Diagnoza molekularna i stratyfikacja ryzyka sepsy (MARS)

Wstęp: Sepsa jest główną przyczyną zachorowalności i śmiertelności wewnątrzszpitalnej. Obecne narzędzia dostępne klinicyście do rozpoczęcia terapii pacjentów z sepsą obejmują głównie systemy klasyfikacji objawów i techniki hodowli, które dostarczają niespecyficznych i powolnych informacji.

Cel: Ostatecznym celem tego programu jest pomoc lekarzowi przy łóżku pacjenta w dostosowaniu leczenia indywidualnego pacjenta cierpiącego na posocznicę poprzez szybkie wygenerowanie informacji molekularnych na temat patogenu sprawczego i odpowiedzi gospodarza.

Rezultaty: Szybkie testy („próbka-w-wyniku”), które mogą być stosowane przez personel medyczny przy łóżku pacjenta lub w jego pobliżu i które dostarczają szybkich informacji (w ciągu dwóch godzin) na temat obecności lub braku posocznicy, patogenu sprawczego oraz ryzyko powikłań posocznicy i zgonu u danego pacjenta.

Projekt: Program jest podzielony na cztery pakiety robocze (WP) wzdłuż platformy klinicznej, odkrywczej i technologicznej. W WP1 dwa szpitale uniwersyteckie przyjmą 7500 pacjentów przyjętych na Oddział Intensywnej Terapii w ciągu pierwszych 3 lat projektu; 25% - 40% tych pacjentów będzie miało lub rozwinie się posocznica. W WP2 (Pathogen Detection) krew pobrana od tych pacjentów zostanie wykorzystana do opracowania szybkich, w pełni zautomatyzowanych testów przyłóżkowych opartych na DNA, które identyfikują mikroorganizmy, a także dostarczają informacji o ich oporności na antybiotyki. W ramach WP3 (Host Response) RNA z komórek krwi zostanie przeanalizowane w celu znalezienia nowych biomarkerów oraz opracowania szybkich i łatwych do wykonania testów, które dostarczą informacji o profilu ryzyka pacjenta. Ponadto zostaną zmierzone poziomy wybranych biomarkerów białkowych w osoczu w celu porównania ich wartości ze zidentyfikowanymi sygnaturami molekularnymi leukocytów. WP4 odpowiada za zarządzanie projektem ICT. Platforma kliniczna (objęta zakresem WP1 i WP4) dostarcza dane pacjentów i próbki biologiczne do platform odkrywczych i technologicznych. Platforma Discovery (objęta pakietami WP2 i WP3) wykorzystuje dane pacjentów i próbki biologiczne do opracowywania testów do wykrywania czynnika zakaźnego powodującego posocznicę oraz do stratyfikacji pacjentów zgodnie z ryzykiem powikłań posocznicy, w tym śmierci. Wyniki wygenerowane w ramach platformy Discovery zostaną dostarczone do platformy technologicznej. Platforma technologiczna (część WP2 i WP3) ma szczególny cel, jakim jest opracowanie szybkich testów, które działają na w pełni zautomatyzowanej platformie (mikro)fluidycznej, która jest tak łatwa w obsłudze, że może być używana w zdecentralizowanych warunkach, takich jak (blisko) OIOM. Opracowane testy będą wykorzystywać wiedzę wygenerowaną na platformie odkrywczej.