Omfattende Omics-analyse av pediatriske solide svulster og etablering av et depot for relaterte biologiske studier

Bakgrunn:

-Laboratoriebaserte undersøkelser har bidratt til en forbedret forståelse av kreftbiologien og til utvikling av nye terapier for pediatriske maligniteter.

Mål:

-Systematisk molekylær, genomisk, proteomisk, metabolomisk (Omic) og annen profilering for påmeldte fag.

Kvalifisering:

Pediatriske eller voksne personer i alle aldre med ett av følgende:

• Diagnostisering av enhver svulst eller malignitet, pre-malign lidelse eller mistanke om familiære kreftfølsomme syndromer, uavhengig av alder
• Personer uten malignitet som gjennomgår kirurgi, annen behandling eller normalt brønnbesøk.
• Biologiske slektninger til et individ med en pediatrisk svulst eller malignitet eller med mistanke om familiært kreftsyndrom.
• Pasienter registrert i en godkjent ledsagerprotokoll
• Blod- og/eller vevsprøver som er tatt tidligere og er tilgjengelige for forskningsanalyse
• Bioprøver kan tas med minimal tilleggsrisiko for forsøkspersonen under prøvetaking eller prosedyrer som kreves for rutinemessig pasientbehandling.

Design:

• Denne studien vil tillate innsamling av prøver for et vevsdepot, og for utpekte prøveundersøkelser, inkludert systematisk molekylær, genomisk og proteomisk (Omic) profilering, og vekstfaktor- og cellulære profilundersøkelser.

• Testaktiviteter kan omfatte:

  • DNA, RNA og protein vil bli ekstrahert fra en del av tumorprøver, resten vil bli lagret.
  • Kimlinje-DNA og RNA vil bli ekstrahert fra lymfocytter eller annet normalt uinvolvert vev
  • Kimlinje-DNA vil bli ekstrahert fra lymfocytter eller annet normalt uinvolvert vev fra de biologiske slektningene til individet.
  • Xenografter, eksplantater og cellelinjer etablert fra tumorprøver, pre-maligne og normale prøver
  • Tumorprøver og prøver for sirkulerende tumorceller sendt for etablering av Xenografts og enkeltcellesuspensjon av tumor for medikamenttesting
  • Omics (Genomics og Proteomic) studier vil bli utført
  • Undersøkelser av vekstfaktor og celleprofil av benmargsavledede cellepopulasjoner for å inkludere kvantifisering av hematopietiske stamceller (HPC), endoteliale stamceller (EPC) og mesenkymale stamceller (MPC), nivåer av matrisemetalloprotease 2 og 9 (MMP2) og (MMP9), genuttrykk, vekstfaktor og mikrovesikkelanalyse og benmargsanalyse av stamceller i blod og vev.
  • Forskningstester beskrevet i aktive IRB-godkjente protokoller
  • Immunprofilering og stromal profilering av blod, tumor og normalt vev
  • Immunfunksjonsstudier fra blod og normalt tumorvev
• Bruke en tilsynskomité for å føre tilsyn med mottak og distribusjon av ukoblet vev til andre etterforskere.
• Kvalitative metoder vil bli brukt for å fastslå kunnskap, holdninger, tro og atferd hos 25-35 foreldre/omsorgspersoner ved NIH angående forventet bruk av NGS for å diagnostisere og lede terapi for pediatrisk kreft og hvordan tilfeldige funn kan returneres.
• Forventet opptjening 100-150 pasienter per år.