdollisen metabolomisen signatuurin etsintä suoritetaan käyttäen kasvaimen biopsioita, plasmaa ja virtsanäytteitä alkuperäisessä diagnoosivaiheessa sekä plasmaa ja virtsanäytteitä kolmen ja kuuden kuukauden seurannassa hoidon jälkeen.

Lopulta tämän tutkimuksen hyödyt liittyvät UADT-syöpien varhaisdiagnostiikan, hoidon (hoidon säätäminen spesifisten metabolomisten signatuurien ennustearvon perusteella) ja seurannan (uusiutumisten varhainen havaitseminen, seurannan mukauttaminen kunkin potilaan yksilölliseen riskiin) parantamiseen.

Koska tutkimus perustuu biologisiin näytteisiin, jotka kerätään osana potilaan standardihoitoprosessia (ilman lisäbiologisia testejä tai toimenpiteitä, jotka tehdään erityisesti tutkimusta varten), potilaalle ei odoteta tutkimukseen liittyvää riskiä.

Tämä on prospektiivinen, yksikeskuksinen tutkimus, johon osallistuu histologisesti vahvistettuun, hoitamattomaan UADT:n (suuontelo, nielu, kurkunpää ja alanielu) levyepiteelikarsinoomaan sairastuneita potilaita, jotka saavat parantavan hoidon Antoine Lacassagne -keskuksessa.

Mahdollisen metabolomisen signatuurin etsintä suoritetaan käyttäen biologisia ja kasvaimenäytteitä, jotka kerätään osana potilaan standardihoitoprosessia, vaatimatta lisätutkimuksia tai -toimenpiteitä.

Tutkimuksen ensisijainen tavoite on tunnistaa metabolominen signatuuri UADT-syöpään sairastuneilla potilailla.

Tutkimuksen toissijaiset tavoitteet ovat:

• Tutkia metabolomisen signatuurin ja kasvaimen ominaisuuksien välistä korrelaatiota.
• Tarkastella metabolomisen signatuurin suhdetta kolmesta kuuteen kuukauteen hoidon jälkeen ja onkologiseen statukseen kolmesta kuuteen kuukauteen ja vuoden kuluttua hoidosta UADT-syöpään sairastuneilla potilailla.