Tutkimus aivosairauksien geneettisestä analyysistä

Holoprosenkefalia (HPE) kattaa lähes jatkuvan kirjon keskilinjan poikkeavuuksia, jotka vaihtelevat selkeästä sykloopiasta, jossa ei ole etuaivojen erotusta, lieviin mikromuotoihin, kuten yhteen etuhampaan.

Näiden tutkimusten tavoitteena on tunnistaa geneettisiä tekijöitä (koodaavia ja ei-koodaavia), jotka vaikuttavat holoprosenkefalian (HPE) tai siihen liittyvien aivoepämuodostumien patogeneesiin. Lähestymistapamme sisältää yhteisiä geneettisiä strategioita, mukaan lukien ehdokasgeenien mutaatioanalyysi. Kaikki henkilöt, joilla on selvät tai hienovaraiset kliiniset löydökset, jotka ovat yhdenmukaisia ​​HPE-spektrin kanssa, voivat osallistua. Koko koodatun HPE-koettimien kokoelmamme (noin 600 tapausta) mutaatioanalyysi valituissa geeneissä on tärkein tutkimusmenetelmä, jota käytetään määrittämään, että tietty ehdokasgeeni on yleisesti mutatoitunut HPE:ssä. Tämä lähestymistapa koskee yksittäisiä geenejä tai geneettisiä elementtejä sekä kohdennettuja sieppauspaneeleja, jotka tutkivat satojen kehitysgeenien geenisarjoja, joiden osallistumista aivojen kehitykseen tukee perustutkimuskirjallisuus. Pyydämme myös mahdollisuutta tutkia HPE-potilaiden DNA:ssa tai RNA:ssa esiintyviä geneettisiä tekijöitä ehdotetun muutoksen kautta suostumusasiakirjoihin. Aina kun tunnistetaan sekvenssivariantti, jota ei ole läsnä kaupallisesti saatavilla olevassa kontrollinäytesarjassa, yritetään testata tämän muutoksen toiminnallista merkitystä itse proteiinille tai sen ilmentymiselle. Sekvenssimuutokset, jotka ovat suurella todennäköisyydellä lääketieteellisesti merkittäviä, varmistetaan CLIA:n hyväksymässä laboratoriossa (esim. Muneke Lab, valituille geeneille tai kaupallinen laboratorio) meidän kustannuksellamme, ennen kuin tuloksia annetaan perheelle geneettisen neuvonnan kautta. Vanhempien DNA (ja harvoin sisarusten) saadaan yleensä samaan aikaan, kun koehenkilö rekisteröidään. Tyypillisesti näitä näytteitä tutkitaan vain rajoitetun perhetutkimuksen suorittamiseksi, kun mahdollisesti lääketieteellisesti merkittävä sekvenssivariantti on jo määritetty. Veren suorien sukulaisten osallistumista kannustetaan, koska käytännössä kaikki luumutaatiot ovat joko perhespesifisiä tai de novo. Tällainen perhetieto on kriittistä geneettisten riskitekijöiden tutkimuksellisen määrittämisen ja tarkan geneettisen neuvonnan kannalta.

Suurin osa tähän tutkimukseen otetuista koehenkilöistä jatkaa paikallisen lääkärinsä tai geneettisen neuvonantajansa hoidossa ja on rajoitetusti yhteydessä NIH:n tutkijoihin. Vain harvoin perheitä nähdään NIH CC: ssä. Näihin vierailuihin sisältyy kasvokkain tapahtuvaa geneettistä neuvontaa lääketieteellisesti merkittävistä tuloksista CLIA:n hyväksymässä laboratoriossa suoritetun tarkastuksen jälkeen. Tämä ei ole hoitoprotokolla. Empiiristä kykyämme tuottaa lääketieteellisesti merkittäviä tutkimustuloksia rajoittaa laaja geneettinen ja muu etiologinen heterogeenisyys. Siksi useimmille osallistujille tämä tutkimus ei ole diagnostinen tutkimus.

Olemme muuntaneet menettelyjämme testataksemme kaikki uudet koettimet mutaatioiden varalta neljässä HPE-geenissä (SHH, ZIC2, SIX3 ja TGIF). Kun uusia geneettisiä elementtejä, jotka aiheuttavat riskin HPE:lle, tunnistetaan, aiomme lisätä tähän paneeliin lisätestejä. Laboratoriomme on nyt sertifioitu vastaanottamaan ja testaamaan uusia näytteitä CLIA:n ohjeiden mukaisesti. Kaikkia aiemmin kerättyjä näytteitä ei kuitenkaan pidetä sopivina diagnostisiin tarkoituksiin. Tästä syystä näissä tapauksissa on pyydettävä toinen näyte CLIA-vahvistusta varten.