Molekylær diagnose og risikostratifisering av sepsis (MARS)

Bakgrunn: Sepsis er en viktig årsak til sykelighet og dødelighet på sykehus. Nåværende verktøy tilgjengelig for klinikeren for å starte behandling av pasienter med sepsis består hovedsakelig av symptomklassifiseringssystemer og kulturteknikker, som gir uspesifikk og langsom informasjon.

Mål: Det endelige målet med dette programmet er å hjelpe legen ved sengen med å skreddersy behandlingen av en individuell pasient som lider av sepsis ved å generere rask molekylær informasjon om det forårsakende patogenet og vertens respons.

Leveranser: Hurtigtester ("prøve-i-resultat-ut") som kan brukes av helsepersonell ved eller nær sengekanten og som gir rask informasjon (innen to timer) om tilstedeværelse eller fravær av sepsis, det forårsakende patogenet. og risikoen for den enkelte pasient for sepsiskomplikasjoner og død.

Design: Programmet er organisert i fire arbeidspakker (WPs) langs en klinisk, oppdagelses- og teknologiplattform. I WP1 vil to universitetssykehus registrere 7500 pasienter innlagt på intensivavdelingen i løpet av de første 3 årene av prosjektet; 25 % - 40 % av disse pasientene vil ha eller vil utvikle sepsis. I WP2 (Pathogen Detection) vil blod innhentet fra disse pasientene bli brukt til å utvikle raske, helautomatiske DNA-baserte nattbordstester som identifiserer mikroorganismer og også gir informasjon om deres resistens mot antibiotika. I WP3 (Host Response) vil RNA fra blodceller bli analysert for å finne nye biomarkører og for å utvikle raske og enkle å utføre tester som gir informasjon om risikoprofilen til pasienten. I tillegg vil plasmanivåer av utvalgte proteinbiomarkører bli målt for sammenligning av deres verdi med verdien til de identifiserte leukocyttmolekylære signaturene. WP4 er ansvarlig for IKT-ledelsen av prosjektet. Den kliniske plattformen (dekket av WP1 og WP4) leverer pasientdata og biologiske prøver til oppdagelses- og teknologiplattformene. Discovery Platform (dekket av WP2 og WP3) bruker pasientdata og biologiske prøver for å utvikle tester for påvisning av smittestoffet som forårsaker sepsis og for stratifisering av pasienter i henhold til deres risiko for sepsiskomplikasjoner, inkludert død. Resultatene generert innenfor oppdagelsesplattformen vil bli levert til teknologiplattformen. Teknologiplattformen (del av WP2 og WP3) har det spesifikke målet å utvikle raske analyser som kjører på en helautomatisert (mikro)fluidikkplattform som er så enkel å betjene at den kan brukes i desentraliserte innstillinger som (nær) ICU. De utviklede analysene vil gjøre bruk av kunnskapen generert i oppdagelsesplattformen.