Maladies mitochondriales - Séquençage du génome et du transcriptome à lecture longue dans les cas non résolus après la génomique à lecture courte
Aperçu de l'étude
Statut
Statut
Les conditions
Les conditions
Intervention / Traitement
Intervention / Traitement
Description détaillée
Dans le projet MiDiSeq (diagnostic monocentrique, prospectif et ouvert), les patients suspects d'une maladie mitochondriale ont été priorisés pour i) une probabilité a priori élevée pour une base génétique (par ex. antécédents familiaux positifs) ainsi que la disponibilité (ii) de lignées cellulaires de fibroblastes avec un phénotype biochimiquement défini, (iii) d'échantillons parentaux, (iv) d'ensembles de données à lecture courte sur le génome entier et le transcriptome et (v) de données métabolomiques et protéomiques supplémentaires facultatives.
Les questions suivantes guideront le projet :
i) comparer systématiquement différentes technologies de séquençage pour détecter les variations génétiques et épigénétiques et leur impact sur la régulation des gènes.
(ii) développer davantage des algorithmes pour les analyses intégratives de différents ensembles de données omiques.
(iii) étendre l'analyse du codage des variants mononucléotidiques (SNV) et des mutations régulatrices aux variants structurels (SV), aux expansions et contractions répétées, aux régions de faible complexité et aux signatures épigénétiques.
(iv) identifier de nouvelles altérations et mécanismes pathologiques. (v) acquérir de nouvelles connaissances fondamentales sur les mécanismes de la maladie et la biologie cellulaire.
(vi) améliorer le diagnostic génétique des futurs patients atteints de maladies rares et évaluer les options thérapeutiques personnalisées.
Type d'étude
Type d'étude
Inscription (Réel)
Inscription
Phase
Phase
- N'est pas applicable
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
Coordonnées de l'étude
- Nom: Olaf Rieß, Prof. Dr.
- Numéro de téléphone: +49 7071 298
- E-mail: olaf.riess@med.uni-tuebingen.de
Sauvegarde des contacts de l'étude
- Nom: Tobias Haack, Dr.
- Numéro de téléphone: 77696 +49 7071 298
- E-mail: tobias.haack@med.uni-tuebingen.de
Lieux d'étude
-
-
-
Tübingen, Allemagne, 72076
- University Hospital Tübingen
-
-
Critères de participation
Critère d'éligibilité
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Enfant
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
La description
Critère d'intégration:
Diagnostic peu clair Cause génétique suspectée de la maladie
Critère d'exclusion:
Absence de consentement éclairé du patient/tuteur légal
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Objectif principal: Science basique
- Répartition: N / A
- Modèle interventionnel: Affectation à un seul groupe
- Masquage: Aucun (étiquette ouverte)
Nombre de bras
Armes et Interventions
Groupe de participants / BrasGroupe de participants / Bras |
Intervention / TraitementIntervention / Traitement |
|---|---|
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Autre: Maladie mitochondriale
Patients index non résolus avec suspicion de maladie mitochondriale
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Détermination de la séquence d'acide nucléique
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
|
(Epi)Variation génétique
Délai: Un jour
|
Nombre de variations (épi)génétiques
|
Un jour
|
Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Parrainer
Les enquêteurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Tobias Haack, Dr., University Hospital Tübingen
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Début de l'étude
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement primaire
Achèvement de l'étude (Réel)
Achèvement de l'étude
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Première publication
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour publiée
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
Autres numéros d'identification d'étude
- MiDiSeq
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
produit fabriqué et exporté des États-Unis.
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