Mitochondriale ziekten - lang gelezen genoom- en transcriptoomsequencing in onopgeloste gevallen na kort gelezen genomics
Studie Overzicht
Toestand
Toestand
Conditie
Conditie
Interventie / Behandeling
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
In het MiDiSeq-project (monocentrisch, prospectief, open-label diagnostisch) gaven patiënten met vermoedelijke mitochondriale ziekte prioriteit aan i) hoge a priori waarschijnlijkheid voor een genetische basis (bijv. positieve familiegeschiedenis) evenals de beschikbaarheid van (ii) fibroblastcellijnen met een biochemisch gedefinieerd fenotype, (iii) ouderlijke monsters, (iv) kort gelezen volledige genoom- en transcriptoomdatasets en (v) optionele aanvullende metabolomics- en proteomics-gegevens.
De volgende vragen zullen leidend zijn in het project:
i) het systematisch benchmarken van verschillende sequencing-technologieën om genetische en epigenetische variatie en hun impact op genregulatie te detecteren.
(ii) het verder ontwikkelen van algoritmen voor integratieve analyses van verschillende 'omics datasets'.
(iii) om de analyse uit te breiden van coderende Single-Nucleotide Varianten (SNV's) en regulatoire mutaties naar structurele varianten (SV's), herhaalde uitbreidingen en samentrekkingen, regio's met lage complexiteit en epigenetische handtekeningen.
(iv) om nieuwe veranderingen en ziektemechanismen te identificeren. (v) fundamentele nieuwe inzichten verwerven in ziektemechanismen en celbiologie.
(vi) de genetische diagnostiek van toekomstige patiënten met een zeldzame ziekte verbeteren en gepersonaliseerde therapeutische opties evalueren.
Studietype
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Inschrijving
Fase
Fase
- Niet toepasbaar
Contacten en locaties
Studiecontact
Studiecontact
- Naam: Olaf Rieß, Prof. Dr.
- Telefoonnummer: +49 7071 298
- E-mail: olaf.riess@med.uni-tuebingen.de
Studie Contact Back-up
- Naam: Tobias Haack, Dr.
- Telefoonnummer: 77696 +49 7071 298
- E-mail: tobias.haack@med.uni-tuebingen.de
Studie Locaties
-
-
-
Tübingen, Duitsland, 72076
- University Hospital Tübingen
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Kind
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Beschrijving
Inclusiecriteria:
Onduidelijke diagnose Vermoedelijke genetische oorzaak van de ziekte
Uitsluitingscriteria:
Ontbrekende geïnformeerde toestemming van de patiënt/wettelijke voogd
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Primair doel: Fundamentele wetenschap
- Toewijzing: NVT
- Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
- Masker: Geen (open label)
Aantal wapens
Wapens en interventies
Deelnemersgroep / ArmDeelnemersgroep / Arm |
Interventie / BehandelingInterventie / Behandeling |
|---|---|
|
Ander: Mitochondriale ziekte
Onopgeloste indexpatiënten met vermoedelijke mitochondriale ziekte
|
Bepaling van de nucleïnezuursequentie
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
(Epi)Genetische variatie
Tijdsspanne: 1 dag
|
Aantal (epi)genetische variaties
|
1 dag
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Sponsor
Onderzoekers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Tobias Haack, Dr., University Hospital Tübingen
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Studie start
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Primaire voltooiing
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Eerst geplaatst
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update geplaatst
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
Andere studie-ID-nummers
- MiDiSeq
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
product vervaardigd in en geëxporteerd uit de V.S.
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .