Analyse moléculaire de l'ADN microbien dans la pancréatite nécrosante infectée

Dans cette étude, les patients atteints de pancréatite nécrosante sévère seront suivis de manière prospective tout au long de leur parcours hospitalier (durée d'hospitalisation anticipée comprise entre 4 et 8 semaines). Si les patients sont suspectés d'avoir une infection de nécrose pancréatique, ils seront acceptés pour l'inscription. Les patients seront déterminés par leur médecin traitant comme nécessitant soit une intervention chirurgicale, soit un drainage radiologique guidé de la nécrose pancréatique et du liquide péripancréatique infecté. Au moment de la procédure de drainage ou de l'intervention, un échantillon de liquide péripancréatique sera envoyé au service de microbiologie de l'hôpital pour une coloration de Gram standard et une identification de culture bactérienne et un deuxième échantillon sera congelé pour l'analyse de l'ADN bactérien. Les patients seront suivis pendant toute la durée de leur hospitalisation pour les résultats à l'hôpital, la mortalité et les résultats finaux de la culture microbiologique. Les échantillons seront ensuite traités six mois et un an après le prélèvement des échantillons pour une analyse de séquençage en profondeur de l'ADN bactérien et seront comparés aux bactéries identifiées à l'aide d'une technique de culture standard.