Omfattende Omics-analyse af pædiatriske solide tumorer og etablering af et depot for relaterede biologiske undersøgelser

Baggrund:

-Laboratoriebaserede undersøgelser har bidraget til en forbedret forståelse af kræftens biologi og til udviklingen af ​​nye behandlingsformer for pædiatriske maligniteter.

Mål:

-Systematisk molekylær, genomisk, proteomisk, metabolomisk (Omic) og anden profilering for tilmeldte forsøgspersoner.

Berettigelse:

Pædiatriske eller voksne personer i alle aldre med en af ​​følgende:

• Diagnosticering af enhver tumor eller malignitet, præ-malign lidelse eller formodet cancermodtagelighed familiære syndromer, uanset alder
• Personer uden malignitet, der gennemgår operation, anden behandling eller normalt brøndbesøg.
• Biologiske slægtninge til et individ med en pædiatrisk tumor eller malignitet eller med mistanke om familiært cancersyndrom.
• Patienter indskrevet i en godkendt ledsagerprotokol
• Blod- og/eller vævsprøver, der tidligere er blevet indsamlet og er tilgængelige for forskningsanalyse
• Bioprøver kan indsamles med minimal yderligere risiko for forsøgspersonen under prøveudtagning eller procedurer, der kræves til rutinemæssig patientbehandling.

Design:

• Denne undersøgelse vil give mulighed for indsamling af prøver til et vævsdepot og for udpegede prøveundersøgelser, herunder systematisk molekylær, genomisk og proteomisk (Omic) profilering, og vækstfaktor- og cellulære profilundersøgelser.

• Testaktiviteter kan omfatte:

  • DNA, RNA og protein vil blive ekstraheret fra en sektion af tumorprøver, resten vil blive opbevaret.
  • Kimlinje-DNA og RNA vil blive ekstraheret fra lymfocytter eller andet normalt ikke-involveret væv
  • Kimlinje-DNA vil blive ekstraheret fra lymfocytter eller andet normalt ikke-involveret væv fra de biologiske slægtninge til individet.
  • Xenografter, eksplantater og cellelinjer etableret fra tumorprøver, præ-maligne og normale prøver
  • Tumorprøver og prøver til cirkulerende tumorceller sendt til etablering af Xenografts og enkeltcellesuspension af tumor til lægemiddeltestning
  • Omics (Genomics og Proteomic) undersøgelser vil blive udført
  • Vækstfaktor- og celleprofilundersøgelser af knoglemarvs-afledte cellepopulationer for at inkludere kvantificering af hæmatopietiske progenitorceller (HPC'er), endotel-progenitorceller (EPC'er) og mesenkymale progenitorceller (MPC'er), niveauer af matrix metalloprotease 2 og 9 (MMP2) og (MMP9), genekspression, vækstfaktor- og mikrovesikelanalyse og knoglemarvsanalyse af progenitorceller i blod og væv.
  • Forskningstest beskrevet i aktive IRB godkendte protokoller
  • Immunprofilering og stromal profilering af blod, tumor og normalt væv
  • Immunfunktionsundersøgelser fra blod og normalt tumorvæv
• Brug af et tilsynsudvalg til at føre tilsyn med modtagelsen og distributionen af ​​ikke-forbundne væv til andre efterforskere.
• Kvalitative metoder vil blive brugt til at fastslå viden, holdninger, overbevisninger og adfærd hos 25-35 forældre/plejere på NIH vedrørende den forventede brug af NGS til diagnosticering og styring af terapi for pædiatrisk cancer, og hvordan tilfældige fund kan returneres.
• Forventet tilvækst 100-150 patienter om året.