Tutkimus ulosten kalprotektiinitasoista, äidin ja lapsen mikrobistosta, lapsen terveydestä, ravinnosta ja raskauskomplikaatioista tulehduksellista suolistosairautta sairastavilla potilailla (CALINA-IBD)

Tulehduksellinen suolistosairaus (IBD) on krooninen ruoansulatuskanavan sairaus, joka usein ilmenee hedelmällisellä iällä, ja noin 25 % IBD-potilaista saa lapsia diagnoosin jälkeen. IBD raskauden aikana voi vaikuttaa negatiivisesti vauvan terveyteen, sillä IBD-potilaiden vauvoilla on usein korkeammat ulosten kalprotektiinitasot (FCP), jotka ovat ruoansulatuskanavan tulehduksen merkki. Kohonneet FCP-tasot on yhdistetty lisääntyneeseen astman, ekseeman ja IBD:n riskiin myöhemmin elämässä. Tämän tutkimuksen tarkoituksena on tutkia, miten äidin suoliston mikrobisto, ruokavalio ja rintamaidon koostumus vaikuttavat vauvan FCP-tasoihin, sekä tunnistaa tekijöitä, jotka voivat ohjata ruokavaliointerventioita parantamaan vauvan terveyden lopputuloksia. Erityisesti tutkimuksen tavoitteena on: (1) tunnistaa raskausiin liittyvät äidin suoliston mikrobiston ja ruokavalion tekijät, jotka liittyvät kohonneisiin vauvan FCP-tasoihin, (2) määrittää vauvan suoliston mikrobiston ja ruokavalion tekijät, jotka liittyvät korkeisiin FCP-tasoihin, (3) validoida ohjattu koneoppimismalli, joka pystyy ennustamaan korkeita FCP-tasoja vauvoilla 1 vuoden iässä käyttäen mikrobiston ja ruokavaliodataa, ja (4) karakterisoida ihmisen maidon oligosakkaridien (HMO) koostumus IBD:llä olevien ja ilman IBD:ää olevien äitien rintamaidossa ja sen yhteys vauvan suoliston mikrobistoon ja FCP-tasoihin. Tämä prospektiivinen tutkimus arvioi mikrobiston ja ruokailutottumusten muutoksia raskauden aikana ja jälkeen IBD-potilailla (aktiivisella tai lepäävällä taudilla) ja ei-IBD-verrokkiryhmällä sekä heidän vauvoillaan. Osallistujat rekrytoidaan raskauden aikana (1., 2. ja 3. kolmanneksen alku), ja dataa ja näytteitä kerätään neljällä ajankohdalla: 3. kolmanneksella (viikko 34–35), 2 viikkoa synnytyksen jälkeen, 3 kuukautta synnytyksen jälkeen ja 1 vuosi synnytyksen jälkeen. Kerätty data sisältää 3 päivän ruokavaliomuistelut, äidin ja vauvan ulostenäytteet (mikrobiston koostumusta ja FCP-tasoja varten), valinnaiset rintamaito- ja rintaihon nuijayritykset, emättimen nuijayritykset sekä raskaus- ja vauvan lopputulokset. Nämä data integroidaan koneoppimismalliin ennustamaan korkeita vauvan FCP-tasoja 1 vuoden iässä ottaen huomioon tunnetut kovariaatit ja tutkimuksessa tunnistetut tekijät. Ensisijainen lopputulos on määrittää yhteys äidin suoliston mikrobiston koostumuksen – erityisesti tulehdusta hillitsevien bakteerien, kuten Faecalibacterium ja Bifidobacterium, runsauden – ja vauvan FCP-tasojen välillä 3 kuukauden ja 1 vuoden iässä, ottaen huomioon äidin noudattamisen välimerenruokavaliomalleja. Toissijaiset lopputulokset sisältävät koneoppimismallin kehittämisen ja validoinnin ennustamaan kohonneita vauvan FCP-tasoja 1 vuoden iässä, HMO-profiilien karakterisoinnin ja vertailun IBD:llä olevien ja ei-IBD-äitien välillä sekä niiden yhteydet vauvan suoliston mikrobistoon ja FCP-tasoihin, raskauslopputulosten vertailun haavaisessa paksusuolen tulehduksessa, Crohnin taudissa ja ei-IBD-verrokkiryhmässä – mukaan lukien IBD-hoidon ja synnytystavan vaikutus – sekä äidin ruokavalion, mikrobiston koostumuksen (suolisto, iho ja emätin) ja raskaus- ja vauvan lopputulosten yhteyksien tutkimisen kaikilla tutkimuksen ajanjaksoilla.