Diagnosi molecolare e stratificazione del rischio di sepsi (MARS)

Contesto: la sepsi è una delle principali cause di morbilità e mortalità intraospedaliera. Gli attuali strumenti a disposizione del clinico per iniziare la terapia dei pazienti con sepsi comprendono principalmente sistemi di classificazione dei sintomi e tecniche di coltura, che forniscono informazioni aspecifiche e lente.

Obiettivo: L'obiettivo finale di questo programma è assistere il medico al capezzale nel personalizzare il trattamento di un singolo paziente affetto da sepsi generando informazioni molecolari rapide sul patogeno causativo e sulla risposta dell'ospite.

Risultati: test rapidi ("sample-in-result-out") che possono essere utilizzati dal personale sanitario presso o vicino al letto del paziente e che forniscono informazioni rapide (entro due ore) sulla presenza o assenza di sepsi, l'agente patogeno causale e il rischio del singolo paziente per complicazioni di sepsi e morte.

Design: il programma è organizzato in quattro pacchetti di lavoro (WP) lungo una piattaforma clinica, scoperta e tecnologica. Nel WP1 due ospedali universitari arruoleranno 7500 pazienti ricoverati in Terapia Intensiva durante i primi 3 anni del progetto; Il 25% - 40% di questi pazienti avrà o svilupperà la sepsi. Nel WP2 (Pathogen Detection), il sangue ottenuto da questi pazienti verrà utilizzato per sviluppare test rapidi e completamente automatizzati basati sul DNA che identificano i microrganismi e forniscono anche informazioni sulla loro resistenza agli antibiotici. Nel WP3 (Host Response), l'RNA delle cellule del sangue sarà analizzato per trovare nuovi biomarcatori e sviluppare test rapidi e facili da eseguire che forniscano informazioni sul profilo di rischio del paziente. Inoltre, verranno misurati i livelli plasmatici di biomarcatori proteici selezionati per il confronto del loro valore con quello delle firme molecolari dei leucociti identificate. Il WP4 ​​è responsabile della gestione ICT del progetto. La piattaforma clinica (coperta da WP1 e WP4) fornisce dati dei pazienti e campioni biologici alle piattaforme di scoperta e tecnologia. La Discovery Platform (coperta da WP2 e WP3) utilizza i dati dei pazienti e campioni biologici per sviluppare test per il rilevamento dell'agente infettivo che causa la sepsi e per la stratificazione dei pazienti in base al loro rischio di complicanze della sepsi, inclusa la morte. I risultati generati all'interno della piattaforma di scoperta verranno consegnati alla piattaforma tecnologica. La piattaforma tecnologica (parte di WP2 e WP3) ha l'obiettivo specifico di sviluppare saggi rapidi che funzionano su una piattaforma di (micro)fluidica completamente automatizzata che è così facile da usare da poter essere utilizzata in contesti decentralizzati come (vicino a) il terapia intensiva. I test sviluppati utilizzeranno la conoscenza generata nella piattaforma di scoperta.