Badanie poziomów kalprotektyny w kale, mikrobioty matki i dziecka, zdrowia niemowląt, żywienia oraz niekorzystnych wyników ciąży u pacjentek z nieswoistymi zapaleniami jelit (CALINA-IBD)

Zapalna choroba jelit (IBD) jest przewlekłym schorzeniem przewodu pokarmowego, które często ujawnia się w latach rozrodczych, a około 25% pacjentów z IBD ma dzieci po postawieniu diagnozy. IBD w czasie ciąży może negatywnie wpływać na zdrowie niemowlęcia, ponieważ niemowlęta urodzone przez rodziców z IBD często wykazują wyższe poziomy kalprotektyny w kale (FCP), markera stanu zapalnego przewodu pokarmowego. Podwyższone poziomy FCP wiązały się ze zwiększonym ryzykiem astmy, egzemy i IBD w późniejszym życiu. Celem tego badania jest zbadanie, w jaki sposób mikrobiom jelitowy matki, dieta i skład mleka matki wpływają na poziomy FCP u niemowlęcia oraz zidentyfikowanie czynników, które mogą kierować interwencjami żywieniowymi w celu poprawy wyników zdrowotnych niemowląt. W szczególności badanie ma na celu: (1) zidentyfikowanie związanych z ciążą czynników mikroflory jelitowej matki i czynników żywieniowych związanych z podwyższonymi poziomami FCP u niemowląt, (2) określenie mikroflory jelitowej niemowląt i czynników żywieniowych związanych z wysokimi poziomami FCP, (3) walidację nadzorowanego modelu uczenia maszynowego zdolnego do przewidywania wysokich poziomów FCP u niemowląt w wieku 1 roku przy użyciu danych mikroflory i żywieniowych, oraz (4) scharakteryzowanie składu oligosacharydów mleka ludzkiego (HMO) w mleku matek z IBD i bez IBD oraz jego związku z mikroflorą jelitową niemowląt i poziomami FCP. To prospektywne badanie oceni zmiany w mikroflorze i nawykach żywieniowych podczas ciąży i po niej wśród pacjentek z IBD (z aktywną lub wyciszoną chorobą) i kontrolnych bez IBD oraz ich niemowląt. Uczestnicy będą rekrutowani w czasie ciąży (1., 2. i wczesny 3. trymestr), a dane i próbki będą zbierane w czterech punktach czasowych: 3. trymestr (tydzień 34-35), 2 tygodnie po porodzie, 3 miesiące po porodzie i 1 rok po porodzie. Zbierane dane będą obejmować 3-dniowe wywiady żywieniowe, próbki kału matki i niemowlęcia (dla składu mikroflory i poziomów FCP), opcjonalne próbki mleka matki i wymazy ze skóry piersi, wymazy z pochwy oraz wyniki ciąży i niemowląt. Dane te zostaną zintegrowane w modelu uczenia maszynowego do przewidywania wysokich poziomów FCP u niemowląt w wieku 1 roku, uwzględniając znane kowariancje i czynniki zidentyfikowane w tym badaniu. Pierwszorzędowym wynikiem jest określenie związku między składem mikroflory jelitowej matki – w szczególności obfitością bakterii przeciwzapalnych, takich jak Faecalibacterium i Bifidobacterium – w trzecim trymestrze i wczesnym okresie poporodowym a poziomami FCP u niemowląt w wieku 3 miesięcy i 1 roku, uwzględniając przestrzeganie przez matkę wzorców diety śródziemnomorskiej. Wyniki drugorzędowe obejmują opracowanie i walidację modelu uczenia maszynowego do przewidywania podwyższonego FCP u niemowląt w wieku 1 roku, scharakteryzowanie i porównanie profili HMO między matkami z IBD i bez IBD oraz ich związków z mikroflorą jelitową niemowląt i poziomami FCP, porównanie wyników ciąży między matkami z wrzodziejącym zapaleniem jelita grubego, chorobą Leśniowskiego-Crohna i kontrolnymi bez IBD – w tym wpływu terapii IBD i sposobu porodu – oraz zbadanie związków między dietą matki, składem mikroflory (jelitowej, skórnej i pochwowej) a wynikami ciąży i niemowląt we wszystkich punktach czasowych badania.