Lasten kiinteiden kasvainten kattava omiikka-analyysi ja niihin liittyvien biologisten tutkimusten arkiston perustaminen

Tausta:

-Laboratoriotutkimukset ovat auttaneet ymmärtämään paremmin syövän biologiaa ja kehittämään uusia hoitomuotoja lasten pahanlaatuisiin kasvaimiin.

Tavoitteet:

-Systemaattinen molekyyli-, genominen, proteominen, aineenvaihdunta (Omic) ja muu profilointi ilmoittautuneille koehenkilöille.

Kelpoisuus:

Minkä tahansa ikäiset lapset tai aikuiset, joilla on jokin seuraavista:

• Minkä tahansa kasvaimen tai pahanlaatuisen kasvaimen, esipahanlaatuisen sairauden tai epäiltyjen syöpäalttiuden familiaalisten oireyhtymien diagnoosi iästä riippumatta
• Henkilöt, joilla ei ole pahanlaatuista kasvainta, joutuvat leikkaukseen, muuhun hoitoon tai normaaliin kaivokäyntiin.
• Potilaan biologiset sukulaiset, joilla on lasten kasvain tai pahanlaatuisuus tai epäillään familiaalista syöpäoireyhtymää.
• Potilaat, jotka on rekisteröity hyväksyttyyn kumppaniprotokollaan
• Veri- ja/tai kudosnäytteet, jotka on kerätty aiemmin ja jotka ovat käytettävissä tutkimusanalyysiin
• Bionäytteitä voidaan kerätä siten, että potilaalle aiheutuu mahdollisimman vähän lisäriskiä näytteenoton tai potilaan rutiinihoidon edellyttämien toimenpiteiden aikana.

Design:

• Tämä tutkimus mahdollistaa näytteiden keräämisen kudosvarastoa varten ja määrätyt näytetutkimukset, mukaan lukien systemaattinen molekyyli-, genominen ja proteominen (Omic) profilointi sekä kasvutekijä- ja soluprofiilitutkimukset.

• Testaustoimintaan voi kuulua:

  • DNA, RNA ja proteiini uutetaan osasta kasvainnäytteitä, loput varastoidaan.
  • Sukulinjan DNA ja RNA uutetaan lymfosyyteistä tai muusta normaalista kudoksesta
  • Sukulinjan DNA uutetaan kohteen biologisten sukulaisten lymfosyyteistä tai muusta normaalista kudoksesta.
  • Ksenograftit, eksplantti ja solulinjat, jotka on muodostettu kasvain-, esipahanlaatuisista ja normaaleista näytteistä
  • Kasvainnäytteet ja kiertävien kasvainsolujen näytteet lähetetty ksenograftien ja tuumorin yksisolususpension perustamiseen lääketestausta varten
  • Omics (Genomics ja Proteomic) tutkimukset suoritetaan
  • Luuytimestä peräisin olevien solupopulaatioiden kasvutekijä- ja soluprofiilitutkimukset sisältäen hematopiettisten progenitorisolujen (HPC:t), endoteelisolujen (EPC:t) ja mesenkymaalisten progenitorisolujen (MPC:t), matriksin metalloproteaasin 2 ja 9 (MMP2) tasojen ja (MMP9), geeniekspressio, kasvutekijä- ja mikrovesikkelianalyysi sekä progenitorisolujen luuydinanalyysi veressä ja kudoksessa.
  • Aktiivisissa IRB-hyväksytyissä protokollissa kuvatut tutkimustestit
  • Veren, kasvaimen ja normaalien kudosten immuuni- ja stroomaprofilointi
  • Immuunitoiminnan tutkimukset verestä ja normaalista kasvainkudoksesta
• Valvontakomitean käyttäminen valvomaan liittämättömien kudosten vastaanottamista ja jakelua muille tutkijoille.
• Laadullisia menetelmiä käytetään 25–35 NIH:n vanhemman/hoitajan tiedon, asenteiden, uskomusten ja käytösten selvittämiseen liittyen NGS:n oletettuun käyttöön lasten syövän diagnosoinnissa ja hoidon ohjaamisessa ja siitä, miten satunnaiset löydökset voidaan palauttaa.
• Arvioitu kertyvä 100-150 potilasta vuodessa.