ctDNA-analyysin perustaminen arkistoiduista plasmanäytteistä (DARE-part1)

Tämä tutkimus (DARE osa 1) on yksikeskuksinen, retrospektiivinen, havainnoiva toteutettavuustutkimus, jota edistää Fondazione Policlinico Universitario Agostino Gemelli IRCCS ja osarahoittaa Fondazione AIRC. Sen tavoitteena on arvioida verenkierrossa olevan kasvain-DNA:n (ctDNA) kliinistä hyötyä minimaalisen jäännöstaudin (MRD) arvioinnissa potilailla, joilla on epiteliaalinen munasarjasyöpä (EOC). Varhaisvaiheen EOC:ssa nykyinen hoitostandardi on täydellinen kirurginen vaiheistus, jota seuraa platina-pohjainen adjuvanttikemoterapia suuren riskin potilailla; adjuvanttihoidon hyöty on kuitenkin edelleen kiistanalainen optimaalisesti vaiheistetuissa tapauksissa, koska selkeää kokonaiseloonjäämisen etua ei ole osoitettu. Aikaisempi näyttö on korostanut tavanomaisen vaiheistuksen rajoituksia ja tarkempien biomarkkereiden tarvetta uusiutumisriskissä olevien potilaiden tunnistamiseksi. ctDNA on noussut lupaavaksi ei-invasiiviseksi biomarkkeriksi MRD:n havaitsemiseen ja ennustamiseen useissa syövissä, mukaan lukien EOC, mutta sen rooli varhaisvaiheen taudissa parantavan leikkauksen jälkeen on edelleen epävarma, eikä sitä ole vielä tutkittu rekisteröidyissä tutkimuksissa, jotka ohjaisivat adjuvanttihoitopäätöksiä.

Tutkimuksessa analysoidaan retrospektiivisesti paritettuja preoperatiivisia (T0) ja postoperatiivisia (T1, 4-7 viikkoa leikkauksen jälkeen) plasmanäytteitä 50 potilaalta, joilla on epiteliaalinen munasarjasyöpä (pläkkäinen histologia poissuljettuna) ja joille on tehty parantava leikkaus eikä havaittavissa olevaa makroskooppista jäännöstautia. Kaikki näytteet on kerätty aiemmin tammikuun 2022 ja kesäkuun 2025 välillä muissa hyväksytyissä kliinisissä tutkimuksissa ja ne on säilytetty laitoksen biopankissa. ctDNA-analyysi suoritetaan edistyneellä seuraavan sukupolven sekvensointialustalla (NGS), joka integroi genomi- ja epigenomiprofiloinnin, ja laboratorioanalyysit tekee Guardant Health, kun taas kliiniset ja korrelaatioanalyysit suorittaa edistävä keskus. Ensisijainen päätepiste on ctDNA:n puhdistuma, määriteltynä binäärisenä muutoksena ctDNA:n havaittavuudessa ennen ja jälkeen leikkauksen. Toissijaisia päätepisteitä ovat ctDNA:n tilan korrelaatio kliinis-patologisten ominaisuuksien, kuten kasvaimen asteen, histologisen alatyypin ja FIGO-vaiheen kanssa, sekä ctDNA:n havaittavuuden ja etenemisvapaan eloonjäämisen välinen yhteys. Tilastollisissa analyyseissä verrataan paritettuja ctDNA-mittauksia McNemarin testillä, kun taas yhteyksiä kliinisiin muuttujiin ja eloonjäämistuloksiin tutkitaan logistisella regressiolla ja Coxin suhteellisten vaarojen malleilla, joita tukevat Kaplan-Meier-estimaatit.