Transplantation définie de microbiote fécal pour la diarrhée à Clostridium difficile

Cette étude recrutera initialement 12 sujets. Sur la base de l'expérience relativement importante avec la FMT rapportée à ce jour, nous prévoyons une réponse rapide et soutenue déterminée par un arrêt de la fièvre, de la leucocytose et de la diarrhée et une perte d'inconfort abdominal chez > 8 (80 %) des sujets. Si une telle réponse n'est pas observée chez > 3 des 6 premiers patients traités, nous réévaluerons la composition du mélange FMT et/ou examinerons si plus d'un inoculum doit être administré. Si le taux de réussite de 80 % ou plus est atteint, le suivi clinique et les études du microbiome se poursuivront pendant 12 mois au total. Pendant ce temps, nous prévoyons d'obtenir de nouvelles approbations pour tester d'autres méthodes d'administration d'inoculum (par exemple, via un tube NG ou une administration orale dans une solution tamponnée). Contrairement à l'utilisation de selles brutes de composition inconnue et variable, l'inoculum est défini et cultivé dans des conditions anaérobies avec des milieux définis. Avant l'administration de la thérapie, l'inoculum sera examiné par souche gram puis sera mis en culture pour s'assurer qu'il contient les organismes qui ont été utilisés. On pense que la possibilité d'un contaminant est très improbable et la contamination par un agent pathogène inconnu pratiquement impossible. Comme mesure de sécurité supplémentaire, l'inoculum est administré dans le tractus gastro-intestinal qui est conçu pour les aliments et autres matériaux non stériles.

Nous prévoyons une réponse rapide et soutenue, déterminée par un arrêt de la fièvre, de la leucocytose et de la diarrhée et une perte de gêne abdominale chez > 8 (80 %) des sujets. Si une telle réponse n'est pas observée chez > 3 des 6 premiers patients traités, nous réévaluerons la composition du mélange FMT et/ou examinerons si plus d'un inoculum doit être administré. Si le taux de réussite de 80 % est atteint, le suivi clinique et les études du microbiome se poursuivront pendant 12 mois au total.

Critère d'intégration:

Seuls les patients VA seront éligibles pour l'étude s'ils ont eu un diagnostic confirmé d'ICD qui a été traité pendant 10 à 14 jours avec les doses recommandées de métronidazole ou de vancomycine et n'a pas répondu, ou a répondu et rechuté dans les 4 semaines suivant la fin du traitement. Le diagnostic sera considéré comme confirmé par la présence d'une diarrhée (>3 selles non formées en 24 heures pendant 2 jours consécutifs) et d'une gêne abdominale. La présence de fièvre, de leucocytose et d'une albumine sérique <3 gm/dL sera enregistrée mais ne sera pas nécessaire au diagnostic. Les patients seront inclus après avoir donné leur consentement éclairé et signé le formulaire de consentement approprié qui a été approuvé par le Baylor IRB.

Procédure : Les patients atteints d'ICD récurrente avérée au MEDVAMC seront invités à participer. Les dossiers médicaux de tous les patients VA saisis seront signalés comme étant inscrits à une étude de recherche. Nous supposons que les souches décrites par Tvede et Rask-Madsen étaient des isolats cliniques car il n'y a aucune trace de ces souches dans des publications ultérieures et elles ne sont disponibles dans aucun des référentiels de souches publics tels que ATCC, DSMZ ou CCUG. Au lieu de ces souches spécifiques, nous utiliserons les souches de type entièrement séquencées suivantes, isolées à l'origine de matières fécales humaines et achetées auprès de l'ATCC : Bacteroides ovatus ATCC 8483, Bacteroides vulgatus ATCC 8482 et Bacteroides thetaiotaomicron ATCC 29148. Les cultures primaires seront cultivées selon les procédures BPL (SOP jointes) sur de la gélose au sang anaérobie pré-réduite ANABA (Remel, Lenexa, KS), puis les cultures en bouillon de chaque souche seront cultivées en anaérobie à 37 °C pendant 48 heures dans une gélose pré-réduite. viande hachée moyenne qui sera faite maison. Les bactéries seront collectées par centrifugation à 1 600 x g pendant 10 minutes et remises en suspension dans 5 ml de solution saline stérile pré-réduite à 0,9 %, en utilisant les normes Macfarlane pour estimer les concentrations bactériennes afin de cibler une concentration finale de 10 à la puissance 8 à 9 cfu/mL. Des aliquotes (0,1 mL) seront prélevées pour une dilution en série, un étalement et une incubation anaérobie à 37 °C sur des plaques ANABA pré-réduites afin de déterminer les concentrations bactériennes réelles. Deux ml de chacune des trois suspensions salines seront combinés avec 194 ml de solution saline stérile pré-réduite à 0,9 % pour former le cocktail d'infusion. La suspension bactérienne de 200 ml sera ensuite administrée dans l'intestin grêle à l'aide d'un gastro-duodénoscope ultra-plat Olympus. La voie de l'intestin grêle est choisie pour éviter les effets potentiellement délétères de l'acide gastrique sur la survie de l'inoculum et pour prévenir ou réduire le reflux du volume administré dans l'estomac. Les sujets seront ensuite suivis jusqu'à 12 mois.

Procédure de transplantation : Les patients seront prétraités avec 4 jours de vancomycine orale (125 mg toutes les 6 h) pour réduire la charge de C. difficile, la dernière dose étant administrée à 18 h 00 le soir avant la procédure (environ 14 à 16 heures avant FMT). Le soir précédant la FMT et de nouveau le matin de la procédure, les patients recevront 20 mg d'oméprazole par voie orale. Le matin de la procédure, un gastroscope "super-mince" de 5,5 mm de diamètre sera passé par la bouche dans l'intestin grêle du patient en essayant de placer la pointe au niveau ou au-delà du ligament de Treitz. Deux cents ml de la suspension bactérienne seront instillés dans l'intestin grêle via un cathéter introduit par le canal de biopsie de l'endoscope et rincés avec 25 ml de solution saline stérile pré-réduite à 0,9 %. Après le retrait de l'endoscope, après récupération, les patients seront autorisés à reprendre une alimentation et des activités physiques normales.

Les sujets seront vus quotidiennement à l'hôpital (et contactés quotidiennement par téléphone après leur sortie) pendant 14 jours. Les sujets seront ensuite contactés à 30 jours et mensuellement pendant 3 mois, puis tous les 3 mois pendant un an. Les symptômes seront enregistrés à chaque contact à l'aide d'un questionnaire standard. Les examens de laboratoire comprenant NFS avec différentiel, panel métabolique de base et albumine seront obtenus à 3 jours, à 10 jours et à 30 plus ou moins 7 jours.

Les résultats des résultats cliniques seront combinés avec l'évaluation de l'effet de la thérapie sur le microbiome fécal. Un échantillon de selles sera prélevé régulièrement jusqu'à 1 an ou jusqu'à une rechute avérée. Des échantillons de selles et des écouvillons rectaux seront prélevés quotidiennement pendant la période initiale de l'étude jusqu'à la sortie de l'hôpital ou 14 jours, puis des échantillons de selles à 30 jours et à 3 mois d'intervalle pendant un an. Après la sortie de l'hôpital, des échantillons seront envoyés au laboratoire à l'aide de compresses froides par Federal Express. Cela devrait nous permettre d'examiner en détail l'effet de la thérapie sur le C. difficile ainsi que sur le devenir des bactéries administrées (dont le génome entier a été séquencé et publié). pour plus de détails, voir les pièces jointes).