Az agyi rendellenességek genetikai elemzésének tanulmánya

A holoprosencephalia (HPE) a középvonali rendellenességek szinte folyamatos spektrumát fedi le, az összetéveszthetetlen ciklopiától az előagyi elválasztás hiányával az enyhe mikroformákig, például egyetlen központi metszőfogig.

E vizsgálatok célja olyan genetikai tényezők (kódoló és nem kódoló) azonosítása, amelyek hozzájárulnak a holoprosencephalia (HPE) vagy a kapcsolódó agyi malformációk patogeneziséhez. Megközelítésünk közös genetikai stratégiákat foglal magában, beleértve a jelölt gének mutációs elemzését. Minden olyan személy részt vehet, aki a HPE spektrummal összhangban lévő nyilvánvaló vagy finom klinikai leletekkel rendelkezik. A HPE-próbáink teljes kódolt gyűjteményének (körülbelül 600 eset) kiválasztott génekben történő mutációs elemzése a fő kutatási módszer annak meghatározására, hogy egy adott jelölt gén általában mutációt mutat-e a HPE-ben. Ez a megközelítés egy egyedi gén(ek)re vagy genetikai elem(ek)re, valamint a célzott rögzítő panelekre vonatkozik, amelyek több száz olyan fejlődési génből álló génkészleteket vizsgálnak, amelyek agyfejlődésben való részvételét az alapkutatási irodalom támogatja. Arra is kérünk, hogy a beleegyezési dokumentumokban javasolt változtatás révén a HPE-ben szenvedő betegek DNS-ében vagy RNS-ében jelenlévő genetikai faktorok teljes készletének vizsgálatára is lehetőség legyen. Amikor olyan szekvenciaváltozatot azonosítanak, amely nincs jelen a kereskedelemben kapható kontroll mintákban, megpróbálják tesztelni ennek a változásnak a funkcionális jelentőségét magán a fehérjén vagy annak expressziójában. A nagy valószínűséggel orvosilag jelentős szekvencia-változásokat a CLIA által jóváhagyott laboratóriumban igazolják (pl. Muneke labor, a kiválasztott génekhez, vagy kereskedelmi labor) a mi költségünkre, mielőtt bármilyen eredményt adna a családnak genetikai tanácsadáson keresztül. A szülői DNS-t (és ritkán a testvérekét) rendszerint a proband felvételével egyidőben szerzik meg. Általában ezeket a mintákat csak korlátozott családi vizsgálatok elvégzésére tanulmányozzák, miután már meghatározták a potenciális orvosi jelentőségű szekvenciaváltozatot. A közvetlen vérrokonok részvétele javasolt, mivel gyakorlatilag minden csonthideg mutáció vagy családspecifikus, vagy de novo. Az ilyen családi információk elengedhetetlenek a genetikai kockázati tényezők kutatási meghatározásához és a pontos genetikai tanácsadáshoz.

A vizsgálatba bevont alanyok többsége továbbra is helyi orvosa vagy genetikai tanácsadója felügyelete alatt marad, korlátozott kapcsolattartással az NIH kutatóival. Csak ritkán láthatnak családokat az NIH CC-n. Ezek a látogatások személyes genetikai tanácsadást foglalnak magukban az orvosilag jelentős eredményekről, a CLIA által jóváhagyott laboratóriumban végzett ellenőrzést követően. Ez nem kezelési protokoll. Empirikus képességünket orvosilag jelentős kutatási eredmények előállítására korlátozza a kiterjedt genetikai és egyéb etiológiai heterogenitás. Ezért a legtöbb résztvevő számára ez a kutatás nem diagnosztikai vizsgálat.

Módosítottuk eljárásainkat, hogy minden új próbát teszteljünk a négy HPE gén (SHH, ZIC2, SIX3 és TGIF) mutációira. Mivel új genetikai elemeket azonosítanak, amelyek kockázatot jelentenek a HPE számára, további tesztekkel kívánjuk kiegészíteni ezt a panelt. Laboratóriumunk a CLIA irányelveinek megfelelően tanúsítvánnyal rendelkezik új minták fogadására és tesztelésére. Azonban az összes korábban gyűjtött minta nem tekinthető alkalmasnak diagnosztikai célokra; ezért ezekben az esetekben egy második mintát kell kérni a CLIA megerősítéséhez.