Uitgebreide Omics-analyse van pediatrische solide tumoren en oprichting van een opslagplaats voor verwante biologische onderzoeken

Achtergrond:

- Laboratoriumonderzoeken hebben bijgedragen tot een beter begrip van de biologie van kanker en tot de ontwikkeling van nieuwe therapieën voor maligniteiten bij kinderen.

Doelstellingen:

-Systematische moleculaire, genomische, proteomische, metabolomische (Omic) en andere profilering voor ingeschreven proefpersonen.

Geschiktheid:

Pediatrische of volwassen proefpersonen van elke leeftijd met een van de volgende:

• Diagnose van elke tumor of maligniteit, premaligne aandoening of vermoedelijke vatbaarheid voor kanker familiale syndromen, ongeacht de leeftijd
• Personen zonder maligniteit die een operatie, een andere behandeling of een normaal bezoek ondergaan.
• Biologische familieleden van een proefpersoon met een pediatrische tumor of maligniteit of met een vermoeden van familiair kankersyndroom.
• Patiënten ingeschreven in een goedgekeurd begeleidend protocol
• Bloed- en/of weefselmonsters die eerder zijn afgenomen en beschikbaar zijn voor onderzoeksanalyse
• Biospecimens kunnen worden verzameld met minimaal extra risico voor de proefpersoon tijdens bemonstering of procedures die nodig zijn voor routinematige patiëntenzorg.

Ontwerp:

• Deze studie zal het verzamelen van monsters voor een Tissue Repository mogelijk maken, en voor aangewezen monsteronderzoeken, waaronder systematische moleculaire, genomische en proteomische (Omic) profilering, en groeifactor- en cellulair profielonderzoeken.

• Testactiviteiten kunnen zijn:

  • DNA, RNA en eiwit worden geëxtraheerd uit een deel van de tumormonsters, de rest wordt opgeslagen.
  • Kiembaan-DNA en -RNA worden geëxtraheerd uit lymfocyten of ander normaal niet-betrokken weefsel
  • Kiemlijn-DNA zal worden geëxtraheerd uit lymfocyten of ander normaal niet-betrokken weefsel van de biologische verwanten van het subject.
  • Xenotransplantaten, explantaat en cellijnen vastgesteld op basis van tumormonsters, premaligne monsters en normale monsters
  • Tumormonsters en monsters voor circulerende tumorcellen verzonden voor het opzetten van xenotransplantaten en eencellige suspensie van tumoren voor het testen van geneesmiddelen
  • Omics (Genomics en Proteomic) studies zullen worden uitgevoerd
  • Groeifactor- en cellulair profielonderzoek van uit beenmerg afgeleide celpopulaties, inclusief kwantificering van hematopietische voorlopercellen (HPC's), endotheliale voorlopercellen (EPC's) en mesenchymale voorlopercellen (MPC's), niveaus van matrix metalloprotease 2 en 9 (MMP2) en (MMP9), genexpressie, groeifactor- en microvesikelanalyse en beenmerganalyse van progenitorcellen in bloed en weefsel.
  • Onderzoekstests beschreven in actieve IRB-goedgekeurde protocollen
  • Immuunprofilering en stromale profilering van bloed, tumor en normale weefsels
  • Immuunfunctiestudies uit bloed en normaal tumorweefsel
• Gebruikmaken van een toezichtscommissie om toezicht te houden op de ontvangst en de distributie van niet-gekoppelde weefsels aan andere onderzoekers.
• Kwalitatieve methodologieën zullen worden gebruikt om kennis, attitudes, overtuigingen en gedrag vast te stellen bij 25-35 ouders/verzorgers bij NIH met betrekking tot het verwachte gebruik van NGS voor het diagnosticeren en sturen van therapie voor kinderkanker en hoe nevenbevindingen kunnen worden geretourneerd.
• Verwachte opbouw 100-150 patiënten per jaar.