Colonisation avec des organismes producteurs de bêta-lactamase à spectre étendu (BLSE)

L'incidence croissante des infections causées par les entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) est de dimension mondiale, en particulier dans les pays en développement. A l'American University of Beirut Medical Center (AUB-MC), la proportion de souches E. coli productrices de BLSE (BLSE-EC) et K. pneumoniae (BLSE-KP) est passée de 2,5 % et 9,8 % à 22 % et 27 %, respectivement entre 1999 et 2008. La propagation rapide de ces agents pathogènes multirésistants a incité à étudier les facteurs visant à limiter la transmission continue de ces organismes. Les interventions de contrôle des infections, telles que l'isolement par contact des patients infectés, ont été utilisées pour contrôler les flambées d'infections causées par des organismes producteurs de BLSE dans des contextes où les agents pathogènes ont été isolés à partir d'échantillons rectaux et axillaires, ainsi que de sécrétions des voies respiratoires supérieures. Ces quelques rapports soulèvent des inquiétudes quant à la colonisation de patients infectés à des sites autres que le site primaire d'infection. La colonisation en l'absence d'épidémies n'a jusqu'à présent pas été examinée systématiquement, en particulier dans une zone de forte endémicité comme le Liban. La présente étude vise finalement à évaluer l'utilité de placer les patients atteints d'infections BLSE-CE et BLSE-KP en isolement par contact pendant leur séjour à l'hôpital, et si cette pratique limiterait la propagation de ces infections. Il s'agit d'une étude prospective dépistant des patients hospitalisés atteints d'infections ESBL-EC et ESBL-KP pour la colonisation par le même organisme sur des sites autres que le site primaire d'infection par des cultures du rectum, de la peau, du nasopharynx, de l'urine et, le cas échéant, des plaies. Les cas seront identifiés par le laboratoire de microbiologie clinique de l'AUBMC et les sujets de l'étude seront inscrits selon les critères d'inclusion/exclusion. En plus des cultures de plusieurs sites corporels, une analyse moléculaire sera effectuée sur les souches isolées productrices de BLSE pour identifier la parenté clonale. Les cultures seront répétées mensuellement pendant une période de 6 mois. La taille de l'échantillon est estimée à 100 patients sur une période de deux ans. Les résultats de cette étude auront des implications sur les pratiques de contrôle des infections et constitueront un préalable à d'autres études dans le futur.

L'objectif de cette proposition est d'évaluer l'étendue de la colonisation par ESBL-EC et ESBL-KP chez les patients hospitalisés atteints d'infections actives et de concevoir des recommandations en conséquence.

Les objectifs spécifiques comprennent :

1. Identifier les patients hospitalisés atteints d'infections dues à des organismes producteurs de BLSE sur un site primaire

2. Dépistez les patients pour une colonisation par des organismes producteurs de BLSE à des sites corporels autres que le site primaire d'infection par des cultures de :

   • Rectum
   • Peau (aisselles, aine, ombilic)
   • Nasopharynx
   • Urine
   • Blessure (le cas échéant)
3. Effectuer des tests de sensibilité sur tous les isolats collectés pour détecter ESBL-EC et ESBL-KP
4. Effectuer des tests moléculaires sur les pathogènes producteurs de BLSE isolés des sites de colonisation et les comparer aux organismes récupérés du site primaire afin d'identifier la parenté clonale
5. Effectuer des cultures de suivi à partir des sites mentionnés ci-dessus une fois le traitement de l'infection primaire terminé pour déterminer la durée de la colonisation
6. Tirer des conclusions sur l'étendue de la colonisation par des organismes producteurs de BLSE chez les patients hospitalisés atteints d'une primo-infection et évaluer les implications en matière de contrôle des infections (en particulier en ce qui concerne la mise en isolement des patients)