Une étude de l'analyse génétique des troubles cérébraux

L'holoprosencéphalie (HPE) couvre un spectre presque continu d'anomalies de la ligne médiane allant de la cyclopie indubitable avec absence de séparation du cerveau antérieur à des microformes légères, telles qu'une seule incisive centrale.

L'objectif de ces études est d'identifier les facteurs génétiques (codants et non codants) qui contribuent à la pathogenèse de l'holoprosencéphalie (HPE) ou des malformations cérébrales associées. Notre approche implique des stratégies génétiques communes, y compris l'analyse mutationnelle des gènes candidats. Toutes les personnes présentant des résultats cliniques manifestes ou subtils compatibles avec le spectre HPE sont éligibles pour participer. L'analyse mutationnelle de l'ensemble de notre collection codée de probands HPE (environ 600 cas) dans des gènes sélectionnés est la principale méthode de recherche utilisée pour déterminer qu'un gène candidat donné est couramment muté dans HPE. Cette approche concerne un ou plusieurs gènes ou éléments génétiques individuels ainsi que des panels de capture ciblés qui étudient des ensembles de gènes de centaines de gènes du développement dont l'implication dans le développement du cerveau est soutenue par la littérature de recherche fondamentale. Nous demandons également d'inclure la possibilité d'étudier l'ensemble des facteurs génétiques présents dans l'ADN ou l'ARN des patients atteints d'HPE par le biais d'une proposition de modification des documents de consentement. Chaque fois qu'un variant de séquence est identifié, qui n'est pas présent dans un ensemble d'échantillons de contrôle disponible dans le commerce, des tentatives sont faites pour tester la signification fonctionnelle de ce changement sur la protéine elle-même, ou son expression. Les changements de séquence avec une forte probabilité d'être médicalement significatifs seront vérifiés dans un laboratoire agréé CLIA (par ex. laboratoire Muneke, pour les gènes sélectionnés, ou laboratoire commercial) à nos frais, avant que les résultats ne soient communiqués à la famille par le biais du conseil génétique. L'ADN parental (et rarement celui des frères et sœurs) est généralement obtenu en même temps qu'un proposant est enrôlé. En règle générale, ces échantillons ne sont étudiés que pour effectuer des études familiales limitées une fois qu'une variante de séquence d'importance médicale potentielle a déjà été déterminée. La participation des parents directs par le sang est encouragée car pratiquement toutes les mutations osseuses sont soit spécifiques à la famille, soit de novo. Ces informations familiales sont essentielles pour la détermination de la recherche des facteurs de risque génétiques et un conseil génétique précis.

La majorité des sujets inscrits à cette étude continueront sous les soins de leur médecin local ou conseiller en génétique avec des contacts limités avec les enquêteurs des NIH. Les familles ne seront que rarement vues au NIH CC. Ces visites impliqueront un conseil génétique en face à face des résultats médicalement significatifs, après vérification dans un laboratoire agréé CLIA. Ceci n'est pas un protocole de traitement. Notre capacité empirique à générer des résultats de recherche médicalement significatifs est limitée par la vaste hétérogénéité génétique et étiologique. Par conséquent, pour la plupart des participants, cette recherche n'est pas une étude diagnostique.

Nous avons modifié nos procédures pour tester tous les nouveaux proposants pour des mutations dans les quatre gènes HPE (SHH, ZIC2, SIX3 et TGIF). Au fur et à mesure que de nouveaux éléments génétiques conférant un risque d'HPE sont identifiés, nous avons l'intention d'ajouter des tests supplémentaires à ce panel. Notre laboratoire est maintenant certifié pour recevoir et tester de nouveaux échantillons conformément aux directives CLIA. Cependant, tous les échantillons précédemment collectés ne seront pas considérés comme appropriés à des fins de diagnostic ; par conséquent, un deuxième échantillon devra être demandé dans ces cas pour la confirmation CLIA.