Mitokondrielle sykdommer - langlest genom og transkriptomsekvensering i tilfeller som ikke er løst etter kortlest genomikk
Studieoversikt
Status
Status
Forhold
Forhold
Intervensjon / Behandling
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
I MiDiSeq-prosjektet (monosentrisk, prospektiv, åpen diagnostisk) ble pasienter med mistenkt mitokondriell sykdom prioritert for i) høy a priori sannsynlighet for en genetisk basis (f.eks. positiv familiehistorie) samt tilgjengelighet av (ii) fibroblastcellelinjer med en biokjemisk definert fenotype, (iii) foreldreprøver, (iv) kortleste hele genom- og transkriptomdatasett og (v) valgfrie tilleggsdata om metabolomikk og proteomikk.
Følgende spørsmål vil lede prosjektet:
i) å systematisk benchmarke forskjellige sekvenseringsteknologier for å oppdage genetisk og epigenetisk variasjon og deres innvirkning på genregulering.
(ii) å videreutvikle algoritmer for integrerende analyser av forskjellige 'omics-datasett.
(iii) å utvide analysen fra kodende enkeltnukleotidvarianter (SNV) og regulatoriske mutasjoner til strukturelle varianter (SV), gjentatte utvidelser og sammentrekninger, regioner med lav kompleksitet og epigenetiske signaturer.
(iv) å identifisere nye endringer og sykdomsmekanismer. (v) å få grunnleggende ny innsikt i sykdomsmekanismer og cellulær biologi.
(vi) å forbedre genetisk diagnostikk av fremtidige pasienter med sjeldne sykdommer og å evaluere personlige terapeutiske alternativer.
Studietype
Studietype
Registrering (Faktiske)
Registrering
Fase
Fase
- Ikke aktuelt
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Olaf Rieß, Prof. Dr.
- Telefonnummer: +49 7071 298
- E-post: olaf.riess@med.uni-tuebingen.de
Studer Kontakt Backup
- Navn: Tobias Haack, Dr.
- Telefonnummer: 77696 +49 7071 298
- E-post: tobias.haack@med.uni-tuebingen.de
Studiesteder
-
-
-
Tübingen, Tyskland, 72076
- University Hospital Tübingen
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
Uklar diagnose Mistenkt genetisk årsak til sykdommen
Ekskluderingskriterier:
Mangler informert samtykke fra pasient/verge
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Primært formål: Grunnvitenskap
- Tildeling: N/A
- Intervensjonsmodell: Enkeltgruppeoppdrag
- Masking: Ingen (Open Label)
Antall våpen
Våpen og intervensjoner
Deltakergruppe / ArmDeltakergruppe / Arm |
Intervensjon / BehandlingIntervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Annen: Mitokondriell sykdom
Uløste indekspasienter med mistenkt mitokondriell sykdom
|
Bestemme nukleinsyresekvensen
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
(Epi)Genetisk variasjon
Tidsramme: 1 dag
|
Antall (Epi)genetisk variasjon
|
1 dag
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Sponsor
Etterforskere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Tobias Haack, Dr., University Hospital Tübingen
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær fullføring (Faktiske)
Primær fullføring
Studiet fullført (Faktiske)
Studiet fullført
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Først lagt ut
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Sist oppdatering lagt ut
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
Andre studie-ID-numre
- MiDiSeq
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
produkt produsert i og eksportert fra USA
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .