Analyse omique complète des tumeurs solides pédiatriques et établissement d'un référentiel pour les études biologiques connexes

Arrière plan:

-Les recherches en laboratoire ont contribué à une meilleure compréhension de la biologie du cancer et au développement de nouvelles thérapies pour les malignités pédiatriques.

Objectifs:

-Profilage systématique moléculaire, génomique, protéomique, métabolomique (omique) et autres pour les sujets inscrits.

Admissibilité:

Sujets pédiatriques ou adultes de tout âge présentant l'un des éléments suivants :

• Diagnostic de toute tumeur ou malignité, trouble précancéreux ou syndromes familiaux suspectés de susceptibilité au cancer, quel que soit l'âge
• Personnes sans tumeur maligne subissant une intervention chirurgicale, un autre traitement ou une visite de puits normale.
• Parents biologiques d'un sujet atteint d'une tumeur ou d'une malignité pédiatrique ou d'un syndrome de cancer familial suspecté.
• Patients inscrits dans un protocole d'accompagnement approuvé
• Échantillons de sang et/ou de tissus qui ont déjà été prélevés et qui sont disponibles pour des analyses de recherche
• Les échantillons biologiques peuvent être prélevés avec un risque supplémentaire minimal pour le sujet lors de l'échantillonnage ou des procédures requises pour les soins de routine aux patients.

Concevoir:

• Cette étude permettra la collecte d'échantillons pour un dépôt de tissus et pour des enquêtes sur des échantillons désignés, y compris le profilage moléculaire, génomique et protéomique (omique) systématique, et des enquêtes sur les facteurs de croissance et le profil cellulaire.

• Les activités de test peuvent inclure :

  • L'ADN, l'ARN et les protéines seront extraits d'une section d'échantillons tumoraux, le reste sera stocké.
  • L'ADN et l'ARN de la lignée germinale seront extraits des lymphocytes ou d'autres tissus normaux non impliqués
  • L'ADN de la lignée germinale sera extrait des lymphocytes ou d'autres tissus normaux non impliqués des parents biologiques du sujet.
  • Xénogreffes, explants et lignées cellulaires établies à partir d'échantillons tumoraux, précancéreux et normaux
  • Échantillons de tumeurs et échantillons de cellules tumorales circulantes envoyés pour l'établissement de xénogreffes et suspension unicellulaire de tumeur pour le dépistage de drogues
  • Des études omiques (génomique et protéomique) seront réalisées
  • Enquêtes sur les facteurs de croissance et le profil cellulaire des populations de cellules dérivées de la moelle osseuse pour inclure la quantification des cellules progénitrices hématopoïétiques (HPC), des cellules progénitrices endothéliales (EPC) et des cellules progénitrices mésenchymateuses (MPC), des niveaux de métalloprotéases matricielles 2 et 9 (MMP2) et (MMP9), expression génique, analyse des facteurs de croissance et des microvésicules et analyse de la moelle osseuse des cellules progénitrices dans le sang et les tissus.
  • Tests de recherche décrits dans les protocoles actifs approuvés par l'IRB
  • Profilage immunitaire et profilage stromal du sang, des tumeurs et des tissus normaux
  • Études de la fonction immunitaire à partir de sang et de tissus tumoraux normaux
• Utiliser un comité de surveillance pour superviser la réception et la distribution de tissus non liés à d'autres chercheurs.
• Des méthodologies qualitatives seront utilisées pour vérifier les connaissances, les attitudes, les croyances et les comportements de 25 à 35 parents/soignants du NIH concernant l'utilisation prévue du NGS pour diagnostiquer et orienter le traitement du cancer pédiatrique et comment les découvertes fortuites pourraient être renvoyées.
• Accroissement prévu de 100 à 150 patients par an.