Mikrobe-tarm-interaksjon i mikroskopisk kolitt og post-infeksiøs irritabel tarmsyndrom (IBS)

Mål: Denne studien tar sikte på å belyse den patofysiologiske sammenhengen mellom miljøet i tykktarmen (hovedsakelig mikrobiotaen), det lokale immunsystemet og aktivering av det enteriske nervesystemet hos pasienter med post-infeksiøs IBS (PI-IBS) og mikroskopisk kolitt (MC) med spesiell vekt på mikrobiell-slimhinne-interaksjoner og evaluering av effekten på immunaktiveringen/responsen samt hvordan afferent tarm-hjerne-signalering fører til ubehag i magen.

Metode: Prosjektet er basert på data fra tre kohorter av pasienter, en med PI-IBS og en med MC samt en kjønns- og alderstilpasset kohort av friske individer. Måling av opplevd sensitivitet i tarmen vil bli evaluert ved smerte-respons under mekanisk stress ved hjelp av en barostat. HIT (Human intestinal Tissue)-Chip-array vil bli brukt til å karakterisere mangfoldet, stabiliteten og funksjonaliteten til tarmmikrobiotaen på slimhinnenivå, og gi en pekepinn på interaksjonene med verten og innsikt i endringer som fører til utviklingen av de to sykdommene. .

Immunhistokjemi og flowcytometri vil bli brukt til å analysere lokalisering, frekvens og fenotypekarakteristikker til lymfoid- og mastceller. Funksjonell analyse av slimhinnelymfocytter aktivert in vitro av produkter fra tarmmikrobiotaen vil bli undersøkt ved cytokinproduksjon ved bruk av LuminexTM-systemet. Ussing-kammerteknikken vil tillate undersøkelse av virkningen av mikrobiota og dens metabolitter på tarmbarrierefunksjoner. I denne metoden har prøven tilgang til stressfaktorer under standardforhold.