Molekylær diagnose og risikostratificering af sepsis (MARS)

Baggrund: Sepsis er en væsentlig årsag til sygelighed og mortalitet på hospitalet. De nuværende værktøjer, der er tilgængelige for klinikeren til at påbegynde behandling af patienter med sepsis, består hovedsageligt af symptomklassificeringssystemer og dyrkningsteknikker, som giver uspecifik og langsom information.

Formål: Det ultimative mål med dette program er at hjælpe lægen ved sengekanten med at skræddersy behandlingen af ​​en individuel patient, der lider af sepsis, ved at generere hurtig molekylær information om det forårsagende patogen og værtens respons.

Leverancer: Hurtige tests ("sample-in-result-out"), som kan bruges af sundhedspersonale ved eller tæt på sengen, og som giver hurtig information (inden for to timer) om tilstedeværelse eller fravær af sepsis, det forårsagende patogen og den enkelte patients risiko for sepsiskomplikationer og død.

Design: Programmet er organiseret i fire arbejdspakker (WP'er) langs en klinisk, opdagelses- og teknologiplatform. I WP1 vil to universitetshospitaler indskrive 7500 patienter indlagt på intensivafdelingen i løbet af de første 3 år af projektet; 25 % - 40 % af disse patienter vil have eller vil udvikle sepsis. I WP2 (Pathogen Detection) vil blod opnået fra disse patienter blive brugt til at udvikle hurtige, fuldautomatiske DNA-baserede bedside-tests, der identificerer mikroorganismer og også giver information om deres resistens over for antibiotika. I WP3 (Host Response) vil RNA fra blodceller blive analyseret for at finde nye biomarkører og for at udvikle hurtige og nemme at udføre test, der giver information om patientens risikoprofil. Derudover vil plasmaniveauer af udvalgte proteinbiomarkører blive målt for sammenligning af deres værdi med værdien af ​​de identificerede leukocytmolekylære signaturer. WP4 er ansvarlig for IKT-ledelsen af ​​projektet. Den kliniske platform (dækket af WP1 og WP4) leverer patientdata og biologiske prøver til opdagelses- og teknologiplatformene. Discovery Platform (dækket af WP2 og WP3) bruger patientdata og biologiske prøver til at udvikle tests til påvisning af det infektiøse agens, der forårsager sepsis, og til stratificering af patienter i henhold til deres risiko for sepsiskomplikationer, herunder død. Resultaterne genereret inden for opdagelsesplatformen vil blive leveret til teknologiplatformen. Teknologiplatformen (en del af WP2 og WP3) har det specifikke mål at udvikle hurtige analyser, der kører på en fuldautomatisk (mikro)fluidikplatform, der er så nem at betjene, at den kan bruges i decentrale indstillinger som (tæt på) ICU. De udviklede assays vil gøre brug af den viden, der genereres i opdagelsesplatformen.