Diagnostic moléculaire et stratification des risques de septicémie (MARS)

Contexte : Le sepsis est une cause majeure de morbidité et de mortalité hospitalières. Les outils actuels à la disposition du clinicien pour initier le traitement des patients atteints de sepsis comprennent principalement des systèmes de classification des symptômes et des techniques de culture, qui fournissent des informations aspécifiques et lentes.

Objectif : Le but ultime de ce programme est d'aider le médecin au chevet du patient à adapter le traitement d'un patient individuel souffrant de septicémie en générant des informations moléculaires rapides sur l'agent pathogène responsable et la réponse de l'hôte.

Produits livrables : tests rapides (« échantillon entrant, résultat sortant ») pouvant être utilisés par le personnel de santé au chevet ou à proximité et fournissant des informations rapides (dans les deux heures) sur la présence ou l'absence d'une septicémie, l'agent pathogène responsable et le risque du patient individuel pour des complications de sepsie et la mort.

Conception : le programme est organisé en quatre modules de travail (WP) le long d'une plate-forme clinique, de découverte et technologique. Dans le WP1, deux hôpitaux universitaires inscriront 7500 patients admis à l'unité de soins intensifs au cours des 3 premières années du projet ; 25 à 40 % de ces patients auront ou développeront une septicémie. Dans le WP2 (Pathogen Detection), le sang prélevé sur ces patients sera utilisé pour développer des tests de chevet rapides et entièrement automatisés basés sur l'ADN qui identifient les micro-organismes et fournissent également des informations sur leur résistance aux antibiotiques. Dans le WP3 (Host Response), l'ARN des cellules sanguines sera analysé pour trouver de nouveaux biomarqueurs et développer des tests rapides et faciles à réaliser qui fournissent des informations sur le profil de risque du patient. De plus, les niveaux plasmatiques de biomarqueurs protéiques sélectionnés seront mesurés pour comparer leur valeur avec celle des signatures moléculaires leucocytaires identifiées. WP4 est responsable de la gestion ICT du projet. La plateforme clinique (couverte par WP1 et WP4) fournit des données de patients et des échantillons biologiques aux plateformes de découverte et de technologie. La plate-forme Discovery (couverte par WP2 et WP3) utilise les données des patients et des échantillons biologiques pour développer des tests de détection de l'agent infectieux responsable de la septicémie et pour la stratification des patients en fonction de leur risque de complications de la septicémie, y compris la mort. Les résultats générés au sein de la plateforme de découverte seront livrés à la plateforme technologique. La plate-forme technologique (qui fait partie des WP2 et WP3) a pour objectif spécifique de développer des tests rapides qui s'exécutent sur une plate-forme (micro)fluidique entièrement automatisée, si facile à utiliser qu'elle peut être utilisée dans des environnements décentralisés tels que (près de) USI. Les essais développés utiliseront les connaissances générées dans la plateforme de découverte.