Definerad fekal mikrobiotatransplantation för Clostridium Difficile Diarré

Denna studie kommer initialt att registrera 12 ämnen. Baserat på den relativt stora erfarenheten av FMT som hittills rapporterats, förväntar vi oss ett snabbt och ihållande svar som bestäms av ett upphörande av feber, leukocytos och diarré och en förlust av bukbesvär hos >8 (80%) av försökspersonerna. Om ett sådant svar inte observeras hos >3 av de första 6 behandlade patienterna, kommer vi att omvärdera sammansättningen av FMT-blandningen och/eller överväga om mer än ett inokulum ska ges. Om framgångsfrekvensen på 80 % eller mer uppnås kommer klinisk uppföljning och studier av mikrobiomet att fortsätta i totalt 12 månader. Under den tiden skulle vi planera att få nya godkännanden för att testa andra metoder för inokulumtillförsel (t.ex. via NG-rör eller oral administrering i en buffrad lösning). I motsats till användningen av rå avföring av okänd och varierande sammansättning, definieras inokulatet och odlas under anerobiska förhållanden med definierade medier. Före administrering av terapi kommer inokulatet att undersökas med gramstam och sedan odlas för att säkerställa att det innehåller de orgamismer som användes. Risken för en kontaminant anses vara mycket osannolik och kontaminering med en okänd patogen i princip omöjlig. Som en extra säkerhetsåtgärd ges inokulatet in i mag-tarmkanalen som är utformat för mat och andra icke-sterila material.

Vi förväntar oss ett snabbt och ihållande svar, vilket bestäms av ett upphörande av feber, leukocytos och diarré och en förlust av bukbesvär hos >8 (80%) av försökspersonerna. Om ett sådant svar inte observeras hos >3 av de första 6 behandlade patienterna, kommer vi att omvärdera sammansättningen av FMT-blandningen och/eller överväga om mer än ett inokulum ska ges. Om 80 % framgångsfrekvens uppnås kommer klinisk uppföljning och studier av mikrobiomet att fortsätta i totalt 12 månader.

Inklusionskriterier:

Endast VA-patienter kommer att vara berättigade till studien om de har haft en bekräftad diagnos av CDI som har behandlats i 10-14 dagar med rekommenderade doser av metronidazol eller vankomycin och antingen har misslyckats med att svara eller har svarat och återfallit inom 4 veckor efter slutet av behandlingen. Diagnosen kommer att betraktas som bekräftad av förekomsten av diarré (>3 oformad avföring under en 24-timmarsperiod under 2 på varandra följande dagar) och bukbesvär. Förekomst av feber, leukocytos och ett serumalbumin <3 gm/dL kommer att registreras men kommer inte att vara nödvändigt för diagnosen. Patienter kommer att inkluderas efter att de har gett informerat samtycke och undertecknat lämpligt samtyckesformulär som har godkänts av Baylor IRB.

Procedur: Patienter med bevisad återkommande CDI vid MEDVAMC kommer att uppmanas att delta. Hälsojournalerna för alla inmatade VA-patienter kommer att flaggas att de är inskrivna i en forskningsstudie. Vi antar att stammarna som beskrivits av Tvede och Rask-Madsen var kliniska isolat eftersom det inte finns några register över dessa stammar i senare publikationer och de är inte tillgängliga från någon av de offentliga stamförråden som ATCC, DSMZ eller CCUG. I stället för dessa specifika stammar kommer vi att använda följande helt sekvenserade typstammar, ursprungligen isolerade från mänsklig avföring och köpta från ATCC: Bacteroides ovatus ATCC 8483, Bacteroides vulgatus ATCC 8482 och Bacteroides thetaiotaomicron ATCC 29148. Primärkulturer kommer att odlas enligt GLP-procedurer (SOP bifogas) på förreducerad anaerob blodagar ANABA (Remel, Lenexa, KS), sedan kommer buljongkulturer av varje stam att odlas anaerobt vid 37°C under 48 timmar i förreducerad hackat kött medium som kommer att göras i huset. Bakterier kommer att samlas in genom centrifugering vid 1 600 x g i 10 minuter och återsuspenderas i 5 mL steril förreducerad 0,9 % koksaltlösning, med hjälp av Macfarlane-standarder för att uppskatta bakteriekoncentrationer för att rikta en slutkoncentration på 10 till styrkan 8 till 9 cfu/mL. Alikvoter (0,1 mL) kommer att tas bort för serieutspädning och plätering och anaerob inkubation vid 37°C på förreducerade ANABA-plattor för att bestämma faktiska bakteriekoncentrationer. Två ml av var och en av de tre saltlösningssuspensionerna kommer att kombineras med 194 ml steril förreducerad 0,9 % koksaltlösning för att bilda infusionscocktailen. Den 200 ml bakteriella suspensionen kommer sedan att administreras i tunntarmen med hjälp av ett Olympus ultratunna gastroduodenoskop. Tunntarmsvägen är vald för att undvika de potentiellt skadliga effekterna av magsyra på inokulatets överlevnad och för att förhindra eller minska återflöde av den volym som administreras i magen. Ämnen kommer sedan att följas i upp till 12 månader.

Transplantationsförfarande: Patienterna kommer att förbehandlas med 4 dagars oralt vankomycin (125 mg q 6 timmar) för att minska C. difficile-belastningen, med den slutliga dosen som ges kl. 18.00 på kvällen före proceduren (cirka 14-16 timmar före proceduren). FMT). På kvällen före FMT och igen på morgonen för proceduren kommer patienterna att få 20 mg omeprazol genom munnen. På morgonen för proceduren kommer ett "supertunt" gastroskop med en diameter på 5,5 mm att passera per mun i patientens tunntarm med ett försök att placera spetsen vid eller bortom Treitz ligament. Tvåhundra ml av bakteriesuspensionen kommer att instilleras i tunntarmen via en kateter som införs genom endoskopets biopsikanal och spolas med 25 ml steril förreducerad 0,9 % koksaltlösning. Efter avlägsnande av endoskopet, efter återhämtning, kommer patienter att tillåtas att återuppta en normal diet och fysiska aktiviteter.

Försökspersoner kommer att ses dagligen när de är på sjukhuset (och kontaktas dagligen per telefon efter att de skrivits ut) i 14 dagar. Försökspersonerna kommer sedan att kontaktas vid 30 dagar och månadsvis i 3 månader, sedan var tredje månad under ett år. Symtom kommer att registreras vid varje kontakt med hjälp av ett standardformulär. Laboratorieundersökningar inklusive CBC med differentiell, grundläggande metabolisk panel och albumin kommer att erhållas vid 3 dagar, vid 10 dagar och vid 30 plus eller minus 7 dagar.

Resultaten av kliniskt utfall kommer att kombineras med utvärdering av effekten av terapin på fekal mikrobiomet. Avföringsprov kommer att tas regelbundet upp till 1 år eller tills bevisat återfall. Avföringsprover och rektalpinnar kommer att tas dagligen under den inledande studieperioden fram till utskrivning från sjukhuset eller 14 dagar och sedan avföringsprov med 30 dagar och med 3 månaders intervall under ett år. Efter utskrivning från sjukhus kommer prover att skickas till laboratoriet med hjälp av kylförpackningar av Federal Express. Detta bör göra det möjligt för oss att i detalj undersöka effekten av terapin på C. difficile såväl som på ödet för de administrerade bakterierna (för vilka hela genomet har sekvenserats och publicerats). för detaljer se bilagor).