Mitokondriotaudit - Pitkään luetun genomin ja transkription sekvensointi tapauksissa, joita ei ole ratkaistu lyhyen genomitutkimuksen jälkeen
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Tila
Ehdot
Ehdot
Interventio / Hoito
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
MiDiSeq-projektissa (monocentric, prospective, open-label diagnostic) potilaat, joilla epäillään mitokondriosairauksia, asettivat etusijalle i) suuren a priori todennäköisyyden geneettisen perusteella (esim. positiivinen sukuhistoria) sekä (ii) fibroblastisolulinjojen, joilla on biokemiallisesti määritelty fenotyyppi, saatavuus, (iii) vanhempainnäytteet, (iv) lyhyesti luettavat koko genomi- ja transkriptiotietojoukot ja (v) valinnaiset metabolomiikka- ja proteomiikkatiedot.
Seuraavat kysymykset ohjaavat projektia:
i) vertailla järjestelmällisesti erilaisia sekvensointitekniikoita geneettisen ja epigeneettisen variaation ja niiden vaikutuksen geenisäätelyyn havaitsemiseksi.
(ii) kehittää edelleen algoritmeja erilaisten omics-aineistojen integratiivisiin analyyseihin.
(iii) laajentaa analyysia koodaavista yhden nukleotidin muunnelmista (SNV:t) ja säätelymutaatioista rakennemuunnelmiin (SV:t), toistuviin laajennuksiin ja supistuksiin, matalan kompleksisuuden alueisiin ja epigeneettisiin allekirjoituksiin.
(iv) tunnistaa uusia muutoksia ja sairausmekanismeja. (v) saada perustavanlaatuisia uusia näkemyksiä sairausmekanismeista ja solubiologiasta.
(vi) parantaa tulevien harvinaisia sairauksia sairastavien potilaiden geneettistä diagnostiikkaa ja arvioida yksilöllisiä hoitovaihtoehtoja.
Opintotyyppi
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Ilmoittautuminen
Vaihe
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
Opiskeluyhteys
- Nimi: Olaf Rieß, Prof. Dr.
- Puhelinnumero: +49 7071 298
- Sähköposti: olaf.riess@med.uni-tuebingen.de
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Tobias Haack, Dr.
- Puhelinnumero: 77696 +49 7071 298
- Sähköposti: tobias.haack@med.uni-tuebingen.de
Opiskelupaikat
-
-
-
Tübingen, Saksa, 72076
- University Hospital Tübingen
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
Epäselvä diagnoosi Epäillään taudin geneettistä syytä
Poissulkemiskriteerit:
Potilaan/laillisen huoltajan tietoinen suostumus puuttuu
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Perustiede
- Jako: Ei käytössä
- Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseiden lukumäärä
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / ArmOsallistujaryhmä / Arm |
Interventio / HoitoInterventio / Hoito |
|---|---|
|
Muut: Mitokondriaalinen sairaus
Ratkaisemattomat indeksipotilaat, joilla on epäilty mitokondriaalinen sairaus
|
Nukleiinihapposekvenssin määrittäminen
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
(Epi)Geneettinen variaatio
Aikaikkuna: 1 päivä
|
(Epi)Geneettisen muunnelman määrä
|
1 päivä
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Sponsori
Tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: Tobias Haack, Dr., University Hospital Tübingen
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Opiskelun aloitus
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Ensimmäinen Lähetetty
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin päivitys julkaistu
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
Muut tutkimustunnusnumerot
- MiDiSeq
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Yhdysvalloissa valmistettu ja sieltä viety tuote
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .