Prévalence du transport digestif des intégrons (APIHA)

La lutte contre la résistance bactérienne aux antimicrobiens repose sur trois mesures principales :

• hygiène individuelle et collective.
• bonnes pratiques en matière d'antibiotiques, ce qui pourrait aider à réduire la pression sélective des antibiotiques.
• une meilleure compréhension des mécanismes de résistance bactérienne et du transfert de gènes de résistance entre bactéries.

Les intégrons, systèmes de capture et d'expression de gènes, sont reconnus comme des acteurs majeurs du transfert de gènes de résistance, qui représentent la majeure partie de l'émergence et de la dissémination de la résistance. Les intégrons sont généralement décrits dans les bactéries Gram négatives, isolées chez l'homme, les milieux environnementaux et les animaux. Ils codent des résistances à presque toutes les classes d'antimicrobiens. Un lien fort entre les intégrons et la résistance à plusieurs composés antibiotiques a été décrit et la détection des intégrons est un indicateur pertinent de la résistance à plusieurs antibiotiques.

Le projet des investigateurs propose d'étudier l'impact des antibiotiques sur la fréquence du portage intestinal d'intégrons en région Limousin et les communautés génétiques entre les deux groupes.

Cette étude utilisera une technique innovante de PCR en temps réel pour détecter les intégrons directement dans l'échantillon sans utiliser les techniques traditionnelles basées sur la culture. Les chercheurs espèrent détecter de nouveaux porteurs d'intégrons, notamment des patients dont les intégrons sont portés par des bactéries non ou mal cultivables. Des prélèvements de selles seront effectués sur deux groupes de sujets : 246 patients en réanimation sous haute pression sélective antibiotique, contre 246 individus sains représentatifs de la collectivité, sous pression sélective plus habituelle. Dans les deux groupes, la consommation d'antibiotiques sera entièrement documentée.