Molekylär diagnos och riskstratifiering av sepsis (MARS)

Bakgrund: Sepsis är en viktig orsak till sjuklighet och mortalitet på sjukhus. Aktuella verktyg som är tillgängliga för läkaren för att initiera behandling av patienter med sepsis består huvudsakligen av symtomklassificeringssystem och odlingstekniker, som ger ospecifik och långsam information.

Mål: Det slutliga målet med detta program är att hjälpa läkaren vid sängen att skräddarsy behandlingen av en enskild patient som lider av sepsis genom att generera snabb molekylär information om den orsakande patogenen och värdsvaret.

Leveranser: Snabbtester ("prov-i-resultat-ut") som kan användas av sjukvårdspersonal vid eller nära sängkanten och som ger snabb information (inom två timmar) om förekomst eller frånvaro av sepsis, den orsakande patogenen och risken för den enskilda patienten för sepsiskomplikationer och död.

Design: Programmet är organiserat i fyra arbetspaket (WP) längs en klinisk, upptäckts- och teknologiplattform. I WP1 kommer två universitetssjukhus att registrera 7500 patienter som tagits in på intensivvårdsavdelningen under projektets tre första år; 25 % - 40 % av dessa patienter kommer att ha eller kommer att utveckla sepsis. I WP2 (Pathogen Detection) kommer blod som erhållits från dessa patienter att användas för att utveckla snabba, helautomatiska DNA-baserade sängkantstester som identifierar mikroorganismer och även ger information om deras resistens mot antibiotika. I WP3 (Host Response) kommer RNA från blodkroppar att analyseras för att hitta nya biomarkörer och för att utveckla snabba och lätta att utföra tester som ger information om patientens riskprofil. Dessutom kommer plasmanivåer av utvalda proteinbiomarkörer att mätas för jämförelse av deras värde med värdet av de identifierade leukocytmolekylära signaturerna. WP4 ansvarar för IKT-förvaltningen av projektet. Den kliniska plattformen (som täcks av WP1 och WP4) levererar patientdata och biologiska prover till upptäckts- och teknologiplattformarna. Discovery Platform (som täcks av WP2 och WP3) använder patientdata och biologiska prover för att utveckla tester för upptäckt av det smittämne som orsakar sepsis och för stratifiering av patienter enligt deras risk för sepsiskomplikationer, inklusive dödsfall. Resultaten som genereras inom upptäcktsplattformen kommer att levereras till teknologiplattformen. Teknikplattformen (en del av WP2 och WP3) har det specifika syftet att utveckla snabba analyser som körs på en helautomatiserad (mikro)fluidikplattform som är så enkel att använda att den kan användas i decentraliserade miljöer som (nära) ICU. De utvecklade analyserna kommer att använda den kunskap som genereras i upptäcktsplattformen.