Konfiguracja analizy ctDNA na zarchiwizowanych próbkach osocza (DARE-part1)

Badanie to (część DARE 1) jest jednoośrodkowym, retrospektywnym obserwacyjnym badaniem wykonalności promowanym przez Fondazione Policlinico Universitario Agostino Gemelli IRCCS i współfinansowanym przez Fondazione AIRC, mającym na celu ocenę klinicznej przydatności krążącego DNA nowotworowego (ctDNA) do oceny minimalnej choroby resztkowej (MRD) u pacjentek z nabłonkowym rakiem jajnika (EOC). We wczesnym stadium EOC obecny standard opieki obejmuje całkowitą ocenę stopnia zaawansowania chirurgicznego po której stosuje się chemioterapię adjuwantową opartą na platynie u pacjentek wysokiego ryzyka; jednak korzyść z leczenia adjuwantowego pozostaje kontrowersyjna w przypadkach optymalnie ocenionych, ponieważ nie wykazano wyraźnej przewagi w całkowitym przeżyciu. Wcześniejsze dowody podkreśliły ograniczenia konwencjonalnej oceny stopnia zaawansowania i potrzebę bardziej dokładnych biomarkerów do identyfikacji pacjentek o wyższym ryzyku nawrotu. ctDNA wyłoniło się jako obiecujący nieinwazyjny biomarker do wykrywania MRD i prognozowania w kilku nowotworach złośliwych, w tym EOC, ale jego rola we wczesnym stadium choroby po operacji leczniczej jest nadal niepewna i nie została jeszcze zbadana w zarejestrowanych badaniach kierujących decyzjami dotyczącymi leczenia adjuwantowego.

Badanie będzie retrospektywnie analizować sparowane przedoperacyjne (T0) i pooperacyjne (T1, 4-7 tygodni po operacji) próbki osocza od 50 pacjentek z nabłonkowym rakiem jajnika (z wyłączeniem histologii śluzowej), które przeszły operację z zamiarem wyleczenia i nie miały makroskopowej choroby resztkowej. Wszystkie próbki zostały wcześniej pobrane między styczniem 2022 a czerwcem 2025 w ramach innych zatwierdzonych badań klinicznych i są przechowywane w instytucjonalnym biobanku. Analiza ctDNA zostanie przeprowadzona przy użyciu zaawansowanej platformy sekwencjonowania nowej generacji (NGS) integrującej profilowanie genomiczne i epigenomiczne, a analizy laboratoryjne zostaną wykonane przez Guardant Health, podczas gdy analizy kliniczne i korelacyjne zostaną przeprowadzone przez ośrodek promujący. Pierwszorzędowym punktem końcowym jest klirens ctDNA, zdefiniowany jako binarna zmiana wykrywalności ctDNA między przed- i pooperacyjnymi punktami czasowymi. Drugorzędowe punkty końcowe obejmują korelację statusu ctDNA z cechami kliniczno-patologicznymi, takimi jak stopień złośliwości guza, podtyp histologiczny i stopień FIGO, a także związek między wykrywalnością ctDNA a przeżyciem wolnym od progresji. Analizy statystyczne porównają sparowane pomiary ctDNA za pomocą testu McNemara, podczas gdy powiązania ze zmiennymi klinicznymi i wynikami przeżycia zostaną zbadane za pomocą regresji logistycznej i modeli proporcjonalnego hazardu Coxa wspartych estymacjami Kaplana-Meiera.