Moleculaire diagnose en risicostratificatie van sepsis (MARS)

Achtergrond: Sepsis is een belangrijke oorzaak van morbiditeit en mortaliteit in het ziekenhuis. De huidige hulpmiddelen waarover de clinicus beschikt om de therapie van patiënten met sepsis te initiëren, bestaan ​​voornamelijk uit symptoomclassificatiesystemen en kweektechnieken, die aspecifieke en trage informatie verschaffen.

Doel: Het uiteindelijke doel van dit programma is om de arts aan het bed te helpen bij het afstemmen van de behandeling van een individuele patiënt die aan sepsis lijdt door snelle moleculaire informatie te genereren over de veroorzakende ziekteverwekker en de reactie van de gastheer.

Deliverables: Sneltesten ("sample-in-result-out") die kunnen worden gebruikt door zorgpersoneel aan of dicht bij het bed en die snel (binnen twee uur) informatie geven over de aan- of afwezigheid van sepsis, de veroorzakende ziekteverwekker en het risico van de individuele patiënt op sepsiscomplicaties en overlijden.

Ontwerp: het programma is georganiseerd in vier werkpakketten (WP's) langs een klinisch, ontdekkings- en technologieplatform. In WP1 zullen twee universitaire ziekenhuizen gedurende de eerste 3 jaar van het project 7500 patiënten opnemen die op de Intensive Care worden opgenomen; 25% - 40% van deze patiënten zal sepsis hebben of ontwikkelen. In WP2 (Pathogen Detection) zal het bloed van deze patiënten worden gebruikt om snelle, volledig geautomatiseerde DNA-gebaseerde tests aan het bed te ontwikkelen die micro-organismen identificeren en ook informatie geven over hun resistentie tegen antibiotica. In WP3 (Host Response) zal RNA uit bloedcellen worden geanalyseerd om nieuwe biomarkers te vinden en om snelle en eenvoudig uit te voeren tests te ontwikkelen die informatie geven over het risicoprofiel van de patiënt. Bovendien zullen plasmaniveaus van geselecteerde eiwitbiomarkers worden gemeten om hun waarde te vergelijken met die van de geïdentificeerde moleculaire handtekeningen van leukocyten. WP4 is verantwoordelijk voor het ICT-beheer van het project. Het klinische platform (gedekt door WP1 en WP4) levert patiëntgegevens en biologische monsters aan de ontdekkings- en technologieplatforms. Het Discovery Platform (gedekt door WP2 en WP3) gebruikt patiëntgegevens en biologische monsters om tests te ontwikkelen voor de detectie van het infectieuze agens dat sepsis veroorzaakt en voor stratificatie van patiënten op basis van hun risico op sepsiscomplicaties, waaronder overlijden. De resultaten die binnen het ontdekkingsplatform worden gegenereerd, worden geleverd aan het technologieplatform. Het Technology Platform (onderdeel van WP2 en WP3) heeft specifiek als doel om snelle assays te ontwikkelen die draaien op een volledig geautomatiseerd (micro)fluidics platform dat zo eenvoudig te bedienen is dat het gebruikt kan worden in decentrale omgevingen zoals (nabij) de IC. De ontwikkelde testen zullen gebruik maken van de kennis die wordt gegenereerd in het ontdekkingsplatform.