Interaction microbe-intestin dans la colite microscopique et le syndrome du côlon irritable post-infectieux (IBS)

Objectif : Cette étude vise à élucider le lien physiopathologique entre l'environnement dans le côlon (principalement le microbiote), le système immunitaire local et l'activation du système nerveux entérique chez les patients atteints d'IBS post-infectieux (PI-IBS) et de colite microscopique (MC) avec un accent particulier sur les interactions microbiennes-muqueuses et l'évaluation de l'effet sur l'activation/réponse immunitaire ainsi que sur la manière dont la signalisation afférente intestin-cerveau entraîne une gêne abdominale.

Méthode : Le projet est basé sur les données de trois cohortes de patients, l'une avec PI-IBS et l'autre avec MC, ainsi qu'une cohorte d'individus en bonne santé appariés selon le sexe et l'âge. La mesure de la sensibilité perçue dans l'intestin sera évaluée par la réponse à la douleur sous contrainte mécanique à l'aide d'un barostat. La puce HIT (Human intestinal Tissue) sera utilisée pour caractériser la diversité, la stabilité et la fonctionnalité du microbiote intestinal au niveau de la muqueuse, donnant un indice sur les interactions avec l'hôte et un aperçu des changements conduisant au développement des deux maladies. .

L'immunohistochimie et la cytométrie en flux seront utilisées pour analyser la localisation, la fréquence et les caractéristiques phénotypiques des lymphoïdes et des mastocytes. L'analyse fonctionnelle des lymphocytes muqueux activés in vitro par les produits du microbiote intestinal sera examinée par la production de cytokines à l'aide du système LuminexTM. La technique de la chambre d'Ussing permettra d'étudier l'impact du microbiote et de ses métabolites sur les fonctions de barrière intestinale. Dans cette méthode, l'échantillon a accès aux facteurs de stress dans des conditions standard.