Mitokondrielle sygdomme - langlæst genom og transkriptomsekvensering i tilfælde, der ikke er løst efter kortlæst genomik
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
I MiDiSeq (monocentrisk, prospektiv, åben-label diagnostisk) projekt prioriterede patienter med mistanke om mitokondriel sygdom i) høj a priori sandsynlighed for et genetisk grundlag (f.eks. positiv familiehistorie) samt tilgængelighed af (ii) fibroblastcellelinjer med en biokemisk defineret fænotype, (iii) forældreprøver, (iv) kortlæste hele genom- og transkriptomdatasæt og (v) valgfri yderligere metabolomik- og proteomikdata.
Følgende spørgsmål vil lede projektet:
i) systematisk at benchmarke forskellige sekventeringsteknologier for at detektere genetisk og epigenetisk variation og deres indvirkning på genregulering.
(ii) at videreudvikle algoritmer til integrative analyser af forskellige 'omics-datasæt.
(iii) at udvide analysen fra kodende enkeltnukleotidvarianter (SNV'er) og regulatoriske mutationer til strukturelle varianter (SV'er), gentagne udvidelser og sammentrækninger, regioner med lav kompleksitet og epigenetiske signaturer.
(iv) at identificere nye ændringer og sygdomsmekanismer. (v) at opnå grundlæggende ny indsigt i sygdomsmekanismer og cellulær biologi.
(vi) at forbedre genetisk diagnostik af fremtidige patienter med sjældne sygdomme og at evaluere personlige terapeutiske muligheder.
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Tilmelding
Fase
Fase
- Ikke anvendelig
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Olaf Rieß, Prof. Dr.
- Telefonnummer: +49 7071 298
- E-mail: olaf.riess@med.uni-tuebingen.de
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Tobias Haack, Dr.
- Telefonnummer: 77696 +49 7071 298
- E-mail: tobias.haack@med.uni-tuebingen.de
Studiesteder
-
-
-
Tübingen, Tyskland, 72076
- University Hospital Tübingen
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
Uklar diagnose Mistænkt genetisk årsag til sygdommen
Ekskluderingskriterier:
Manglende informeret samtykke fra patient/værge
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Primært formål: Grundvidenskab
- Tildeling: N/A
- Interventionel model: Enkelt gruppeopgave
- Maskning: Ingen (Åben etiket)
Antal våben
Våben og indgreb
Deltagergruppe / ArmDeltagergruppe / Arm |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Andet: Mitokondriel sygdom
Uafklarede indekspatienter med mistanke om mitokondriel sygdom
|
Bestemmelse af nukleinsyresekvensen
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
(Epi)Genetisk variation
Tidsramme: 1 dag
|
Antal (Epi)genetisk variation
|
1 dag
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Tobias Haack, Dr., University Hospital Tübingen
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Faktiske)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- MiDiSeq
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .